2020 年度研究成果報告書

妊娠期間中の遺伝子発現変動と遺伝要因との関連性の探索によるデータベース構築

研究課題

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研究課題/領域番号	18H03326
研究種目	基盤研究(B)
配分区分	補助金
応募区分	一般
審査区分	小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
研究機関	京都大学
研究代表者	長崎正朗京都大学, スーパーグローバルコース医学生命系ユニット, 特定教授 (90396862)
研究期間 (年度)	2018-04-01 – 2021-03-31
キーワード	RNAシークエンシング / eQTL / 妊娠期間 / 遺伝要因探索 / 全ゲノムシークエンシング / マタニティログ
研究成果の概要	日本人妊婦約300名の全ゲノム情報と妊娠期間、前期、中期、出産後の3点のRNAシークエンス情報を情報解析し、RNAの各時点および、時点間の変化のプロファイルを構築するとともに、同一妊婦の全ゲノムシークエンス情報を用い、これらのRNAプロファイルと相関する遺伝要因の探索を行った。また、これらの情報について整理を行い重要なRNAと個人の変異情報との関連のデータベースを構築した。
自由記述の分野	バイオインフォマティクス
研究成果の学術的意義や社会的意義	妊娠期間中における妊娠期間毎の一般集団と健常妊婦における日本人のeQTLデータベースを世界で初めて構築した。当データベースは、今後得られてくるRNA転写物、プロテオームなどのマーカーについて個人毎の遺伝的な背景を検討するための貴重な情報資源の１つとなる。さらに、国内外のゲノムワイド関連解析によって得られたデータベースGWASCatalog等で報告されているSNPについて当該データベースに関連したSNPも得られていることから、妊娠期間毎の解析に限らず、日本人の遺伝要因と転写物の発現解析にも幅広く活用できる。