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2020 年度 実績報告書

ゴルジ体を中心とした選別輸送機構の超解像ライブイメージングによる完全解明

研究課題

研究課題/領域番号 18H05275
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

中野 明彦  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 副センター長 (90142140)

研究分担者 黒川 量雄  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 専任研究員 (40333504)
戸島 拓郎  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 上級研究員 (00373332)
植村 知博  お茶の水女子大学, 理系女性教育開発共同機構, 准教授 (90415092)
須田 恭之  筑波大学, 医学医療系, 助教 (10553844)
研究期間 (年度) 2018-06-11 – 2023-03-31
キーワード膜交通 / ゴルジ体 / 選別輸送
研究実績の概要

酵母細胞を用いた研究:①小胞体からゴルジ体への積荷の受け渡し。小胞体出口ERESにおける積荷選別の過程をライブイメージングで解析した(Sci. Adv. 誌発表)。また、ゴルジ体で積荷を受け取る初期区画GECCOで機能する分子の時空間的分離を解析した。②ゴルジ槽間の輸送に働くCOPIの変異により、一部のゴルジ体タンパク質が液胞に運ばれて分解されることを見出した。③ゴルジ体とTGNでのタンパク質選別の時空間的制御。ゴルジ体とTGNの境界に位置し、選別の鍵を握る分子をいくつか同定し、その挙動をライブイメージングで解析した。
植物細胞を用いた研究:①ゴルジ体初期区画GECCOによる小胞体からの積荷の受け取り。ゴルジ体の最もcis側の区画(GECCO)の研究をさらに進めた。②TGNでの複数経路の仕分けの時空間的制御。さまざまな被覆タンパク質およびアダブター複合体がTGNで集積・離散するダイナミクスを時空間的に解析した。AP-1とAP-4がそれぞれ分泌経路選別ゾーンと液胞経路選別ゾーンに集積することを示し、前者ではたらくクラスリン被覆小胞の挙動について詳細な4D解析を行った(Nat. Commun. 誌発表)。
動物細胞を用いた研究:①HeLa細胞を用い、TGNにおける積荷選別についてRUSHシステムと多色SCLIMによる4Dライブイメージングを開始した。②HeLa細胞およびショウジョウバエのS2細胞において、ゴルジ体層板とTGN/リサイクリングエンドソームが接着と解離を繰り返すことを見出し、またゴルジ体層板の集合にはArf GTPaseの活性化が関与していることを示した(J. Cell Sci. 誌発表、広島大学佐藤明子博士との共同研究)。③神経軸索におけるゴルジ体の役割。神経軸索成長円錐において、ゴルジ体の動態を観察した。積荷の挙動を観察できる新しいシステムの構築を進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

酵母を用いた実験系で、タンパク質選別輸送の詳細な4Dライブイメージング解析を進め、ERESからゴルジ体cis槽へ、ゴルジ体内、ゴルジ体trans槽からTGNへ、そしてTGNから最終目的地へ、というプロセスで鍵を握る役者はほぼ把握できた。
植物と動物のゴルジ体に関する研究も順調に進んでいる。TGNについて、ゴルジ体以降の膜輸送過程の重要なハブとして機能している独立のオルガネラと考えられる証拠として、ゴルジ層板から離れて存在するTGNが、これまでリサイクリングエンドソームと認識されていた区画とほぼ同一のものであることを示し、動物と植物とでの驚くべき類似性を明らかにした。酵母での研究結果と統合して、膜交通の基礎概念を再び種を超えたパラダイムとして打ち立てる時が近づいている。
次世代SCLIM機、SCLIM2KとSCLIM2Mも順調に稼働し、高い時空間能を生かした成果を生みつつある。

今後の研究の推進方策

生きた細胞内の小胞輸送をありのままに目で見る技術が実現できている。予定した研究計画通り、異なる生物種のゴルジ体とその周辺オルガネラについて、徹底的な観察を行い、従来の生化学や遺伝学の実験結果に基づいて想像されていたモデルを一つ一つ検証していく。とくに、小胞体-ERES-cis Golgi-trans Golgi-TGNという流れの節目の選別過程で,重要な役割を果たす分子を相当数同定できた。今後、これらの役者がどのようにして異なる積荷を認識し、時空間的に分離させていくのかについて、さらなる研究を進めて行く予定である。

  • 研究成果

    (39件)

すべて 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 5件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (24件) (うち国際学会 1件、 招待講演 7件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] University of Sevilla/Instituto de Biomedicina de Sevilla(スペイン)

    • 国名
      スペイン
    • 外国機関名
      University of Sevilla/Instituto de Biomedicina de Sevilla
  • [国際共同研究] Institute of Biochem and Cell Biol/Institute of Nanotechnology/Istituto Nazionale Tumori Fondazione(イタリア)

    • 国名
      イタリア
    • 外国機関名
      Institute of Biochem and Cell Biol/Institute of Nanotechnology/Istituto Nazionale Tumori Fondazione
  • [国際共同研究] University of Geneva/University of Fribourg(スイス)

    • 国名
      スイス
    • 外国機関名
      University of Geneva/University of Fribourg
  • [国際共同研究] Institute Curie(フランス)

    • 国名
      フランス
    • 外国機関名
      Institute Curie
  • [雑誌論文] Golgi maturation‐dependent glycoenzyme recycling controls glycosphingolipid biosynthesis and cell growth via GOLPH32021

    • 著者名/発表者名
      Rizzo Riccardo、Russo Domenico、Kurokawa Kazuo、Nakano Akihiko、Corda Daniela、D’Angelo Giovanni、Luini Alberto et al.
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: 印刷中 ページ: e107238

    • DOI

      10.15252/embj.2020107238

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Cargo sorting zones in the trans-Golgi network visualized by super-resolution confocal live imaging microscopy in plants2021

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Yutaro、Takagi Junpei、Ito Emi、Ito Yoko、Ebine Kazuo、Komatsu Yamato、Goto Yumi、Sato Mayuko、Toyooka Kiminori、Ueda Takashi、Kurokawa Kazuo、Uemura Tomohiro、Nakano Akihiko
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 ページ: 1901

    • DOI

      10.1038/s41467-021-22267-0

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 超解像ライブイメージング顕微鏡SCLIMの開発とSCLIMによるゴルジ体タンパク質輸送機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      黒川量雄,宮代大輔,中野明彦
    • 雑誌名

      レーザー研究

      巻: 49 ページ: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deletion of PIN4 Suppresses the Protein Transport Defects Caused by sec12-4 Mutation in Saccharomyces cerevisiae2020

    • 著者名/発表者名
      Murakami-Sekimata Akiko、Sekimata Masayuki、Sato Natsumi、Hayasaka Yuto、Nakano Akihiko
    • 雑誌名

      Microbial Physiology

      巻: 30 ページ: 25~35

    • DOI

      10.1159/000509633

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Tricalbins Are Required for Non-vesicular Ceramide Transport at ER-Golgi Contacts and Modulate Lipid Droplet Biogenesis2020

    • 著者名/発表者名
      Ikeda Atsuko、Schlarmann Philipp、Kurokawa Kazuo、Nakano Akihiko、Riezman Howard、Funato Kouichi
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 23 ページ: 101603

    • DOI

      10.1016/j.isci.2020.101603

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ceramide chain length-dependent protein sorting into selective endoplasmic reticulum exit sites2020

    • 著者名/発表者名
      Rodriguez-Gallardo Sofia、Kurokawa Kazuo、Sabido-Bozo Susana、Cortes-Gomez Alejandro、Ikeda Atsuko、Zoni Valeria、Aguilera-Romero Auxiliadora、Perez-Linero Ana Maria、Lopez Sergio、Waga Miho、Araki Misako、Nakano Miyako、Riezman Howard、Funato Kouichi、Vanni Stefano、Nakano Akihiko、Muniz Manuel
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 6 ページ: eaba8237

    • DOI

      10.1126/sciadv.aba8237

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The liverwort oil body is formed by redirection of the secretory pathway2020

    • 著者名/発表者名
      Kanazawa Takehiko、Morinaka Hatsune、Ebine Kazuo、Shimada Takashi L.、Ishida Sakiko、Minamino Naoki、Yamaguchi Katsushi、Shigenobu Shuji、Kohchi Takayuki、Nakano Akihiko、Ueda Takashi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 6152

    • DOI

      10.1038/s41467-020-19978-1

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Sec71 separates Golgi stacks in Drosophila S2 cells2020

    • 著者名/発表者名
      Fujii Syara、Kurokawa Kazuo、Tago Tatsuya、Inaba Ryota、Takiguchi Arata、Nakano Akihiko、Satoh Takunori、Satoh Akiko K.
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 133 ページ: jcs245571

    • DOI

      10.1242/jcs.245571

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Apoplastic Fluid Preparation from Arabidopsis thaliana Leaves Upon Interaction with a Nonadapted Powdery Mildew Pathogen2020

    • 著者名/発表者名
      Nakano Ryohei Thomas、Ishihama Nobuaki、Wang Yiming、Takagi Junpei、Uemura Tomohiro、Schulze-Lefert Paul、Nakagami Hirofumi
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2139 ページ: 79~88

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-0528-8_6

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Live-cell Imaging by Super-resolution Confocal Live Imaging Microscopy (SCLIM): Simultaneous Three-color and Four-dimensional Live Cell Imaging with High Space and Time Resolution2020

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa Kazuo、Nakano Akihiko
    • 雑誌名

      BIO-PROTOCOL

      巻: 10 ページ: e3732

    • DOI

      10.21769/BioProtoc.3732

    • 査読あり
  • [学会発表] 植物TGNにおけるタンパク質輸送選別ゾーンの可視化2021

    • 著者名/発表者名
      植村知博
    • 学会等名
      第22回植物オルガネラワークショップ
    • 招待講演
  • [学会発表] 出芽酵母におけるトランスゴルジ網の槽成熟ダイナミクス2021

    • 著者名/発表者名
      戸島拓郎
    • 学会等名
      第22回植物オルガネラワークショップ
    • 招待講演
  • [学会発表] 植物 RAB5 のエフェクターを介した機能実行メカニズムの解析2021

    • 著者名/発表者名
      伊藤瑛海,崔勝媛,竹内一貴,海老根一生,中野明彦,上田貴志,植村知博
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] Syntaxin6 N 末端領域を有する植物固有タンパク質の細胞内局在の解析2021

    • 著者名/発表者名
      長尾レイナ,清水優太朗,藤倉崇紘,伊藤瑛海,由良敬,中野明彦,植村知博
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] シロイヌナズナ Rab6/RABH1 の機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      大堀智博,伊藤瑛海,中野明彦,上田貴志,植村知博
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] 病原菌応答における植物分泌システムの役割2021

    • 著者名/発表者名
      遠藤彩瑛,伊藤瑛海,中野明彦,植村知博
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] シロイヌナズナ VAMP714 の細胞内局在の解析2021

    • 著者名/発表者名
      江口倫子,遠藤彩瑛,伊藤瑛海,中野明彦,植村知博
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] TGN-液胞間の輸送が制御する塩ストレス応答2021

    • 著者名/発表者名
      井上柚紀,清水優太朗,伊藤瑛海,中野明彦,植村知博
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] 膜交通制御因子 SYP61 による塩ストレス応答制御におけるユビキチンシグナルの関与2021

    • 著者名/発表者名
      新井麻由,長谷川陽子,Yongming Luo,椋田航生,植村知博,高木純平,山口淳二,佐藤長緒
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] ユビキチンシグナルと膜交通制御を介した植物の C/N 栄養応答の解析2021

    • 著者名/発表者名
      長谷川陽子,羅永茗,椋田航生,新井麻由,植村知博,Yohann Boutte,中野明彦,山口淳二,佐藤長緒
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] Golgi and next-door neighbors - a comparative view of yeast, plant and animal cells2020

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Nakano
    • 学会等名
      CELL BIO virtual 2020 (Online ASCB | EMBO Meeting)
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 膜交通の新パラダイムを構築しよう2020

    • 著者名/発表者名
      中野明彦
    • 学会等名
      第72回日本細胞生物学会大会
    • 招待講演
  • [学会発表] 4Dライブイメージングによる小胞体,ゴルジ体の積荷タンパク質輸送機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      黒川量雄
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 招待講演
  • [学会発表] 神経成長円錐における膜交通ダイナミクス2020

    • 著者名/発表者名
      戸島拓郎
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞内膜交通の超高時空間分解能ライブイメージング2020

    • 著者名/発表者名
      中野明彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
  • [学会発表] ミトコンドリア- 小胞体間結合因子ERMES 複合体クラスターの解離がER ストレス軽減に寄与する2020

    • 著者名/発表者名
      柿元百合子,小島理恵子,新名真夏,黒川量雄,中野明彦,遠藤斗志也,田村康
    • 学会等名
      第72回日本細胞生物学会大会
  • [学会発表] 小胞体における積荷タンパク質選別輸送機構2020

    • 著者名/発表者名
      黒川量雄,Sofia Gallardo,Manuel Muniz,中野明彦
    • 学会等名
      第72回日本細胞生物学会大会
  • [学会発表] 出芽酵母の胞子形成におけるVps13アダプタータンパク質Spo71の解析2020

    • 著者名/発表者名
      藤枝祐二,棟重賢治,中村毅,須田恭之,舘川宏之
    • 学会等名
      第72回日本細胞生物学会大会
  • [学会発表] 膜交通関連オルガネラの減数分裂に伴う再構成2020

    • 著者名/発表者名
      須田恭之,舘川宏之,黒川量雄,中野明彦,入江賢児
    • 学会等名
      第72回日本細胞生物学会大会
  • [学会発表] 脂質輸送タンパク質Vps13の出芽酵母前胞子膜形成における役割2020

    • 著者名/発表者名
      藤枝祐二,棟重賢治,中村毅,中西秀樹,須田恭之,舘川宏之
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第53回研究報告会
  • [学会発表] Plant-unique RAB5 effector 3の細胞内動態解析2020

    • 著者名/発表者名
      伊藤瑛海,崔勝媛,竹内一貴,海老根一生,中野明彦,上田貴志,植村知博
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
  • [学会発表] 植物のC/N栄養応答におけるユビキチンシグナルと膜交通制御のシロイヌナズナを用いた解析2020

    • 著者名/発表者名
      長谷川陽子,羅永茗,椋田航生,新井麻由,植村知博,Yohann Boutte,中野明彦,佐藤長緒,山口 淳二
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
  • [学会発表] Syntaxin6 N末端領域を有する植物固有タンパク質の細胞内局在の解析2020

    • 著者名/発表者名
      長尾レイナ,清水優太朗,藤倉崇紘,伊藤瑛海,由良敬,中野明彦,植村知博
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
  • [学会発表] シロイヌナズナVAMP714の細胞内局在の解析2020

    • 著者名/発表者名
      江口倫子,遠藤彩瑛,伊藤瑛海,中野明彦,植村知博
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
  • [備考] 中野明彦ラボ

    • URL

      http://sclim.riken.jp

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公開日: 2021-12-27  

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