研究課題
ターゲットキャプチャーと大規模並列シーケンシングにテナガザル3種6個体を追加し、テナガザルをこれまでと合わせて10種15個体とした。全ゲノム配列決定された個体と同じノドジロオマキザル1個体を追加し、全ゲノム配列とターゲットキャプチャーの直接比較を行えるようにした。また、golden lion tamarinを1個体とCelebes crested macaqueを1個体追加した。ヒトにおいては、ミャンマーの多様な民族から96個体を解析に加えた。配列のショートリードの参照配列に対するマッピングとアセンブル方法の改良を検討した。ヒトの嗅覚受容体遺伝子レパートリーの集団間と集団内の構成の比較を進展させた。テナガザル10種15個体について苦味受容体遺伝子のターゲットキャプチャーと大規模並列シーケンシングによる配列解析を進展させた。アフリカ・アジアのサルの苦味受容体レパートリーの種間比較を進展させた。中南米サルの嗅覚受容体レパートリーの種間比較を進展させた。中南米のサル、アジア・アフリカのサル、類人猿、ヒトにおけるL-Mオプシン遺伝子間塩基相違度解析をさらに前進させ、LとMオプシンの分岐の起源について解析を進めた。エクアドルの広鼻猿類についてL/Mオプシンの遺伝子型を決定し、アリル頻度構成の種間比較を行った。ノドジロオマキザルの全ゲノム配列決定を行い嗅覚受容体の遺伝子構成を調査した。色覚遺伝子進化のモデルとして重要な小型魚類のメダカについて遺伝子重複した中波長感受型オプシンRH2の種間解析を行い、波長感受性のパラログ間の相違が遺伝子変換に抗して自然選択で維持されていることを明らかにした。
2: おおむね順調に進展している
配列のショートリードの参照配列に対するマッピングとアセンブル方法を改良した。エクアドルの広鼻猿類についてL/Mオプシンの遺伝子型を決定し、アリル頻度構成の種間相違には種間のニッチ棲み分けが関わることを示した。ノドジロオマキザルの全ゲノム配列決定を行い嗅覚受容体の遺伝子構成をPNAS誌に発表した。
ミャンマーの多様な民族について嗅覚受容体、苦味受容体、旨味甘味受容体、L・M・Sオプシン、noncoding中立対照のゲノム領域のターゲットキャプチャーと大規模並列シーケンシングの結果の解析を進展させる。テナガザル10種15個体について嗅覚受容体遺伝子と味覚受容体遺伝子のターゲットキャプチャーと大規模並列シーケンシングによる配列解析を進展させる。アジア・アフリカのサルについて嗅覚受容体と味覚受容体遺伝子のターゲットキャプチャーと大規模並列シーケンシングによる配列解析を進展させる。中南米のサルについて嗅覚受容体と味覚受容体遺伝子のターゲットキャプチャーと大規模並列シーケンシングによる配列解析を進展させる。メガネザルと曲鼻猿について嗅覚受容体と味覚受容体遺伝子のターゲットキャプチャーと大規模並列シーケンシングによる配列解析を進展させる。
すべて 2021 2020 その他
すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 7件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 2件、 招待講演 6件) 備考 (2件)
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