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2020 年度 実績報告書

ポリA鎖を介したmRNAレベルの遺伝子発現制御と栄養源シグナルによる調節

研究課題

研究課題/領域番号 18K06053
研究機関筑波大学

研究代表者

入江 賢児  筑波大学, 医学医療系, 教授 (90232628)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワード酵母 / Ccr4 / Pbp1 / ポリA鎖 / 遺伝子発現制御 / Ccr4-Not複合体
研究実績の概要

本研究では、酵母の①対数増殖期と定常状態におけるポリA鎖の長さと翻訳効率・mRNA安定性の関係、②Ccr4-Not複合体によるポリA鎖の長さと翻訳の調節機構、③栄養源からのシグナルによるCcr4-Not複合体の活性調節機構について明らかにし、mRNAのポリA鎖の長さを介したmRNAレベルでの遺伝子発現制御機構と栄養源シグナルとの関係を解明する。
Ccr4-Not複合体は、ポリA鎖の長さを調節するだけではなく、定常状態における翻訳抑制にも関与するが、このCcr4-Not複合体の機能が酵母の栄養状態によってどのように調節されるかについて解析する。
今年度は、Ccr4-Not複合体のサブユニットCcr4およびPop2の遺伝子ノックアウトの表現型である増殖遅延・温度感受性増殖・遺伝子発現の異常に、ポリA鎖結合タンパク質(Pab1)の結合タンパク質であるPbp1が関与することを見出した。ccr4変異株、pop2変異株の増殖遅延・遺伝子発現の異常はpbp1変異により回復した。逆に、これらの表現型はPbp1の過剰発現によって増悪した。ccr4変異株、pop2変異株の中では、標的mRNA群のポリA鎖が長くなり、そこにPab1とPbp1が多く結合することにより、標的mRNAからの過剰な翻訳が起こり、増殖遅延・温度感受性増殖・遺伝子発現の異常などが引き起こされることが示唆された。
また、翻訳開始因子eIF4E結合タンパク質Eap1 がCcr4-Not複合体と増殖制御および遺伝子発現調節において重複した機能を持つこと、Pbp1が培地の栄養源を非発酵性炭素源にした時の増殖・遺伝子発現制御に重要な役割をもつことを見出した。Eap1とPbp1は、栄養源シグナルによる遺伝子発現調節に機能すると考えられる。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件)

  • [雑誌論文] The eIF4E-binding protein Eap1 has similar but independent roles in cell growth and gene expression with the cytoplasmic deadenylase Ccr4.2021

    • 著者名/発表者名
      Higuchi Y, Fujii S, Valderrama AL, Irie K, Suda Y, Mizuno T, Irie K.
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem.

      巻: in press ページ: in press

    • DOI

      10.1093/bbb/zbab056.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pbp1 mediates the aberrant expression of genes involved in growth defect of ccr4 and pop2 mutants in yeast Saccharomyces cerevisiae.2021

    • 著者名/発表者名
      Valderrama AL, Fujii S, Duy DL, Irie K, Mizuno T, Suda Y, Irie K.
    • 雑誌名

      Genes Cells.

      巻: in press ページ: in press

    • DOI

      10.1111/gtc.12846.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pbp1, the yeast ortholog of human Ataxin-2, functions in the cell growth on non-fermentable carbon sources.2021

    • 著者名/発表者名
      Tuong Vi DT, Fujii S, Valderrama AL, Ito A, Matsuura E, Nishihata A, Irie K, Suda Y, Mizuno T, Irie K.
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: in press ページ: in press

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0251456.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Snf1 AMPK positively regulates ER-phagy via expression control of Atg39 autophagy receptor in yeast ER stress response.2020

    • 著者名/発表者名
      Mizuno T, Muroi K, Irie K.
    • 雑誌名

      PLoS Genet.

      巻: 16 ページ: e1009053

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1009053.

    • 査読あり

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公開日: 2021-12-27  

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