• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2022 年度 実施状況報告書

養殖環境で生じる多剤耐性遺伝子の細菌プラスミドから染色体への乗り換え機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18K05790
研究機関尚絅大学

研究代表者

野中 里佐  尚絅大学, 生活科学部, 准教授 (70363265)

研究分担者 矢野 大和  国立感染症研究所, 薬剤耐性研究センター, 主任研究官 (20646773)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2024-03-31
キーワード遺伝子伝達 / 多剤耐性プラスミド / トランスポゾン / 薬剤耐性菌 / ビブリオ属 / SE / 養殖場 / チロシンリコンビナーゼ
研究実績の概要

薬剤耐性菌の出現は世界的な問題であり、耐性菌拡大には細菌間の耐性遺伝子のやりとりが重要な役割を果たしていると考えられている。また養殖環境中の耐性菌が未知の遺伝子伝達機構を利用していると考えられたため、我々は養殖場由来の多剤耐性ビブリオ属菌から大腸菌へ薬剤耐性遺伝子が伝達し染色体へ組み込まれる現象について研究を行い、既知のトランスポゾングループには分類できない新規の可動性遺伝因子を明らかにしSEと命名した。これまでに2種類のSEが養殖場由来多剤耐性菌から見つかっていること、およびSEのはたらきにより伝達された多剤耐性プラスミドが受容菌染色体上へ取り込まれることが明らかとなった。これらの結果はSEが養殖場における耐性遺伝子の伝播を介して耐性菌拡大に重要な役割を果たしていることを示唆している。
本研究ではデーターベースを利用してSE類縁の可動性因子の検索を行った結果、SE類縁の可動性因子がビブリオ目およびシュードモナス目等を中心としたγプロテオバクテリアに属する細菌種に限局して分布していることが明らかになった。また約30のSE類縁の可動性因子の存在が明らかになり、レプリコンあたりの平均長や平均コピー数が明らかになった。さらにこれまで知られていなかった薬剤耐性遺伝子や多剤耐性排出ポンプとの関連が新たに明らかになり、SEは海洋環境のみならず臨床での耐性遺伝子の拡大にも寄与している可能性が示唆された。一方、遺伝子破壊実験からはSEを構成する4つのタンパク質はいずれもSEの切り出し・転移に必須であることが示唆された。
今後は国内外の養殖場から分離された薬剤耐性菌を対象にSEのスクリーニングを行い、SEを利用して遺伝子伝達を行う細菌の多様性を明らかにする。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

研究期間の延長を行ったがこれにより当初予定していなかったSEの細菌種における分布が明らかになり、SEを構成する4つの遺伝子が切り出し・転移に必須であることを検証し論文投稿することができたため。なお現在再投稿の審査中である。

今後の研究の推進方策

再投稿に関して必要であれば追加実験を行う。また今後保存株を用いてPCRによりSEの検出を行い、環状化や伝達性について検証し養殖場におけるSEの分布状況から耐性遺伝子拡大への寄与について考察する。

次年度使用額が生じた理由

教育業務および大学業務等の負担割合が増加し、十分な研究時間が確保できなかったため。また新型コロナウイルスにより学外での実験が制約されたため。2023年度は実験補助員を雇用するため残りの研究費の大部分は人件費として使用する予定である。またノートパソコン20万円を購入予定である。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Atypical integrative element with strandbiased circularization activity assists interspecies antimicrobial resistance gene transfer from Vibrio alfacsensis2022

    • 著者名/発表者名
      Lisa Nonaka, Michiaki Masuda, Hirokazu Yano
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 17 ページ: 1-24

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0271627

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 鎖バイアスのある環状化を行う新奇可動遺伝因子SE (strand-biased circularizing integrative element)の提唱2022

    • 著者名/発表者名
      矢野大和、野中里佐
    • 学会等名
      第35回日本微生物生態学会

URL: 

公開日: 2023-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi