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2020 年度 実績報告書

エクソーム解析によるゲノムプロファイリングに基づいた乳癌個別化治療の開発

研究課題

研究課題/領域番号 18H02870
研究機関大阪大学

研究代表者

金 昇晋  大阪大学, 医学系研究科, 招へい准教授 (90346213)

研究分担者 下田 雅史  大阪大学, 医学系研究科, 講師 (30644455)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワードエクソーム解析 / 乳癌 / 術前化学療法 / HRD / 感受性 / 予後
研究実績の概要

本研究は、術前化学療法(NAC)施行乳癌において、癌組織を用いて全エクソーム解析(WES)を行い、乳癌の遺伝子変異プロファイルにより抗癌剤感受性との関係を検討し高精度の個別化治療の開発を目標としている。
NAC(paclitaxel ± trastuzumab - FEC療法)前に採取した生検癌組織と末梢血からDNAを抽出しWESを実施した。120例(Luminal type 61例、HER2 type 44例、TNBC 15例)でNAC感受性とHomologous Recombination Deficiency (HRD) score、TMB(total mutation burden)、MSIとの相関について解析した。
HRD陽性(score > 42)率は全体では25%(30/120)であったが、TNBCは67%(10/15)でLuminal type(16%、10/61)やHER2 type(23%、10/44)に比べ有意(P < 0.001)に高率であった。HRD陽性は、TMB陽性(P<0.001)およびMSI陽性(P=0.002)と有意に相関した。HRD陽性例は陰性例よりNAC感受性が有意に高かった(pCR率 39% vs 10%, P=0.003)。HRDとTILによるpCR予測結果は、HRD陽性/TIL陽性 56%、陽性/陰性 29%、 陰性/陽性 18%、陰性/陰性 6%であった。HRD関連遺伝子のgermline mutationが12例(BRCA1 2例、BRCA2 8例、PALB2 1例、RAD54B 2例、1例は重複)に認められ、8例はHRD 陽性(67%)であった。
HRD 陽性乳癌は陰性乳癌に比べNAC感受性が高く、TILとの組合せがpCR予測に有用であった。HRD関連遺伝子のgermline mutation保因者の乳癌はHRD陽性率が高かった。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Determining homologous recombination deficiency scores with whole exome sequencing and their association with responses to neoadjuvant chemotherapy in breast cancer.2021

    • 著者名/発表者名
      Kim SJ, Sota Y, Naoi Y, Honma K, Kagara N, Miyake T, Shimoda M, Tanei T, Seno S, Matsuda H, Noguchi S, Shimazu K.
    • 雑誌名

      Transl Oncol.

      巻: 14 ページ: 100986

    • DOI

      10.1016/j.tranon.2020.100986

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 術前化学療法施行乳癌症例を対象としたWhole Exome SequencingによるHomologous Recombination Deficiency Score解析2020

    • 著者名/発表者名
      金昇晋, 草田義昭, 直居靖人, 加々良尚文, 三宅智博, 下田雅史, 島津研三, 野口眞三郎
    • 学会等名
      日本乳癌学会
  • [学会発表] 術前化学療法施行乳癌症例を対象としたWhole Exome SequencingによるTumor Mutational BurdenとMicrosatellite Instabilityの解析2020

    • 著者名/発表者名
      草田義昭、金昇晋、加々良尚文、三宅智博、直居靖人、下田雅史、多根井智紀、島津研三、野口眞三郎
    • 学会等名
      日本乳癌学会

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公開日: 2021-12-27  

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