| 研究課題/領域番号 |
18J00444
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
按田 瑞恵 東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(PD) (60759455)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-25 – 2021-03-31
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| キーワード | プラスミド / 染色体 / rRNA / バクテリア / ゲノム |
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| 研究実績の概要 |
バクテリアのrRNAオペロン（rrn）は、ゲノムで最大のレプリコンである主染色体に存在することが常識とされてきた。近年我々は、そうした従来の常識に従わないバクテリア、すなわち、rRNAオペロンを主染色体に持たずに高コピープラスミド上にのみ持つバクテリアとして、プロテオバクテリア門Aureimonas ureilyticaを発見した。本研究は、rRNAオペロンの主染色体上からの欠失が（１）どの程度一般的な現象なのか、（２）どのようなメカニズムで起こったのか明らかにすることを目的としている。昨年度、スピロヘータ門およびバクテロイデス門から新たに2つのクレードを発見したため、本年度は（２）に向けて取り組んだ。まず、rrnの存在するプラスミド（rrn-plasmid）のコピー数を定量したところ、スピロヘータ門は高コピーだったが、バクテロイデス門は分配遺伝子parの存在に関わらず低コピーだった。また、rrn-plasmidには1-3コピーのrrnがコードされており、細胞あたりのコピー数に換算すると10-15コピーと高い値だった。近縁種では染色体に2-4コピーのrrnが存在していることから、rrnが染色体からプラスミドへと移行することで細胞あたりのrrnのコピー数が増加したことが示唆された。次に、近縁株との比較ゲノム解析を行い、rrnをプラスミドだけで維持するバクテリアに共通して増減している遺伝子を探索した。この結果、複数の候補遺伝子を得ることができ、個々の分子メカニズムを考察している。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
rrn-plasmidのコピー数の定量と比較ゲノム解析について、概ね予定通りに進展したため。
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| 今後の研究の推進方策 |
比較ゲノム解析で得られた候補遺伝子について実験的に検証する。
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