• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2020 年度 実績報告書

極限環境生物クマムシのDNA損傷修復機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 18J21155
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

吉田 祐貴  慶應義塾大学, 政策・メディア研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2018-04-25 – 2021-03-31
キーワードクマムシ / DNA損傷 / 酸化ストレス / トランスクリプトミクス
研究実績の概要

2020年度は2019年度に引き続きDNA損傷因子への応答を調査するために、以下の研究を進めた。
[DNA損傷薬剤への応答] 当初はヨコヅナクマムシを用いる計画であったが、飼育の状態が安定しなかったためより飼育しやすいエグゼンプラリスヤマクマムシを対象とした。まず曝露条件を検討すべく、様々な濃度でDNA損傷薬剤であるBleomycinをエグゼンプラリスヤマクマムシに24時間曝露したところ、100-400uMであれば致死量に到達せず、細胞内でストレスが発生することに起因すると思われる活動量の減少が見られた。これより100uMを曝露条件と決定し、曝露後24時間に渡って経時的なRNA-Seq解析を実施し、乾眠移行中のトランスクリプトームの変動と比較した。その結果、エグゼンプラリスヤマクマムシの乾眠移行中およびbleomycin応答中の早期から中期にかけての2条件で、抗酸化経路やアミノ酸代謝に関わる遺伝子が濃縮されることが明らかとなった。また、これまでヨコヅナクマムシの解析では見られなかったクマムシ特有の防御タンパクの発現誘導が見られ、先に報告したヨコヅナクマムシとエグゼンプラリスヤマクマムシの乾眠様式の違いの関与が示唆された。
[クマムシ特異的な新規抗酸化遺伝子ファミリー] 昨年度報告したクマムシにのみ広く保存される新規の抗酸化遺伝子について機能解析を進めた。立体構造の決定およびin vitro実験系によってこのタンパクは新規の抗酸化タンパク質であることが確認された。本研究については論文としてまとめ、現在投稿中である。
[ヨコヅナクマムシのガンマ線照射への応答] 初年度に実施したヨコヅナクマムシをガンマ線に曝露したのちの経時的RNA-Seq解析データをデータ論文としてまとめ、Data in Brief誌にて採択された。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] RNA sequencing data for gamma radiation response in the extremotolerant tardigrade Ramazzottius varieornatus2021

    • 著者名/発表者名
      Yuki Yoshida; Daiki D. Horikawa; Tetsuya Sakashita; Yuichiro Yokota; Yasuhiko Kobayashi; Masaru Tomita; Kazuharu Arakawa
    • 雑誌名

      Data in Brief

      巻: - ページ: -

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] オミクス解析による緩歩動物特異的な新規抗酸化タンパクファミリーの探索2020

    • 著者名/発表者名
      吉田祐貴, 佐藤匡史, 太田知世, 堀川大樹, 冨田勝, 加藤晃一, 荒川和晴
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
  • [学会発表] オミクス解析による緩歩動物特異的な新規抗酸化遺伝子の探索2020

    • 著者名/発表者名
      吉田祐貴, 佐藤匡史, 太田知世, 堀川大樹, 冨田勝, 加藤晃一, 荒川和晴
    • 学会等名
      クマムシ学研究会

URL: 

公開日: 2021-12-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi