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2020 年度 実績報告書

統合オミクス研究に資する質量分析インフォマティクスによる新規代謝制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18H02432
研究機関東京農工大学

研究代表者

津川 裕司  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (30647235)

研究分担者 中林 亮  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (30586160)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワード統合オミクス / メタボロミクス / リピドミクス / 質量分析 / インフォマティクス
研究実績の概要

本研究は、新規代謝産物の同定を含むノンターゲットメタボローム解析を基軸とした統合オミクス研究を行う。今年度は、マウスの老化に着目して研究を行った。具体的には、2か月齢から2年齢にかけて脂質メタボローム解析を行った。これにより、臓器特異的な脂質変化(リン脂質の加齢に伴う減少やトリアシルグリセロールの増加など)を捉えることに成功したことに加え、その一部は腸内細菌の有無や雌雄差に影響されることが分かった。本研究で着目した臓器の中では、腎臓に最も明確な差異を認めたことから、腎臓における統合オミクス解析を行った。これにより、加齢依存的な糖脂質の変動が、特定の遺伝子によって制御されている可能性が明らかとなった。現在、この研究の論文化を行っているところである。また、本年度にはまとめきることができなかったが、生薬がヒト細胞にもたらす作用メカニズムを解明するため、トランスクリプトーム、プロテオーム、そしてメタボローム解析データの統合解析を行っており、近い将来論文としてまとめる予定である。また、今年度は本科研費課題の最終年度であることから、これまでの研究の総説執筆を行った(Natural Product Reports 38, 1729-1759, 2021)。これは、植物科学におけるノンターゲットメタボロミクスやその統合解析の最新技術をレビューしたものである。特に、代表者の研究の中核を成す質量分析インフォマティクス(英語ではcomputational mass spectrometry)について、詳細に記載した。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2021 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Global profiling of gut microbiota-associated lipid metabolites in antibiotic-treated mice by LC-MS/MS-based analyses2021

    • 著者名/発表者名
      Okahashi Nobuyuki、Ueda Masahiro、Yasuda Shu、Tsugawa Hiroshi、Arita Makoto
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 2 ページ: 100492~100492

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2021.100492

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Stage-Specific De Novo Synthesis of Very-Long-Chain Dihydroceramides Confers Dormancy to Entamoeba Parasites2021

    • 著者名/発表者名
      Mi-ichi Fumika、Ikeda Kazutaka、Tsugawa Hiroshi、Deloer Sharmina、Yoshida Hiroki、Arita Makoto
    • 雑誌名

      mSphere

      巻: 6 ページ: e00174-21

    • DOI

      10.1128/mSphere.00174-21

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Food Lipidomics for 155 Agricultural Plant Products2021

    • 著者名/発表者名
      Matsuzawa Yuki、Higashi Yasuhiro、Takano Kouji、Takahashi Mikiko、Yamada Yutaka、Okazaki Yozo、Nakabayashi Ryo、Saito Kazuki、Tsugawa Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Agricultural and Food Chemistry

      巻: 69 ページ: 8981~8990

    • DOI

      10.1021/acs.jafc.0c07356

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Metabolomics and complementary techniques to investigate the plant phytochemical cosmos2021

    • 著者名/発表者名
      Tsugawa Hiroshi、Rai Amit、Saito Kazuki、Nakabayashi Ryo
    • 雑誌名

      Natural Product Reports

      巻: 38 ページ: 1729~1759

    • DOI

      10.1039/D1NP00014D

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [備考] RIKEN PRIMe

    • URL

      http://prime.psc.riken.jp/

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公開日: 2022-12-28  

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