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2019 年度 実績報告書

多面的な環境耐性を制御するSTOP1転写制御系と進化の分子的理解に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 18H02113
研究機関岐阜大学

研究代表者

小山 博之  岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (90234921)

研究分担者 井内 聖  国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 専任研究員 (90312256)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワードSTOP1 / 発現制御 / カリウム
研究実績の概要

シロイヌナズナの酸耐性遺伝子として同定されたZnフィンガータンパク質であるSTOP1は、転写因子として機能し、低pH耐性遺伝子の転写を制御する。このタンパク質が転写制御するSTOP1システムは、酸、アルミニウムストレスに加えて、ハイポキシアストレス、リン酸欠乏に応答する根の形態形成を制御する「多面発現性」を持つことを昨年度までに明らかにした(注;リン酸欠乏応答のみは、海外のグループの成果)。本年度は、STOP1システムが、乾燥耐性には負に働くことをシロイヌナズナで明らかにした。この知見は、ハイポキシア耐性と乾燥耐性がトレードオフの関係にあることを証明するとともに、それらがABAやエチレンシグナルで追加的に制御されるように進化したことを示唆するものである。乾燥耐性を負に制御する仕組みは、カリウム輸送体の活性化調節タンパク質の転写制御によるもので、STOP1は、リンに加えてカリウムの吸収・代謝も制御することを明らかにした。一方、ゼニゴケで実施した研究では、ゼニゴケの仮根の伸長が、1)アルミニウムや酸処理に弱いことをも見出し、ゲノム編集でSTOP1を破壊した系統の解析から、2)酸・アルミニウム耐性がSTOP1に制御される形質であることとともに、3)ハイポキシア耐性も制御することを明らかにした。これらの結果は、植物の陸上適応時に必須なハイポキシア耐性システムを多面発現様式で進化させたことを証明する成果である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

3年間の計画で、1)ハイポキシア耐性制御の証明(2019、JXB誌に掲載)、2)乾燥耐性を負に制御することの証明、及びPIPシグナルが、転写誘導に関わることの証明(2019、JXB誌)に成功している。既に、ゼニゴケのSTOP1システムが機能することを明らかにしていることから、当初の計画を大きく超える成果を出すことができる。

今後の研究の推進方策

STOP1転写因子の発現制御は、タンパク質内部の構造変化(活性ドメインの獲得)と、プロモーターの変異による標的遺伝子の多様化が関係していると考えられる。昨年までの研究では、シロイヌナズナでは酸耐性、アルミニウム耐性、ハイポキシア耐性を制御することを突き止めている。また、その制御は予想通り、タンパク質ドメインの制御やシス因子(プロモーター構造)の変化が関係していることを示す結果を得ている。研究の最終年度に当たる本年は、1)タンパク質構造変化のWET実験(キメラタンパク質組換え体などの解析)、2)シャジクモ・ゼニゴケでのSTOP1様タンパク質の機能解析(シロイヌナズナの相補組換え体の解析及びゼニゴケでの遺伝子破壊系統の解析)を実施する。1)につい
ては、標的遺伝子が特定できていることから、リアルタイムPCRなどで対応できるが、2)に関しては転写量をゲノムワイドにRNseq解析により特定する必要がある。そのターゲット遺伝子が分かった時点で、ゼニゴケにおいては標的遺伝子の破壊系統を作成して、転写因子・標的遺伝子の双方が高等植物と同等であるか否かを解析する。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件)

  • [雑誌論文] Genome-Wide Association Study and Genomic Prediction Elucidate the Distinct Genetic Architecture of Aluminum and Proton Tolerance in Arabidopsis thaliana2020

    • 著者名/発表者名
      Nakano Yuki、Kusunoki Kazutaka、Hoekenga Owen A.、Tanaka Keisuke、Iuchi Satoshi、Sakata Yoichi、Kobayashi Masatomo、Yamamoto Yoshiharu Y.、Koyama Hiroyuki、Kobayashi Yuriko
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 11 ページ: -

    • DOI

      https://doi.org/10.3389/fpls.2020.00405

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Sensitive to Proton Rhizotoxicity1 Regulates Salt and Drought Tolerance of Arabidopsis thaliana through Transcriptional Regulation of CIPK232019

    • 著者名/発表者名
      Sadhukhan Ayan、Enomoto Takuo、Kobayashi Yuriko、Watanabe Toshihiro、Iuchi Satoshi、Kobayashi Masatomo、Sahoo Lingaraj、Yamamoto Yoshiharu Y、Koyama Hiroyuki
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 60 ページ: 2113~2126

    • DOI

      10.1093/pcp/pcz120

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Redox balance, metabolic fingerprint and physiological characterization in contrasting North East Indian rice for Aluminum stress tolerance2019

    • 著者名/発表者名
      Awasthi Jay Prakash、Saha Bedabrata、Panigrahi Jogeswar、Yanase Emiko、Koyama Hiroyuki、Panda Sanjib Kumar
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 ページ: -

    • DOI

      10.1038/s41598-019-45158-3

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

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公開日: 2021-01-27  

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