物理科学を基盤とする人工細胞モデルの構築と機能解析

2010 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 18GS0421
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 吉川 研一 京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80110823)
• 研究分担者: 今中 忠行 立命館大学, 生命科学部, 教授 (30029219) ; 秋吉 一成 京都大学, 工学研究科, 教授 (90201285) ; 野村 慎一郎 東北大学, 工学研究科, 准教授 (50372446)
• キーワード: リポソーム / 人工細胞モデル / 物性基礎論 / 生物物理 / 化学物理 / 自己組織化

研究概要

生命の時空間の自己組織化という謎に迫るために、統計物理・非平衡物理・非線形科学などの物理科学方法論や手法を発展的に適用しながら、エネルギーや物質の流れのなかでの自律的システムとして生命を捉えることを目的とする。本研究においては、モデル細胞の非平衡条件下での振る舞いを明らかにすることを通して、生命現象の本質に迫る。具体的には次の3つの視点から研究を進めてきた。1)DNAの高次構造転移による遺伝子群の活性のon/offスイッチングを実空間上の実験を通して実証し、細胞内での自律的な遺伝子制御のメカニズムの解明を目指す。2)リン脂質多重層から自発的に細胞サイズの小胞が生成する機構を明らかにするとともに、小胞内での転写・発現反応の加速のメカニズムを解明する。3)長鎖DNAの高次構造転移と生化学反応のネットワークからなる、生命現象の階層的システムとしての特質を究明する。その結果、予期した以上の成果が得られた。成果の一部を以下に紹介したい。
核内空間に閉じ込めた高分子がセミフレキシブルな場合、フレキシブルよりも凝縮転移が亢進される事を発見した。DNAの核内構造の解明に寄与すると期待される。
細胞サイズリポソームや液滴の中でのアクチン繊維の高次構造形成や、膜タンパク質の膜への埋め込みを行い、その構造や機能を同定した。より生命に近い人工細胞モデルの創生に寄与するものである。
巨大なメガ塩基対のDNA分子を対象に、DNAの折り畳み転移の特性についての解析を進め、ゲノムDNAの抽出・一分子計測に成功し、その折り畳み転移特性について、他の研究手法では得られない新たな知見を得ることができた。遺伝子および遺伝子群活性の自己制御モデルの発展に寄与するものと期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Large-scale vortex lattice emerging from collectively moving microtubules (2012)
  • 著者名/発表者名: Y.Sumino, K.H.Nagai, Y.Shitaka, D.Tanaka, K.Yoshikawa, H.Chate, K.Oiwa
  • 雑誌名: Nature 巻: 483 ページ: 448-452
  • 査読あり
• [雑誌論文] How environmental solution conditions determine the compaction velocity of single DNA molecules (2012)
  • 著者名/発表者名: K.Hirano, M.Ichikawa, T.Ishido, M.Ishikawa, Y.Baba, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 40 ページ: 284-289
  • 査読あり
• [雑誌論文] Critical behavior of megabase-size DNA toward transition into a compact state (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Yoshikawa, Y.Suzuki, K.Yamada, W.Fukuda, K.Yoshikawa, K.Takeyasu, T.Imanaka
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: 135 ページ: 225101
  • 査読あり
• [雑誌論文] Highly Efficient DNA Compaction Mediated by an In Vivo Antitumor-Active Tetrazolato-Bridged Dinuclear Platinum(II) Complex (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Yoshikawa, S.Komeda, M.Uemura, T.Kanbe, M.Chikuma, K.Yoshikawa, T.Imanaka
  • 雑誌名: Inorganic Chemistry 巻: 50 ページ: 11729-11735
  • 査読あり
• [雑誌論文] Unraveling DNA dynamics using atomic force microscopy (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Suzuki, Y.Yoshikawa, S.H.Yoshimura, K.Yoshikawa, K.Takeyasu
  • 雑誌名: WIREs Nanomedicine and Nanobiotechnology 巻: 3 ページ: 574-588
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transformation of ActoHMM Assembly Confined in Cell-Sized Liposome (2011)
  • 著者名/発表者名: K.Takiguchi, M.Negishi, Y.Tanaka-Takiguchi, M.Homma, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Langmuir 巻: 27 ページ: 11528-11535
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oriented Reconstitution of a Membrane Protein in a Giant Unilamellar Vesicle : Experimental Verification with the Potassium Channel KcsA (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Yanagisawa, M.Iwamoto, A.Kato, K.Yoshikawa, S.Oiki
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 巻: 133 ページ: 11774-11779
  • 査読あり
• [雑誌論文] Confinement causes opposite effects on the folding transition of a single polymer chain depending on its stiffness (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Higuchi, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Physical Review E 巻: 84 ページ: 021924
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phase behavior of crowded like-charged mixed polyelectrolytes in a cell-sized sphere (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Negishi, M.Ichikawa, M.Nakajima, M.Kojima, T.Fukuda, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Physical Review E 巻: 83 ページ: 061921
  • 査読あり
• [雑誌論文] Salt Has a Biphasic Effect on the Higher-Order Structure of a DNA-Protamine Complex (2011)
  • 著者名/発表者名: N.Makita, Y.Yoshikawa, Y.Takenaka, T.Sakaue, M.Suzuki, C.Watanabe, T.Kanai, T.Kanbe, T.Imanaka, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry B 巻: 115 ページ: 4453-4459
  • 査読あり
• [雑誌論文] Thermococcus kodakarensis as a Host for Gene Expression and Protein Secretion (2011)
  • 著者名/発表者名: R.Takemasa, Y.Yokooji, A.Yamatsu, H.Atomi, T.Imanaka
  • 雑誌名: Applied and Environmental Microbiology 巻: 77 ページ: 2392-2398
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular bases of thermophily in hyperthermophiles(謝辞無し) (2011)
  • 著者名/発表者名: T.Imanaka
  • 雑誌名: Proceedings of the Japan Academy, Series B 巻: 87 ページ: 587-602
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biochemical and genetic characterization of the three metabolic routes in Thermococcus kodakarensis linking glyceraldehyde 3-phosphate and 3-phosphoglycerate(謝辞無し) (2011)
  • 著者名/発表者名: K.Matsubara, Y.Yokooji, H.Atomi, T.Imanaka
  • 雑誌名: Molecular Microbiology 巻: 81 ページ: 1300-1312
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cyclodextrin-responsive nanogel as an artificial chaperone for horseradish peroxidase (2011)
  • 著者名/発表者名: S.Sawada, Y.Sasaki, Y.Nomura, K.Akiyoshi
  • 雑誌名: Colloid and Polymer Science 巻: 289 ページ: 685-691
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polysaccharide nanogel gene delivery system with endosome-escaping function : Co-delivery of plasmid DNA and phospholipase A_2 (2011)
  • 著者名/発表者名: S.Toita, S.Sawada, K.Akiyoshi
  • 雑誌名: Journal of Controlled Release 巻: 155 ページ: 54-59
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cadherin-integrated liposomes with potential application in a drug delivery system (2011)
  • 著者名/発表者名: K.Kamiya, K.Tsumoto, T.Yoshimura, K.Akiyoshi
  • 雑誌名: Biomaterials 巻: 32 ページ: 9899-9907
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative study of kinetics on DNA double-strand break induced by photo- and gamma-Irradiation : Protective effect of water-soluble flavonoids (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Yoshikawa, T.Mori, M.Suzuki, T.Imanaka, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Chemical Physics Letters 巻: 501 ページ: 146-151
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dual biosynthesis pathway for longer chain polyamines in hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Morimoto, W.Fukuda, N.Nakajima, T.Masuda, Y.Terui, T.Kanai, T.Oshima, T.Imanaka, S.Fujiwara
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 巻: 192 ページ: 4991-5001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characteristic effect of an anticancer dinuclear platinum(II) complex on the higher-order structure of DNA (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Kida, Y.Katsuda, Y.Yoshikawa, S.Komeda, T.Sato, Y.Saito, M.Chikuma, M.Suzuki, T.Imanaka, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Journal of Biological Inorganic Chemistry 巻: 15 ページ: 701-707
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure-based Catalytic Optimization of a Type III Rubisco from a Hyperthermophile(謝辞無し) (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Nishitani, S.Yoshida, M.Fujihashi, K.Kitagawa, T.Doi, H.Atomi, T.Imanaka, K.Miki
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 285 ページ: 39339-39347
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polysaccharide nanogel-cyclodextrin system as an artificial chaperone for in vitro protein synthesis of green fluorescent protein (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Sasaki, Y.Nomura, S.Sawada, K.Akiyoshi
  • 雑誌名: Polymer Journal 巻: 42 ページ: 823-828
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nanogel antigenic protein-delivery system for adjuvant-free intranasal vaccines (2010)
  • 著者名/発表者名: T.Nochi, Y.Yuki, H.Takahashi, S.Sawada, M.Mejima, T.Kohda, N.Harada, I.G.Kong, A.Sato, N.Kataoka, D.Tokuhara, S.Kurokawa, Y.Takahashi, H.Tsukada, S.Kozaki, K.Akiyoshi, H.Kiyono
  • 雑誌名: Nature Materials 巻: 9 ページ: 572-578
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nano-Encapsulation of Lipase by Self-Assembled Nanogels : Induction of High Enzyme Activity and Thermal Stabilization (2010)
  • 著者名/発表者名: S.Sawada, K.Akiyoshi
  • 雑誌名: Macromolecular Bioscience 巻: 10 ページ: 353-358
  • 査読あり
• [雑誌論文] Direct integration of cell-free-synthesized connexin-43 into liposomes and hemichannel formation (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Moritani, S.M.Nomura, I.Morita, K.Akiyoshi
  • 雑誌名: FEBS Journal 巻: 277 ページ: 3343-3352
  • 査読あり
• [雑誌論文] リポソーム/細胞間の分子通信 (2010)
  • 著者名/発表者名: 野村慎一郎、森谷優貴、秋吉一成
  • 雑誌名: 日本ロボット学会誌(特集「分子ロボティクス」) 巻: 28 ページ: 1176-1177
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phase separation of a mixture of charged and neutral lipids on a giant vesicle induced by small cations (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Shimokawa, M.Hishida, H.Seto, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Chemical Physics Letters 巻: 496 ページ: 59-63
  • 査読あり
• [雑誌論文] Anomalous roughening of curvature-driven growth with a variable interface window (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.J.Chen, Y.Nagamine, T.Yamaguchi, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Physical Review E 巻: 82 ページ: 021604
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantum dot probes for observation of single molecule DNA and a synthetic polyelectrolyte higher-order structure (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Chen, A.A.Zinchenko, Y.Yamazaki, Y.Yoshikawa, S.Murata, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Soft Matter 巻: 6 ページ: 2834-2841
  • 査読あり
• [雑誌論文] Thermo-Switching of the Conformation of Genomic DNA in Solutions of Poly (N-i sopropylacrylamide) (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Chen, A.A.Zinchenko, S.Kidoaki, S.Murata, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Langmuir 巻: 26 ページ: 2995-2998
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large system in a small cell : A hypothetical pathway from a microscopic stochastic process towards robust genetic regulation (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Nagahara, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Chemical Physics Letters 巻: 494 ページ: 88-94
  • 査読あり
• [雑誌論文] A non-equilibrium quasistationary state in an ionic liquid caused by a focused laser (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Iguchi, A.Datta, K.Yoshikawa, Y.Yoshida, G.Saito
  • 雑誌名: Chemical Physics Letters 巻: 485 ページ: 110-113
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phase Separation on a Phospholipid Membrane Inducing a Characteristic Localization of DNA Accompanied by Its Structural Transition (2010)
  • 著者名/発表者名: A.Kato, A.Tsuji, M.Yanagisawa, D.Saeki, K.Juni, Y.Morimoto, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry Letters 巻: 1 ページ: 3391-3395
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA Compaction in a Crowded Environment with Negatively Charged Proteins (2010)
  • 著者名/発表者名: M.K.Krotova, V.V.Vasilevskaya, N.Makita, K.Yoshikawa, A.R.Khokhlov
  • 雑誌名: Physical Review Letters 巻: 105 ページ: 128302
  • 査読あり
• [雑誌論文] Torsional effect on the wrapping transition of a semiflexible polymer around a core as a model of nucleosome (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Higuchi, T.Sakaue, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Physical Review E 巻: 82 ページ: 031909
  • 査読あり
• [雑誌論文] Compaction of DNA Induced by Like-Charge Protein : Opposite Salt-Effect against the Polymer-Salt-Induced Condensation with Neutral Polymer (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Yoshikawa, S.Hirota, N.Makita, Y.Yoshikawa
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry Letters 巻: 1 ページ: 1763-1766
  • 査読あり
• [雑誌論文] Traveling wave of segregation in a highly filled rotating drum (2010)
  • 著者名/発表者名: S.Inagaki, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Physical Review Letters 巻: 105 ページ: 118001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Finite-Width Bundle is Most Stable in a Solution with Salt (2010)
  • 著者名/発表者名: T.Saito, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: 133 ページ: 045102
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cooperation between giant DNA molecules and actin filaments in a microsphere (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Negishi, T.Sakaue, K.Takiguchi, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Physical Review E 巻: 81 ページ: 051921
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rotary motion driven by a direct current electric field (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Takinoue, Y.Atsumi, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Applied Physics Letters 巻: 96 ページ: 104105
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cleavage pattern of DNA caused by endonuclease : Theoretical modeling and experimental verification (2010)
  • 著者名/発表者名: S.Inagaki, L.Liu, M.Takinoue, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: Applied Physics Letters 巻: 96 ページ: 063701
  • 査読あり
• [雑誌論文] In Vitro HIV-1 Selective Integration into the Target Sequence and Decoy-Effect of the Modified Sequence (2010)
  • 著者名/発表者名: T.Tsuruyama, T.Nakai, T.Hiratsuka, G.Jin, T.Nakamura, K.Yoshikawa
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 5 ページ: e13841
  • 査読あり
• [学会発表] Self-propelled motion of a composite induced by interfacial instability : spontaneous symmetry breaking and mode-bifurcation (2012)
  • 著者名/発表者名: F.Takabatake, N.Magome, M.Ichikawa, K.Yoshikawa
  • 学会等名: 2011年度GCOEシンポジウム「階層の連結」
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 20120213-20120214
• [学会発表] Dynamics of thermal fluctuation of phospholipid nano-tubes through direct observation (2012)
  • 著者名/発表者名: 山本暁久、市川正敏
  • 学会等名: 2011年度GCOEシンポジウム「階層の連結」
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 20120213-20120214
• [学会発表] 荷電リン脂質系が2次元界面上に形成するマイクロメートルスケールのネットワーク構造 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤弘明、柳澤実穂、市川正敏、吉川研一
  • 学会等名: 日本物理学会第67回年次大会
  • 発表場所: 関西学院大学西宮上ケ原キャンパス
  • 年月日: 2012-03-26
• [学会発表] 振動場が誘起する水平面内の回転運動に関する数理モデル (2012)
  • 著者名/発表者名: 稲垣紫緒、久保善嗣、吉川研一
  • 学会等名: 日本物理学会第67回年次大会
  • 発表場所: 関西学院大学西宮上ケ原キャンパス
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] 低線量γ線によるDNA二重鎖切断確率はDNA濃度に顕著に依存する (2012)
  • 著者名/発表者名: 下林俊典、吉川研一、森利明、吉川祐子
  • 学会等名: 日本物理学会第67回年次大会
  • 発表場所: 関西学院大学西宮上ケ原キャンパス
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] Direct observation and measurement of thermal fluctuation of single softnano-tubes (2012)
  • 著者名/発表者名: A.Yamamoto, M.Ichikawa
  • 学会等名: Phase Transition Dynamics in Soft Matter : Bridging Microscale and Mesoscale
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 2012-02-21
• [学会発表] Stabilization of cardiac conduction via rigidity matching between cells and extracellular matrix (2012)
  • 著者名/発表者名: M.Horning, K.Yoshikawa
  • 学会等名: Phase Transition Dynamics in Soft Matter : Bridging Microscale and Mesoscale
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2012-02-20
• [学会発表] Controlling excitation patterns by minimum electric far field : Experiments and simulation on heterogeneous tissue (2012)
  • 著者名/発表者名: Marcel Horning, Seiji Takagi
  • 学会等名: The 50th Annual Conference of Japanese Society for Medical and Biological Engineering, "Medical and Biological Engineering Advance toward next 50 Years"
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2012-01-10
• [学会発表] 液滴から学ぶ非線形ダイナミクス (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉川研一
  • 学会等名: シンポジウム創発と自己組織化-魅惑の非線形
  • 発表場所: 九州大学西新プラザ
  • 年月日: 20111121-20111122
• [学会発表] Cross-Talk between Life Science and Physics : Real-world modeling of cell (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉川研一
  • 学会等名: Cycle de conferences JSPS Strasbourg et MUFJ 2011-2012
  • 発表場所: Strasbourg, France
  • 年月日: 20110911-20110913
• [学会発表] Phase separation in charged lipid bilayer membranes between solutions having different ionic strengths (2011)
  • 著者名/発表者名: N.Shimokawa
  • 学会等名: 2010年度GCOEシンポジウム「フロンティア開拓」
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 20110221-20110223
• [学会発表] Direct observation of fluctuational motion of a single phospholipid micro-tube (2011)
  • 著者名/発表者名: A.Yamamoto, M.Ichikawa
  • 学会等名: 2010年度GCOEシンポジウム「フロンティア開拓」
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 20110221-20110223
• [学会発表] Spontaneous motion of a solid/liquid composite : symmetry breaking and mode bifurcation (2011)
  • 著者名/発表者名: F.Takabatake, N.Magome, M.Ichikawa, K.Yoshikawa
  • 学会等名: 2010年度GCOEシンポジウム「フロンティア開拓」
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 20110221-20110223
• [学会発表] Spontaneous mode switching of a self-running solid/liquid composite (2011)
  • 著者名/発表者名: F.Takabatake, N.Magome, M.Ichikawa, K.Yoshikawa
  • 学会等名: International Symposium of Complex Systems 2011
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2011-12-02
• [学会発表] Mode bifurcation of bouncing dimer caused by chiral-asymmetry (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Kubo, S.Inagaki, K.Yoshikawa
  • 学会等名: Internaional Symposium of Complex Systems 2011
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2011-12-01
• [学会発表] ライデンフロスト液滴の変形と運動モード分岐 (2011)
  • 著者名/発表者名: 栗村朋、吉川研一、市川正敏
  • 学会等名: 第二回京都ソフトマター研究会
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 2011-11-19
• [学会発表] Dependence on the DNA concentration of the probability of double strand breaks : the practical use of a long single-DNA molecule observation (2011)
  • 著者名/発表者名: 下林俊典、吉川研一、吉川祐子、森利明
  • 学会等名: 日本放射線影響学会第54回大会
  • 発表場所: 神戸商工会議所会館
  • 年月日: 2011-11-18
• [学会発表] Network-pattern Formation on the Surface of Micro Water Droplets with Charged Lipids (2011)
  • 著者名/発表者名: 伊藤弘明、柳澤実穂、市川正敏、吉川研一
  • 学会等名: 「細胞を創る」研究会4.0
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター
  • 年月日: 2011-10-27
• [学会発表] Network-pattern Formation on the Surface of Micro Water Droplets with Charged Lipids (2011)
  • 著者名/発表者名: H.Ito, M.Yanagisawa, M.Ichikawa, K.Yoshikawa
  • 学会等名: International Symposium on SYNTHESIZING LIFE AND BIOLOGICAL SYSTEMS
  • 発表場所: Osaka, Japan
  • 年月日: 2011-10-25
• [学会発表] Playing with sands : segregation induced by mechanical agitation (2011)
  • 著者名/発表者名: S.Inagaki, K.Yoshikawa
  • 学会等名: Nara Workshop on Fracture and Related Topics
  • 発表場所: 奈良女子大学
  • 年月日: 2011-10-13
• [学会発表] 非チューリング・シナリオ:生物の形態形成の新モデル (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉川研一
  • 学会等名: 明治大学先端数理科学研究科開発記念シンポジウム記念講演会
  • 発表場所: 明治大学駿河台キャンパス
  • 年月日: 2011-10-05
• [学会発表] 振動板上における物体のカイラル対称性と運動モード分岐 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久保善嗣、稲垣紫緒、吉川研一
  • 学会等名: HMC特別研究会「非線形現象の数理解析」
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] Cell-rigidity recognition of neighboring cells toward the stabilization of cardiac conduction (2011)
  • 著者名/発表者名: Marcel Horning, S.Kidoaki, T.Kawano, K.Yoshikawa
  • 学会等名: The 2nd Mini-Syposium on non-equilibrium dynamics of soft matter-International Workshop on Nonlinear Dynamics in Science
  • 発表場所: Kyoto University
  • 年月日: 2011-09-26
• [学会発表] ガラス基板上に浮遊する液体窒素液滴の自発運動 (2011)
  • 著者名/発表者名: 栗村朋、吉川研一、市川正敏
  • 学会等名: HMC特別研究会「非線形現象の数理解析」
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス
  • 年月日: 2011-09-26
• [学会発表] 油中ミクロ水滴表面に荷電脂質が形成するネットワーク・パターン (2011)
  • 著者名/発表者名: 伊藤弘明、柳澤実穂、市川正敏、吉川研一
  • 学会等名: 日本物理学会2011年秋季大会
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス
  • 年月日: 2011-09-24
• [学会発表] γ線によるDNA二重鎖切断の定量的計測:単一DNA分子測定手法の活用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 下林俊典、吉川研一、吉川祐子、森利明
  • 学会等名: 日本物理学会2011年秋季大会
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス
  • 年月日: 2011-09-24
• [学会発表] DNA回文配列においてのレトロウイルス特異的挿入反応:反応特異性と十字架構造との定量的相関関係 (2011)
  • 著者名/発表者名: 劉偉智、鶴山竜昭、吉川研一
  • 学会等名: 日本物理学会2011年秋季大会
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス
  • 年月日: 2011-09-24
• [学会発表] 高分子溶液のゲル化とカップリングした相分離に対する微小空間効果 (2011)
  • 著者名/発表者名: 林仁志、市川正敏、吉川研一
  • 学会等名: 日本物理学会2011年秋季大会
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス
  • 年月日: 2011-09-24
• [学会発表] 振動場における物体のカイラル対称性と運動モード分岐 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久保善嗣、稲垣紫緒、吉川研一｀
  • 学会等名: 日本物理学会第67回年次大会
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス
  • 年月日: 2011-09-23
• [学会発表] 振動場における物体の運動モード分岐に関するモデル (2011)
  • 著者名/発表者名: 稲垣紫緒、久保善嗣、吉川研一
  • 学会等名: 日本物理学会2011年秋季大会
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] 液体表面上に浮揚する液体窒素液滴の自発的な並進運動:自発的対称性の破れと運動モード分岐 (2011)
  • 著者名/発表者名: 栗村朋、吉川研一、市川正敏
  • 学会等名: 日本物理学会2011年秋季大会
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] Quantitative evaluation of DNA double-strand breaks by low gamma-ray radiation : Application of single DNA observation (2011)
  • 著者名/発表者名: 下林俊典、吉川研一、吉川祐子、森利明
  • 学会等名: 第49回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 兵庫県立大学姫路書写キャンパス
  • 年月日: 2011-09-18
• [学会発表] Unique and specific properties of the cell-sized model systems (2011)
  • 著者名/発表者名: 市川正敏
  • 学会等名: 第49回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 兵庫県立大学姫路書写キャンパス
  • 年月日: 2011-09-17
• [学会発表] Site-specific integration of retrovirus onto palindromic sequence : Analysis of integration selectivity in relation to DNA local structure (2011)
  • 著者名/発表者名: W.Liu, K.Yoshikawa, T.Tsuruyama
  • 学会等名: 第49回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 兵庫県立大学姫路書写キャンパス
  • 年月日: 2011-09-16
• [学会発表] 直接観察による脂質ナノチューブの動的物性の解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山本暁久、市川正敏
  • 学会等名: 第51回生物物理若手の会夏の学校
  • 発表場所: 関西セミナーハウス
  • 年月日: 2011-08-25
• [学会発表] 振動板上のねじれ物体の運動モード分岐 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久保善嗣、稲垣紫緒、吉川研一
  • 学会等名: 基研研究会2011非平衡系の物理-ミクロとマクロの架け橋
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 2011-08-20
• [学会発表] 液体表面上に浮揚する液体窒素液滴の自発的な並進運動:自発的対称性の破れと運動モード分岐 (2011)
  • 著者名/発表者名: 栗村朋、吉川研一、市川正敏
  • 学会等名: 基研研究会2011非平衡系の物理-ミクロとマクロの架け橋
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 2011-08-20
• [学会発表] ミクロ水滴上で荷電脂質が形成するネットワーク・パターンとそのダイナミクス (2011)
  • 著者名/発表者名: 伊藤弘明、柳澤実穂、市川正敏
  • 学会等名: 第1回ソフトマター研究会
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都
  • 年月日: 2011-08-03
• [学会発表] 揺らぎ運動の直接観察による脂質ナノチューブの動的物性の解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山本暁久、市川正敏
  • 学会等名: 第1回ソフトマター研究会
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都
  • 年月日: 2011-08-03
• [学会発表] Control of activation sites by low-electric far field pacing in excitable media (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Horning, S.Takagi, K.Yoshikawa
  • 学会等名: Engineering of Chemical Complexity
  • 発表場所: Berlin, Germany
  • 年月日: 2011-07-07
• [学会発表] 固液複合体の自発運動:対称性の破れとモード分岐 (2011)
  • 著者名/発表者名: 高畠芙弥、馬籠信之、市川正敏、吉川研一
  • 学会等名: 日本物理学会第66回年次大会
  • 発表場所: 新潟大学五十嵐キャンパス
  • 年月日: 2011-03-28
• [学会発表] 振動板上の物体の運動モード分岐:カイラル対称性の破れと運動の特異性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久保善嗣、稲垣紫緒
  • 学会等名: 日本物理学会第66回年次大会
  • 発表場所: 新潟大学五十嵐キャンパス
  • 年月日: 2011-03-28
• [学会発表] 液体窒素液滴の自発的運動:幾何学的対称性の破れと運動モード分岐 (2011)
  • 著者名/発表者名: 栗村朋、吉川研一、市川正敏、稲垣紫緒
  • 学会等名: 日本物理学会第66回年次大会
  • 発表場所: 新潟大学五十嵐キャンパス
  • 年月日: 2011-03-28
• [学会発表] 脂質マイクロチューブの揺らぎ運動でみる動的物性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山本暁久、市川正敏
  • 学会等名: 日本物理学会第66回年次大会
  • 発表場所: 新潟大学五十嵐キャンパス
  • 年月日: 2011-03-26
• [学会発表] 油水界面上の中性・荷電脂質混合膜上のパターン・ダイナミクス (2011)
  • 著者名/発表者名: 伊藤弘明、柳澤実穂、市川正敏、吉川研一
  • 学会等名: 日本物理学会第66回年次大会
  • 発表場所: 新潟大学五十嵐キャンパス
  • 年月日: 2011-03-26
• [学会発表] 異なる塩濃度の溶液に挟まれた脂質二重膜の相分離 (2011)
  • 著者名/発表者名: 下川直史
  • 学会等名: 第1回京大物理ソフトマター研究会
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 2011-03-10
• [学会発表] 界面張力勾配に誘起される自発運動 (2011)
  • 著者名/発表者名: 高畠芙弥
  • 学会等名: 第1回京大物理ソフトマター研究会
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 2011-03-10
• [学会発表] Self-propelled motion of a liquid nitrogen droplet : mode bifurcation and analyses (2011)
  • 著者名/発表者名: 栗村朋
  • 学会等名: 第20回「非線形反応と協同現象」研究会
  • 発表場所: 鹿児島大学
  • 年月日: 2011-01-08
• [学会発表] Interactions of Virtual Electrodes-Efficiency of Far-Field Pacing in Heart (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Horning, S.Takagi, K.Yoshikawa
  • 学会等名: Far-From-Equilibrium Dynamics 2011
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2011-01-06
• [学会発表] 増殖期と定常期を模した大腸菌モデル環境における、DNA高次構造変化-ヌクレオイドプロテインFisとDpsによるDNA折り畳みとその顕著な差異 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤祐子、吉川祐子、市川正敏、石浜明、吉川研一
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会第83回日本生化学会合同大会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 20101207-20101208
• [学会発表] Crossover behavior of a single DNA molecule in a quasi-two dimensional system (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Ichikawa, H.Uemura, Y.Kimura
  • 学会等名: International Soft Matter Conference 2010
  • 発表場所: Granada, Spain
  • 年月日: 20100705-20100708
• [学会発表] 超好熱菌の解剖と応用-新規代謝系の発見- (2010)
  • 著者名/発表者名: 今中忠行
  • 学会等名: 立教大学研究成果報告・シンポジウム文科省私立大学学術高度化推進事業
  • 発表場所: 立教大学池袋キャンパス
  • 年月日: 2010-12-18
• [学会発表] 脂質マイクロチューブのブラウン運動と形状揺らぎ (2010)
  • 著者名/発表者名: 山本暁久、市川正敏
  • 学会等名: 第8回京都大学福井謙一記念センターシンポジウム
  • 発表場所: 京都大学福井謙一記念センター
  • 年月日: 2010-12-03
• [学会発表] Spontaneous mode-selection in the self-propelled motion of a solid/liquid composite driven by interfacial instability (2010)
  • 著者名/発表者名: F.Takabatake, N.Magome, M.Ichikawa, K.Yoshikawa
  • 学会等名: 9th iCeMS International Symposium : "Mesoscale Control and Engineering of Self-Organized and Excitable Systems in Biology and Chemistry"
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2010-12-02
• [学会発表] 超好熱菌の解剖と利用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 今中忠行
  • 学会等名: 三菱化学研究奨励基金記念講演会
  • 発表場所: 三菱化学研横浜究所
  • 年月日: 2010-11-24
• [学会発表] 固/液複合体の自発運動モード選択 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高畠芙弥
  • 学会等名: 基研研究会2010非平衡系の物理-非平衡ゆらぎと集団挙動
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 2010-11-19
• [学会発表] カチオンが誘起する荷電脂質・中性脂質混合系の相分離 (2010)
  • 著者名/発表者名: 下川直史、菱田真史、瀬戸秀紀、吉川研一
  • 学会等名: 第33回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 年月日: 2010-11-17
• [学会発表] 1分子計測データに対するパラメータ推定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 宮崎牧人
  • 学会等名: 第13回情報論的学習理論ワークショップ
  • 発表場所: 東京大学駒場キャンパス
  • 年月日: 2010-11-06
• [学会発表] 異なる塩濃度の溶液に挟まれた脂質二重膜の遮蔽効果が誘起する相分離 (2010)
  • 著者名/発表者名: 下川直史、好村滋行、D.Andelman
  • 学会等名: 日本物理学会2010年秋季大会
  • 発表場所: 大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
  • 年月日: 2010-09-26
• [学会発表] クロマチンの高次構造転移:粗視化モデルからのアプローチ (2010)
  • 著者名/発表者名: 樋口祐次
  • 学会等名: 日本物理学会2010年秋季大会
  • 発表場所: 大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
  • 年月日: 2010-09-26
• [学会発表] 異種高分子が形成するミクロ相分離場上でのDNAのブラウン運動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 林仁志
  • 学会等名: 日本物理学会2010年秋季大会
  • 発表場所: 大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
  • 年月日: 2010-09-26
• [学会発表] 脂質マイクロチューブの揺らぎ運動:構造と物性の相関 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山本暁久、市川正敏
  • 学会等名: 日本物理学会2010年秋季大会
  • 発表場所: 大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
  • 年月日: 2010-09-25
• [学会発表] 界面不安定性が引き起こす固/液複合体の自発運動のモード選択 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高畠芙弥
  • 学会等名: 日本物理学会2010年秋季大会
  • 発表場所: 大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] 振動場上のねじれ物体の運動モード分岐 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久保善嗣、稲垣紫緒
  • 学会等名: 日本物理学会2010年秋季大会
  • 発表場所: 大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] Efficiency of Virtual Electrodes in Excitable Media (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Horning, S.Takagi, K.Yoshikawa
  • 学会等名: 日本物理学会2010年秋季大会
  • 発表場所: 大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] Difference in the action of Escherichia coli nucleoid proteins, Fis and Dps, on DNA conformation (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤祐子、吉川祐子、市川正敏、石浜明、吉川研一
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 東北大学川内キャンパス
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] Direct observation of dynamical motion of a soft micro-tube (2010)
  • 著者名/発表者名: A.Yamamoto, M.Ichikawa
  • 学会等名: ISSP International Workshop on Soft Matter Physics 2nd week "Biomembranes and Vesicles"
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2010-08-25
• [学会発表] Phase separation of a mixture of charged and neutral lipids on a giant vesicle induced by small cations (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Shimokawa, M.Hishida, H.Seto, K.Yoshikawa
  • 学会等名: International symposium on Non-Equilibrium Soft Matter 2010
  • 発表場所: Nara, Japan
  • 年月日: 2010-08-17
• [学会発表] Non-monotonous wrapping transition of a nucleosome induced by torsional stress (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Higuchi, T.Sakaue, K.Yoshikawa
  • 学会等名: International symposium on Non-Equilibrium Soft Matter 2010
  • 発表場所: Nara, Japan
  • 年月日: 2010-08-17
• [学会発表] rownian dynamics of a single phospholipid micro-tube through real-time observation (2010)
  • 著者名/発表者名: A.Yamamoto, M.Ichikawa
  • 学会等名: International symposium on Non-Equilibrium Soft Matter 2010
  • 発表場所: Nara, Japan
  • 年月日: 2010-08-17
• [学会発表] Mode switching of self-propelled motion of a solid/liquid composite under interfacial instability (2010)
  • 著者名/発表者名: F.Takabatake, M.Ichikawa, K.Yoshikawa
  • 学会等名: International symposium on Non-Equilibrium Soft Matter 2010
  • 発表場所: Nara, Japan
  • 年月日: 2010-08-17
• [学会発表] Extremophiles : genetics & application (2010)
  • 著者名/発表者名: T.Imanaka
  • 学会等名: Bio21 Molecular Science & Biotechnology Insutitute, 7th International Symposium of Industrial Microbiology
  • 発表場所: Melbourne, Australia
  • 年月日: 2010-07-02
• [学会発表] 超好熱菌の解剖と産業利用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 今中忠行
  • 学会等名: 平成21年度私立大学戦略的研究基盤形成支援事業研究成果報告会
  • 発表場所: 日本大学工学部次世代工学技術研究センター
  • 年月日: 2010-06-17
• [学会発表] 1分子計測における逆問題:タンパク質の内部構造に対するベイズ推定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 宮崎牧人、原田崇広
  • 学会等名: 第10回東京大学生命科学シンポジウム
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス
  • 年月日: 2010-05-01
• [図書] 酵素の開発と応用技術 (2011)
  • 著者名/発表者名: 今中忠行(監修)
  • 総ページ数: 309
  • 出版者: シーエムシー出版
• [図書] UNDERSTANDING SOFT CONDENSED MATTER VIA MODELING AND COMPUTATION (2010)
  • 著者名/発表者名: C.Shew, K.Yoshikawa(分担執筆)
  • 総ページ数: 30
  • 出版者: World Scientific Publishing Company
• [備考]
  • URL: http://www.chem.scphys.kyoto-u.ac.jp/index_j.html