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2020 年度 実績報告書

ヘテロ結合型力学モデルの構造設計による機能創生プロセスの探求

研究課題

研究課題/領域番号 18K03471
研究機関大阪電気通信大学

研究代表者

柳田 達雄  大阪電気通信大学, 工学部, 教授 (80242262)

研究分担者 中尾 裕也  東京工業大学, 工学院, 教授 (40344048)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワードハミルトン力学 / 緩和現象 / 多時間スケール / 高分子モデル / ビーズスプリングモデル / 準平衡状態 / 非線形ダイナミクス / 非一様エネルギー
研究実績の概要

自然界には外乱や環境変化に抗して安定に機能するシステムが多く存在する.例えば,中枢パターン生成神経網では,ニューロン同士の結合構造がリズミック な動物の運動を創生している.また,共有結合・分子結合,分岐やループなどの結合構造による局所運動が生体高分子の機能に関与している.これら機能の創出 には,ヘテロな結合構造とそれにより生成される多スケールダイナミクスが重要な役割を担っていると考えられている.
本年度は,生体高分子を模した具体的な力学モデル(質点がバネでつながったモデルでありビーズスプリングモデルと呼ばれる)の力学的な振る舞いを数値および解析的に研究した.特に,異なる運動の時間スケールをシステムが内包している場合における熱平衡状態への緩和過程を解析した.このような多時間スケールをもつ分子と溶媒粒子が相互作用する場合には,溶媒粒子の運動エネルギーが分子のそれよりも大きくなる状態が長時間維持される準平衡状態を見出し,エネルギー等分配則を適用することにより定量的な予測をし,現在論文投稿中である.
このような,ヘテロな結合構造が生み出す局所的な運動や揺らぎが機能と密接に関係している事がアクトミオシン系などにおいて示唆されており,モデル系で観測された不均一運動も生体分子の機能と密接に関連していると考えられる.
このような多時間スケール分子の高周波の伸長運動モードの励起にともなう新奇な現象を見出した.これは,運動の励起に伴い剛性が動的に創生されるという現象である.特異摂動法により詳細な数理解析による動的剛性の創出に関する学術論文を投稿準備中である.この現象は,多スケールダイナミクスやヘテロなエネルギー励起が生み出す,不均一運動と考えられ,生体分子の機能との関連が強いと考えられる.

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Sparse optimization of mutual synchronization in collectively-oscillating networks2021

    • 著者名/発表者名
      Hiroya Nakao, Katsunori Yamaguchi, Shingo Katayama, and Tatsuo Yanagita
    • 雑誌名

      Chaos

      巻: 28 ページ: 045103-045103

    • DOI

      10.1063/1.5009669

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nonlinear phase-amplitude reduction of delay-induced oscillations2020

    • 著者名/発表者名
      Kotani Kiyoshi、Ogawa Yutaro、Shirasaka Sho、Akao Akihiko、Jimbo Yasuhiko、Nakao Hiroya
    • 雑誌名

      Physical Review Research

      巻: 2 ページ: 033106-033122

    • DOI

      10.1103/PhysRevResearch.2.033106

    • 査読あり
  • [学会発表] 強結合 Bead-Spring 分子の準平衡状態の解析2021

    • 著者名/発表者名
      柳田達雄,小西哲郎
    • 学会等名
      日本物理学会 第76回年次大会
  • [学会発表] 束縛鎖状系の運動エネルギーと分散の質量比依存性2021

    • 著者名/発表者名
      小西哲郎,柳田達雄
    • 学会等名
      日本物理学会 第76回年次大会
  • [学会発表] Dynamics of bead-spring model in quasi-equilibrium2021

    • 著者名/発表者名
      Tatsuo Yanagita
    • 学会等名
      Mathematical Science of Complex Systems: Physics, Chemistry, Biology, Information and Chaos
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Continuous Measurement and Feedback Control for Enhancement of Quantum Synchronization2020

    • 著者名/発表者名
      Yuzuru Kato and Hiroya Nakao
    • 学会等名
      Proceedings of the 59th IEEE Conference on Decision and Control (CDC)
    • 国際学会

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公開日: 2021-12-27  

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