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魚類は近縁種間でも表現型に多様なバラエティーが認められる。このような種間差をもたらす遺伝子が同定できれば、養殖魚の品種改良に利用できると期待される。トラフグ属近縁種においても、例えば、トラフグとクサフグは人工的に交雑可能であるほど遺伝的に近縁であるにも関わらず、体サイズや初回成熟年齢などに差が認められる。本研究では、両種の初回成熟年齢に種間差をもたらす遺伝機構を順遺伝学的手法により明らかにすることを目指した。
両種の種間交雑第1世代をトラフグに戻し交雑した家系を用いたQTL解析により、2番、10番染色体上に初回成熟月齢に影響力を持つ領域を同定した。当該領域には、それぞれ456個と388個の予想遺伝子が含まれていた。次に、この候補領域を両種の野生個体のリシーケンスデータを用いてDxy値を算出し、種間で異なる進化パターンを示したゲノム領域に限局した。種間遺伝解析による限局化により、候補遺伝子は各染色体とも30個程度に絞り込まれた。この中には哺乳類において初回成熟関連遺伝子として報告されている遺伝子が存在しており、これらの遺伝子が両種の初回成熟年齢に種間差をもたらす有力な候補と考えられた。一方で、個々の遺伝子の影響力が低かったことから、初回成熟年齢の種間差は当該領域以外の遺伝子を含む多数の遺伝子の影響下にあることが示された。
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