研究課題/領域番号 |
18H02497
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研究機関 | 長浜バイオ大学 |
研究代表者 |
倉林 敦 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授 (00327701)
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研究分担者 |
太田 英利 兵庫県立大学, 自然・環境科学研究所, 教授 (10201972)
田辺 秀之 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 准教授 (50261178)
森 哲 京都大学, 理学研究科, 教授 (80271005)
米澤 隆弘 東京農業大学, 農学部, 准教授 (90508566)
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研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2023-03-31
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キーワード | 遺伝子水平伝播 / ブラーミニメクラヘビ / 全ゲノム解析 / Indotyphlops属 / Psammophis condortus / BovB |
研究実績の概要 |
本研究では、ヘビからカエルに水平伝播したLINEレトロトランスポゾンBovBについて、(1)水平伝播時期と地域の解明、(2)水平伝播遺伝子の視覚化、(3)爬虫類・両生類以外のマダガスカル産脊椎動物にもBovBの水平伝播が生じているかの解明、(4)水平伝播を媒介した寄生虫・ウィルスの探索、(5)南アジア原産のブラーミニメクラヘビが、マダガスカルのヘビタイプのBovBを持っている理由の解明、の5点を目的としている。 本年度は、主に(5)について研究を行った。まず、水平伝播によってBovB配列を持つようになったと思われるブラーミニメクラヘビのゲノムに転移が可能な完全なBovB配列が存在しているかを明らかにするために、本種の全ゲノム配列を決定した。その結果、ブラーミニメクラヘビには転移可能な完全なBovB配列が存在することが確認された。また、本種の全ゲノム情報をScientific Data (IF=8.6)において公表した。 さらに、スリランカとバングラデシュ産のIndotyphlops類の標本(26と35標本)の輸出許可を得ることに成功した。これらのサンプルについて分子系統解析を行い、9種の未記載種が含まれている可能性を示した。また、これらのメクラヘビ類からはBovBの増幅が見られた。さらに、ブラーミニメクラヘビのBovBの起源と思われるアレチヘビ類の中でも例外的にアジアに産する Psammophis condortus の入手にも成功し、本種からもBovBの増幅を確認した。 今後、Indotyphlops類とPsammophisのBovBとブラーミニメクラヘビのBovBの関係が明らかにすることで、ブラーミニメクラヘビへのBovBの水平伝播がアフリカで生じたのか、アジア起源なのかが明らかにできる。
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現在までの達成度 (段落) |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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今後の研究の推進方策 |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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