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2020 年度 実績報告書

センサータンパク質を駆動系とする人工タンパク質超分子マシンの構築

研究課題

研究課題/領域番号 18K04906
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

山中 優  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教 (60632825)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2022-03-31
キーワード四次構造変 / タンパク質超分子
研究実績の概要

令和2年度は、ドメインスワップ構造をベースにCO結合に伴い二量体が乖離する常温菌CP(AVCP)と閉環状3量体を形成する人工タンパク質BBPl9を融合した改変タンパク質AVCP/N-BBPl9-AVCP/C (ABA)について、超分子化およびリガンド応答性挙動を調べた。ABAは高濃度条件下でpH >6での加熱処理およびエタノール処理により多量体を形成した。サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)解析から、ABA多量体はCOまたはイミダゾールの結合により可逆的にサイズの小さな成分(単量体、2~3量体、4~5量体に相当する溶出位置を示す成分)に解離した。絶対分子量を調べることができる多角度光散乱(MALS)とSECを組み合わせたSEC-MALS測定によりABA多量体の構成成分の詳細を調べたところ、ABA多量体は単量体、2量体、3量体を構成成分とすることが分かった。リガンド結合によりABA多量体が乖離して得られる2量体を精製しリガンドを脱離させると、2x2量体および2x3量体と推定される高次多量体を形成した。2x2量体と2x3量体は平衡状態であり、pH <6で平衡は抑制された。高速分子間力顕微鏡によりこれらの高次多様体の構造解析を行ったところ、2x2量体はひし形状、2x3量体は3角形状をしていた。また、これらの高次多量体はpH>6でリガンド結合により小さなサイズの分子へと乖離することも示された。リガンド結合によりABA多量体が乖離して得られる3量体を精製してリガンドを脱離させると、低濃度条件下では2x3および4x3と推定される高次多量体が形成し、高濃度条件下ではゲル化した。ゲルに再度リガンドを添加するとゲルは溶解した。以上から、ABAはAVCP部分のCO応答性構造変化を維持して3量体・2量体に超分子化し、これらが会合することでリガンド応答性を示す高次多量体が形成したことが示された。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2021 2020

すべて 学会発表 (4件)

  • [学会発表] センサータンパク質を駆動系として組み込んだビルディングブロックタンパク質の超分子化2021

    • 著者名/発表者名
      吉田充希、山中優、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第101春季大会
  • [学会発表] センサータンパク質を駆動系として組み込んだビルディングブロックタンパク質の二量体の性質と挙動2021

    • 著者名/発表者名
      山中優、内橋貴之、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第101春季大会
  • [学会発表] Construction of Structure-Switchable Protein Supramolecules using Fusion Proteins Designed Based on 3D Domain Swapping2020

    • 著者名/発表者名
      Masaru Yamanaka, Takayuki Uchihashi, Shun Hirota
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
  • [学会発表] The Design of Artificial Domain-Swapped Dimers by Polyproline Rod Insertion2020

    • 著者名/発表者名
      Shota Shiga, Masaru Yamanaka, Wataru Fujiwara, Shun Hirota, Shuichiro Goda, Koki Makabe
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会

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公開日: 2022-12-28  

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