• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2009 年度 実績報告書

生体内代謝産物をモニターする転写制御機構の構造基盤

研究課題

研究課題/領域番号 18GS0316
研究機関大阪大学

研究代表者

森川 耿右  大阪大学, 蛋白質研究所, 特任研究員(客員教授) (80012665)

研究分担者 木村 圭志  筑波大学, 生命環境学研究科, 准教授 (50332268)
楯 真一  広島大学, 理学研究科, 教授 (20216998)
白木 琢磨  東北大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (10311747)
大山 拓次  大阪大学, 蛋白質研究所, 特任研究員 (60423133)
キーワード脂肪酸 / 転写制御 / 核内受容体
研究概要

本研究では核内受容体を介した生体恒常性維持機構の研究を進めており、今年度は下記の通りの成果を得た。
X線結晶構造および生化学的解析により、新規内在性リガンドとしてセロトニン代謝産物を同定した。また、脂肪酸/セロトニン代謝リガンドが、協調的に核内受容体を活性化する構造基盤も明らかとした。さらに、より正確な代謝リガンド認識・活性化機構を解明すべく、全長タンパク質を用いた複合体構造解析も進めた。
PPARγによる転写調節にはリガンド結合ドメインに加えAF-1と呼ばれる領域が重要である。実際、肥満の家系においてこの領域のアミノ酸に点変異(P85Q)が報告されているが、変異により影響を受けるタンパク質相互作用は不明であった。我々はプロリンイソメラーゼPinlがS84がリン酸化されたAF-1を特異的に認識し、PPARγのポリユビキチン化を抑制することで活性調節を行うことを発見した。また、ヒト肥満の家系で見つかっているP85Q変異はPinlとの相互作用を阻害する事を示した。
前立腺癌細胞の増殖は、estregen receptor β(ERβ)及びKLF5(Kruppel-like transcription factor 5)により制御されていることを見出した。さらに,ERβがKLF5に結合し,KLF5上にCBPをリクルートすることによりその転写活性を増加させること、またERβのリガンドによりKLF5の転写活性が制御されることを見出した。
PPARγLBDのアゴニスト(GW1929)結合状態の主鎖のNMRシグナル帰属を完了し,コアクティベーターSRC-1の結合部位との相互作用解析を行った.AF-2領域近傍に大きく化学シフト変化が観測される一方で,H3ヘリックス近傍にも小さな化学シフト変化が観測された。結晶構造から期待されるよりも化学シフト変化が及ぶ領域が広範囲にわたっており,2次的なコアクティベーター結合部位の存在あるいはLBDの構造変化の可能性がある。LBDの構造変化をDIORITE法により解析するために必要な配向条件下でのPPARγのTROSYスペクトルの取得に成功し構造解析を開始した。PDJ2を含む複数のアゴニスト化合物との複合体のNMRスペクトル取得に成功した。

  • 研究成果

    (46件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 13件) 学会発表 (32件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Proline cis/trans-isomerase Pin1 regulates peroxisome proliferator-activated receptor gamma activity through the direct binding to the activation function-1 domain2010

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, Y., Shiraki, T., Horiuchi, Y., Waku, T., Shigenaga, A., Otaka, A., Ikura, T., Igarashi, K., Aimoto, S., Tate, S., Morikawa, K.
    • 雑誌名

      J Biol Chem 285(5)

      ページ: 3126-3132

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Coupling effects of distal loops on structural stability and enzymatic activity of Escherichia coli dihydrofolate reductase revealed by deletion mutants2010

    • 著者名/発表者名
      Horiuchi, Y., Ohmae, E., Tate, S., Gekko, K
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta 1804

      ページ: 846-855

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cloning and Characterization of Dihydrofolate Reductases from Deep-Sea Bacteria2010

    • 著者名/発表者名
      Murakami, C., Ohmae, E., Tate, S., Gekko, K., Nakasako, K., Kato, C.
    • 雑誌名

      J.Biochem.(Tokyo) (In press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Estrogen inhibits TGF-{beta}signaling by promoting Smad2/3 degradation2010

    • 著者名/発表者名
      Ito I, Hanyu A, Wayama M, Goto N, Katsuno Y, Kawasaki S, Nakajima Y, Kajiro M, Komatsu Y, Fujimura A, Hirota R, Murayama A, Kimura K, Imamura T, Yanagisawa J.
    • 雑誌名

      The Journal of biological chemistry (In press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural determinant for switching between the polymerase and exonuclease modes in the PCNA-replicative DNA polymerase complex2009

    • 著者名/発表者名
      Nishida, H., Mayanagi, K., Kiyonari, S., Sato, Y., Oyama, T., Ishino, Y., Morikawa, K.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA. 106(49)

      ページ: 20693-20698

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of antibody affinity and antigen valence on molecular forms of immune complexes2009

    • 著者名/発表者名
      Oda, M., Uchiyama, S., Noda, M., Nishi, Y., Koga, M., Mayanagi, K., Robinson, C.V., Fukui, K., Kobayashi, Y., Morikawa, K., Azuma, T.
    • 雑誌名

      Mol Immunol 47

      ページ: 357-364

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phosphorylated intrinsically disordered region of FACT masks itsnucleosomal DNA binding elements2009

    • 著者名/発表者名
      Tsunaka, Y., Toga, J., Yamaguchi, H., Tate, S., Hirose, S., Morikawa K.
    • 雑誌名

      J Biol Chem 284

      ページ: 24610-24621

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Adaptability and selectivity of the human peroxisome profilerator-activated receptor(PPAR)pan agonists revealed from crystal structures2009

    • 著者名/発表者名
      Oyama, T., Toyota, K., Waku, T., Hirakawa, Y., Nagasawa, N., Kasuga, J., Hashimoto, Y., Miyachi, H., Morikawa, K.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 65

      ページ: 786-795

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structures of the Arabidopsis thaliana proliferating cell nuclear antigen 1 and 2 proteins complexed with the human p21 C-terminal segment2009

    • 著者名/発表者名
      Strzalka, W., Oyama, T., Tori, K., Morikawa, K.
    • 雑誌名

      Protein Sci 18

      ページ: 1072-1080

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Design and Synthesis of Peroxisome Proliferator-activated Receptor(PPAR)Delta Agonists and Its Implication to the Driving Force to Elicit PPAR Delta Selectivity2009

    • 著者名/発表者名
      Kasuga, J., Oyama, T., Nakagome, I., Aoyama, A., Sako, K., Makishima, M., Hirono, S., Morikawa, K., Hashimoto, Y., Miyachi, H.
    • 雑誌名

      Yakugaku Zasshi 129

      ページ: 709-718

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The chromosomal association of condensin II is regulated by a noncatalytic function of PP2A2009

    • 著者名/発表者名
      Takemoto A, Maeshima K, Ikehara T, Yamaguchi K, Murayama A, Imamura S, Imamoto N, Yokoyama S, Hirano T, Watanabe Y, Hanaoka F, Yanagisawa J, Kimura K.
    • 雑誌名

      Nature Structural & Molecular Biology 16

      ページ: 1302-1308

    • 査読あり
  • [雑誌論文] KLF4 suppresses estrogen-dependent breast cancer growth by inhibiting the transcriptional activity of ERα.2009

    • 著者名/発表者名
      Akaogi K, Nakajima Y, Ito I, Kawasaki S, Oie S, Murayama A, Kimura K, Yanagisawa J.
    • 雑誌名

      Oncogene 28

      ページ: 2894-2902

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The ubiquitin ligase CHIP acts as an upstream regulator of oncogenic pathways2009

    • 著者名/発表者名
      Kajiro M, Hirota R, Nakajima Y, Kawanowa K, So-ma K, Ito I, Yamaguchi Y, Ohie S, Kobayashi Y, Seino Y, Kawano M, Kawabe YI, Takei H, Hayashi S, Kurosumi M, Murayama A, Kimura K, Yanagisawa J.
    • 雑誌名

      Nature Cell Biol 11

      ページ: 312-319

    • 査読あり
  • [学会発表] PP2A non-catalytically localizes condensin II to mitotic chromosomes2010

    • 著者名/発表者名
      木村圭志
    • 学会等名
      生理学研究所研究会
    • 発表場所
      生理学研究所(愛知県)
    • 年月日
      2010-03-10
  • [学会発表] NMRによる蛋白質の構造揺らぎと機能制御相関の観測2010

    • 著者名/発表者名
      楯真一
    • 学会等名
      新学術領域研究シンポジウム「蛋白質の基質結合や構造変化における分子揺らぎの意義を討論する会」
    • 発表場所
      東北大学(仙台)
    • 年月日
      2010-03-04
  • [学会発表] Phosphorylated intrinsically disordered region of FACT masks its nucleosomal DNA binding elements2010

    • 著者名/発表者名
      津中康央、楯真一、広瀬進、森川耿右
    • 学会等名
      Korea-Japan Chromatin & Epigenetics Joint Symposium 2010
    • 発表場所
      Hyundai sungwoo resort, Hoengseong Gun(韓国)
    • 年月日
      2010-01-21
  • [学会発表] 高速AFMによる出芽酵母コヒーシン複合体の溶液動態解析2010

    • 著者名/発表者名
      西野達哉、宮城篤、安藤敏夫、森川耿右、Kim Nasmyth
    • 学会等名
      第27回染色体ワークショップ
    • 発表場所
      御殿場高原時之栖(静岡)
    • 年月日
      2010-01-21
  • [学会発表] Structural basis for the activation of the nuclear receptor, PPARgamma, by fatty acid-and serotonin metabolites2010

    • 著者名/発表者名
      和久剛、白木琢磨、大山拓次、森川耿右
    • 学会等名
      Korea-Japan Chromatin & Epigenetics Joint Symposium 2010
    • 発表場所
      Hyundai sungwoo resort, Hoengseong Gun(韓国)
    • 年月日
      2010-01-21
  • [学会発表] PP2AによるコンデンシンIIの染色体局在制御2010

    • 著者名/発表者名
      竹本愛, 前島一博, 池原強, 山口量光, 花岡文雄, 柳澤純, 木村圭志
    • 学会等名
      第27回染色体ワークショップ
    • 発表場所
      御殿場高原時之栖(静岡)
    • 年月日
      2010-01-20
  • [学会発表] Proline cis/trans isomerase Pin1 regulates nuclear receptor PPARg activity through the direct binding to the AF-1 domain2010

    • 著者名/発表者名
      白木琢磨、楯真一、森川耿右、五十嵐和彦
    • 学会等名
      転写情報DECODE・冬のワークショップ2009
    • 発表場所
      湯沢グランドホテル(新潟)
    • 年月日
      2010-01-19
  • [学会発表] Functional analysis of nuclolar proteins, WDR3 and PES12010

    • 著者名/発表者名
      藤村亜紀子, 熊沢拓也, 村山明子, 西村和帆, 木村圭志, 柳澤純
    • 学会等名
      DECODE Winter Workshop 2010
    • 発表場所
      Yuzawa Grand Hotel(Niigata)
    • 年月日
      2010-01-18
  • [学会発表] Regulation of cell growth by NOL1/NOP2/Sun domein family, member 1(NOL1)2010

    • 著者名/発表者名
      熊沢拓也, 村山明子, 藤村唖紀子, 西村和帆, 木村圭志, 柳澤純
    • 学会等名
      DECODE Winter Workshop 2010
    • 発表場所
      Yuzawa Grand Hotel(Niigata)
    • 年月日
      2010-01-18
  • [学会発表] High-speed AFM analysis of protein domain architecture2009

    • 著者名/発表者名
      宮城篤、津中康央、内橋貴之、真柳浩太、広瀬進、森川耿右
    • 学会等名
      International Symposium Watching Biomolecules in Action 2009
    • 発表場所
      Senri Life Science Center(Osaka)
    • 年月日
      2009-12-17
  • [学会発表] Solution dynamics analysis of budding yeast cohesin complex by fast scanning AFM2009

    • 著者名/発表者名
      西野達哉、宮城篤、安藤敏夫、森川秋右、Kim Nasmyth
    • 学会等名
      International Symposium Watching Biomolecules in Action 2009
    • 発表場所
      Senri Life Science Center(Osaka)
    • 年月日
      2009-12-15
  • [学会発表] 高速AFMによる出芽酵母コヒーシン複合体の溶液動態解析2009

    • 著者名/発表者名
      西野達哉、宮城篤、安藤敏夫、森川耿右、Kim Nasmyth
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2009-12-12
  • [学会発表] 核小体因子 WD repeat domain3(WDR3)の機能解析2009

    • 著者名/発表者名
      藤村亜紀子, 村山明子, 熊沢拓也, 西村和帆, 木村圭志, 柳澤純
    • 学会等名
      BMB2009(第32回日本分子生物学会年会)
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2009-12-12
  • [学会発表] 核小体因子NOL1/NOP2/Sun domain family, member 1(NOL1)の細胞増殖制御のメカニズム2009

    • 著者名/発表者名
      熊沢拓也, 村山明子, 藤村亜紀子, 西村和帆, 木村圭志, 柳澤純
    • 学会等名
      BMB2009(第32回日本分子生物学会年会)
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2009-12-12
  • [学会発表] クロマチンリモデリング因子FACT天然変性領域のリン酸化によるヌクレオソームDNA結合阻害の分子機構2009

    • 著者名/発表者名
      津中康央、楯真一、広瀬進、森川耿右
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2009-12-11
  • [学会発表] ヒト由来PPARαと蛍光性アゴニストとの複合体の構造2009

    • 著者名/発表者名
      大山拓次、長沢奈央子、宮地弘幸、森川耿右
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2009-12-09
  • [学会発表] PP2AによるコンデンシンIIの局在制御2009

    • 著者名/発表者名
      竹本愛, 前島一博, 池原強, 花岡文雄, 柳澤純, 木村圭志
    • 学会等名
      BMB2009(第32回日本分子生物学会年会)
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2009-12-09
  • [学会発表] 間期におけるコンデンシンの機能解析2009

    • 著者名/発表者名
      山口量光, 竹本愛, 柳澤純, 木村圭志
    • 学会等名
      BMB2009(第32回日本分子生物学会年会)
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2009-12-09
  • [学会発表] Ligand-induced protein structural changed revealed by orientation induced TROSY shift changes2009

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Tate
    • 学会等名
      第48回NMR討論会
    • 発表場所
      九州大学医学部百年講堂
    • 年月日
      2009-11-11
  • [学会発表] NMRによるヌクレオソームシャペロンタンパク質HMGB2のドメイン相対配向解析2009

    • 著者名/発表者名
      上脇準一, 森内寛, 楯直子, 楯真一
    • 学会等名
      第48回NMR討論会
    • 発表場所
      九州大学医学部百年講堂
    • 年月日
      2009-11-10
  • [学会発表] DIORITE法を用いた高分子量タンパク質のドメイン相対配向解析2009

    • 著者名/発表者名
      岸本浩一, 田中利好, 河野俊之, 楯真一
    • 学会等名
      第48回NMR討論会
    • 発表場所
      九州大学医学部百年講堂
    • 年月日
      2009-11-10
  • [学会発表] NMRによるヌクレオソームシャペロンタンパク質HMGB2のドメイン相対配向解析2009

    • 著者名/発表者名
      上脇準一, 森内寛, 楯直子, 楯真一
    • 学会等名
      2009年度日本化学会西日本大会
    • 発表場所
      愛媛大学城北キャンパス
    • 年月日
      2009-11-08
  • [学会発表] Protein structural dynamics and function relationships revealed by NMR spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Tate
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会
    • 発表場所
      徳島文理大学
    • 年月日
      2009-10-31
  • [学会発表] HMGB2タンパク質に含まれる2つのドメインの溶液中における相対配向の決定2009

    • 著者名/発表者名
      上脇準一, 森内寛, 楯直子, 楯真一
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      神戸ボートアイランド
    • 年月日
      2009-10-29
  • [学会発表] ヘム関連代謝物による核内受容体PPARgの活性制御2009

    • 著者名/発表者名
      白木琢磨、森川耿右、五十嵐和彦
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2009-10-22
  • [学会発表] 蛋白質のID領域の高速AFMによる動的可視化2009

    • 著者名/発表者名
      安藤敏夫、宮城篤、津中康央、内橋貴之、真柳浩太、広瀬進、森川耿右
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2009-10-21
  • [学会発表] 酸化LDL受容体蛋白質LOX-1の構造機能特性と本来の役割2009

    • 著者名/発表者名
      楯真一
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      神戸ボートアイラシド
    • 年月日
      2009-10-21
  • [学会発表] NMRを用いたKcsAイオンチャネル開閉に伴う分子形態変化観測-試料調製の最適化とNMRスペクトル解析2009

    • 著者名/発表者名
      網田宏一, 楯真一
    • 学会等名
      特定領域シンホジウム「イオンチャネルの構造ダイナミクスII」
    • 発表場所
      越前町生涯学習センター越前分館(福井)
    • 年月日
      2009-08-31
  • [学会発表] NMRによる高分子量タンパク質分子形態変化観測技術-新たなタンパク質立体構造情報利用技術の開発に向けて2009

    • 著者名/発表者名
      楯真一
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー「実験と計算機科学で解明する蛋白質機能構造」
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所
    • 年月日
      2009-07-31
  • [学会発表] 高速AFMによる蛋白質天然変性領域の観察2009

    • 著者名/発表者名
      宮城篤、津中康央、内橋貴之、真柳浩太、広瀬進、西野達也、安藤敏夫、森川耿右
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ(熊本)
    • 年月日
      2009-05-22
  • [学会発表] クロマチンリモデリング因子FACT天然変性領域のリン酸化によるヌクレオソームDNA結合阻害の分子機構2009

    • 著者名/発表者名
      津中康央、栂純子、山口寛人、楯真一、広瀬進、森川耿右
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ(熊本)
    • 年月日
      2009-05-21
  • [学会発表] RecQに関連する古細菌由来Hjmヘリカーゼの結晶構造とその機能2009

    • 著者名/発表者名
      大山拓次、真柳浩太、白井剛、藤兼亮輔、石野良純、森川耿右
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ(熊本)
    • 年月日
      2009-05-21
  • [図書] 実験医学増刊「活性酸素シグナルと酸化ストレス」「親電子性リガンドセンサーとしての核内受容体PPARγ」205-2112009

    • 著者名/発表者名
      白木琢磨
    • 総ページ数
      242
    • 出版者
      羊土社

URL: 

公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi