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2018 年度 実施状況報告書

ラマンスペクトル変化の深層学習による細胞の力学応答解析手法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 18K04977
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

安國 良平  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教 (40620612)

研究分担者 新岡 宏彦  大阪大学, データビリティフロンティア機構, 特任准教授(常勤) (70552074)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワードフェムト秒レーザー誘起衝撃力 / メカノレスポンス / 単一細胞解析 / 顕微蛍光分光
研究実績の概要

本研究では、これまで申請者が培ってきた集光フェムト秒レーザーを用いた動物細胞への力学的刺激の付加、顕微分光技術による細胞の生理応答測定、ディープラーニングによる解析を組み合わせ、細胞が識別している本質的な力学的刺激の詳細を明らかにする新しい手法を開発し、細胞の力学応答の作動機構の解明を目指している。
平成30年度ではまず細胞近傍の培養液中へ集光するフェムト秒レーザーのパルス強度、繰り返し周波数、パルス数、集光点と細胞との距離を変え、発生するキャビテーションバブルの高速度イメージングによって、レーザーが誘起する衝撃力が細胞に与える力の大きさに関する時空間的プロファイルを明らかにした。
次にラマン散乱測定に先駆けてシグナル検出が容易な顕微蛍光測定によってレーザー誘起衝撃力が細胞機能へ与える影響を検討した。蛍光イメージングのためにpH感受性のある蛍光色素SNARF-1を細胞に導入し、レーザー誘起衝撃力を与える前後の蛍光スペクトル変化からレーザー誘起衝撃力が細胞のpH調節能へ与える影響を測定した。
その結果、衝撃力の付加後、細胞内のpHが一時的に変化することが明らかになり、衝撃力により細胞に致死的なダメージを与えることなく細胞のpH調節能を制御できる可能性が示された。またこのような細胞の応答は細胞の初期状態にも大きく依存することが明らかになり、単一細胞の制御においては刺激の制御と共に細胞状態をパラメータ化することが重要であることが示唆され、今後の機械学習における細胞制御に向けて重要な知見を得ることができた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の計画通り、レーザー誘起衝撃力により細胞の生理応答として細胞のシグナル伝達が生じ、細胞状態が様々に変化することを示唆する結果が得られている。
今後は、ラマン散乱測定、若しくは蛍光スペクトルのデータ量を増やすことで機械学習を行い、細胞状態に変化を与えるレーザーパラメータのクラスター化を実現できる。

今後の研究の推進方策

次年度ではより一般的な細胞状態を表す蛍光スペクトルとして、細胞の発現させた蛍光タンパク質の蛍光スペクトルを指標に使い、衝撃力の作用前後における蛍光スペクトルとレーザーのパラメータを機械学習により解析することで、レーザーを用いて、細胞状態を任意の状態へ変化させる方法論を開発する。その後ラマン散乱測定へ手法を拡張し、分子網羅的な細胞応答計測に基づいた細胞機能制御法の開発を目指す。

次年度使用額が生じた理由

本年度はすでに所有する光学素子で蛍光測定による原理検証を実行した。次年度はより高感度な顕微分光を行うために追加の光学素子の購入を予定している。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2019 2018

すべて 学会発表 (5件) (うち招待講演 1件)

  • [学会発表] Spectroscopic Evaluation of Cellular Response to Femtosecond Laser Induced Impulse2019

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Ide, Sohei Yamada, Kazunori Okano, Ryohei Yasukuni and Yoichiroh Hosokawa
    • 学会等名
      Annual Meeting of the Physical Society of Taiwan
  • [学会発表] 近赤外超短パルス レー ザを用いた単一細胞の機能操作2019

    • 著者名/発表者名
      安國 良平 ,小柳 朱里,ルクマナ タウフィク・インドラ ,植栗 陽一,岡野 和宜,山田 壮平,細川 陽一郎
    • 学会等名
      レーザー学会学術講演会第39回年次大会
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞近傍へのフェムト秒レーザー照射による分子導入2018

    • 著者名/発表者名
      小柳朱里, 山田壮平, 岡野和宣, 安國良平, 細川陽一郎
    • 学会等名
      第79回応用物理学会秋季学術講演会
  • [学会発表] フェムト秒レーザー誘起衝撃力に誘導される動物細胞の生理応答2018

    • 著者名/発表者名
      安國 良平, 押川 悠城, 岡野 和宣, 山田 壮平, 細川 陽一郎, Yuan Tsai-Lim, Ho Shu-Wei, Hsu Jung-Lung, Wu Yu-Te, Kao Fu-Jen
    • 学会等名
      第79回応用物理学会秋季学術講演会
  • [学会発表] フェムト秒レーザー誘起衝撃力に誘引される細胞内pH応答2018

    • 著者名/発表者名
      植栗 陽一, 岡野 和宣, 山田 壮平, 安國 良平, 細川 陽一郎
    • 学会等名
      第79回応用物理学会秋季学術講演会

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公開日: 2019-12-27  

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