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2019 年度 実施状況報告書

新たなC型糖修飾責任酵素の同定と基質タンパク質の解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K06137
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

清水 史郎  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 教授 (30312268)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワードC型糖修飾 / MFAP4 / フィブリノーゲンC末端領域 / 細胞外分泌
研究実績の概要

C-mannosylation(以降、C型糖修飾)の新規酵素の同定を試みる本研究では、そのために新規な基質タンパク質の同定が重要である。これまでにC型糖修飾を受けるタンパク質の多くは、その配列中にthrombospondin type 1 repeat(TSR)を有しているか、タンパク質自身がタイプIのサイトカイン受容体であった。そこで、本年度はC型糖修飾を受ける新たなタンパク質内領域の同定を試みた。
我々が構築したデータベースを使用し、数百の分泌タンパク質の中から着目したのはFibrinigen C-terminal domain(FCD)である。FCDはその中にC型糖修飾を受けるために必要なコンセンサス配列を有し、またFCDを含むタンパク質は多数あることから解析の対象とした。なお、FCDを含むタンパク質としてはMicrofibril-associated glycoprotein 4(MFAP4)、Fibrinogen-like protein 1(FGL1)そしてangiopoietin-like 4(ANGPTL4)を選定し解析した。
その結果、FGL1およびANGPTL4ではC型糖修飾されていなかったが、MFAP4ではトリプトファンの235がC型糖修飾されており、FCDを持つタンパク質がC型糖修飾されることを世界で初めて発見した。トリプトファン235をフェニルアラニンに置換しC型糖修飾されなくしたMFAP4との比較実験により、MFAP4におけるC型糖修飾は小胞体からゴルジ体への移行に重要であり、結果的に細胞外分泌にも必要であることが示された。
さらにMFAP4におけるC型糖修飾は、C型糖修飾されていないMFAP4の分泌を促すことで細胞外のMFAP4量を調整している可能性を示唆した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

これまでにC型糖修飾が発見されてから25年以上経つが、報告されている基質タンパク質は約30程度であり、同定できたタンパク質領域は上で触れたTSR領域を含むものとタイプIサイトカイン受容体だけであった。現在でも他グループから新規基質タンパク質の報告があるものの、その多くはどちらかに属するものである。
今年度の我々研究グループのチャレンジにより、新たにFCD領域がC型糖修飾されることが示された。しかしながら、FCDを持つタンパク質でもすべてのタンパク質でC型糖修飾されていたわけでなく、試した中ではMFAP4だけであり、FGL1やANGPTL4ではC型糖修飾されていなかった。残念に思われる結果ではあるが、我々はむしろFCD領域の中でもC型糖修飾されやすい配列とそうではない配列がある可能性を考えており、今後の責任酵素同定のためにも大いに役に立つ情報を提供できたものと思われる。
本年度で新規の責任酵素を同定できたわけではないが、新しい基質タンパク質の同定をできたため、「おおむね順調に進展している」と思われる。

今後の研究の推進方策

2020年度はMFAP4以外でFCDを有するタンパク質でもC型糖修飾される例があるか否か探索するとともに、FCD以外の新たなC型糖修飾される領域を発見するために研究を行う。具体的には、我々が構築したデータベースを基に候補タンパク質を絞り込み、当該遺伝子のクローニング、目的細胞への遺伝子導入、安定過剰発現細胞の樹立、リコンビナントタンパク質の精製、質量分析法によるC型糖修飾の評価をする。以上のことより、FCDにおけるC型糖修飾の更なる知見と新たなC型糖修飾される領域の発見につながることができる。
一方で、新規C型糖修飾責任酵素の同定も並行して進める。
以上のことより、これまでに不明な点が多かったC型糖修飾に関する知見を広げることができるものと思われる。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 5件、 招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Identification of vibsanin A analog as a novel HSP90 inhibitor2020

    • 著者名/発表者名
      Miura Kazuki、Matsuki Wataru、Ogura Akihiro、Takao Ken-ichi、Simizu Siro
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      巻: 28 ページ: 115253~115253

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.bmc.2019.115253

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cell-dependent regulation of vasculogenic mimicry by carcinoembryonic antigen cell adhesion molecule 1 (CEACAM1)2020

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Soichiro、Osada Yoshiyuki、Miura Kazuki、Simizu Siro
    • 雑誌名

      Biochemistry and Biophysics Reports

      巻: 21 ページ: 100734~100734

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.bbrep.2020.100734

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Total Synthesis of Natural Products Using Intramolecular Nozaki?Hiyama?Takai?Kishi Reactions2020

    • 著者名/発表者名
      Takao Ken-ichi、Ogura Akihiro、Yoshida Keisuke、Simizu Siro
    • 雑誌名

      Synlett

      巻: 31 ページ: 421~433

    • DOI

      https://doi.org/10.1055/s-0039-1691580

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of topoisomerases as molecular targets of cytosporolide C and its analog2019

    • 著者名/発表者名
      Otake Keisuke、Yamada Kana、Miura Kazuki、Sasazawa Yukiko、Miyazaki So、Niwa Yuki、Ogura Akihiro、Takao Ken-ichi、Simizu Siro
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      巻: 27 ページ: 3334~3338

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.bmc.2019.06.014

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification and characterization of collagen-like glycosylation and hydroxylation of CCN12019

    • 著者名/発表者名
      Ishizawa Yudai、Niwa Yuki、Suzuki Takehiro、Kawahara Ryota、Dohmae Naoshi、Simizu Siro
    • 雑誌名

      Glycobiology

      巻: 29 ページ: 696~704

    • DOI

      https://doi.org/10.1093/glycob/cwz052

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Elucidation of the novel biological activities and molecular target of vibsanin A analog2019

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Miura, Siro Simizu
    • 学会等名
      The 10th Japan-Korea Chemical Biology Symposium
    • 国際学会
  • [学会発表] Cytosporolide C and its analog inhibited activities of topoisomerases and tumor cell growth2019

    • 著者名/発表者名
      川原 遼太、清水 史郎
    • 学会等名
      第78回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] C-mannosylation: identification of novel enzymes and substrates2019

    • 著者名/発表者名
      Siro Simizu
    • 学会等名
      The 7th Symposium RIKEN-Max Planck Joint Research Center
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Fibrinogen C-terminal domainにおけるC型糖鎖修飾の発見2019

    • 著者名/発表者名
      長田 祥征、水田 隼斗、森 研人、鈴木 健裕、三浦 一輝、堂前 直、清水 史郎
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部会2019年度大会
  • [学会発表] Vibsanin A誘導体の新規生物活性評価および作用標的の同定2019

    • 著者名/発表者名
      三浦 一輝、松木 渉、高尾 賢一、清水 史郎
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部会2019年度大会
  • [学会発表] Involvement of C-mannosylation of Isthmin-1 in the its secretion2019

    • 著者名/発表者名
      Siro Simizu, Satoshi Yoshimoto, Kazuhiro Katayama, Takehiro Suzuki, Kazuki Miura, Naoshi Dohmae
    • 学会等名
      25th International Symposium on Glycoconjugates
    • 国際学会
  • [学会発表] Microfibril-associated glycoprotein 4 is C-mannosylated in human cells2019

    • 著者名/発表者名
      Yushiyuki Osada, Takehiro Suzuki, Kazuki Miura, Naoshi Dohmae, Siro Simizu
    • 学会等名
      25th International Symposium on Glycoconjugates
    • 国際学会
  • [学会発表] RAMP1 is C-mannosylated at Trp56 in cultured human cells2019

    • 著者名/発表者名
      Hayato Mizuta, Ayane Takakusaki, Takehiro Suzuki, Keisuke Otake, Kazuki Miura, Naoshi Dohmae, Siro Simizu
    • 学会等名
      25th International Symposium on Glycoconjugates
    • 国際学会
  • [学会発表] ヒトがん細胞においてMFAP4はC型糖修飾を受ける2019

    • 著者名/発表者名
      長田 祥征、鈴木 健裕、三浦 一輝、堂前 直、清水 史郎
    • 学会等名
      第38回日本糖質学会年会
  • [学会発表] FGL1のグルコシルガラクトシルヒドロキシ化が機能に及ぼす影響2019

    • 著者名/発表者名
      森 研人、鈴木 健裕、三浦 一輝、堂前 直、清水 史郎
    • 学会等名
      第38回日本糖質学会年会
  • [学会発表] C型糖修飾によるIsthmin-1への影響2019

    • 著者名/発表者名
      吉本 哲、片山 和洸、鈴木 健裕、三浦 一輝、堂前 直、清水 史郎
    • 学会等名
      第38回日本糖質学会年会
  • [学会発表] 血管擬態形成はCEACAM1によって制御される2019

    • 著者名/発表者名
      清水 史郎、林 聡一郎
    • 学会等名
      第28回 日本がん転移学会学術集会・総会
  • [学会発表] ヒト死後脳の神経細胞におけるLINE-1プロモーターのエピジェネティック修飾状態の検討2019

    • 著者名/発表者名
      渡邊 理紗、文東 美紀、上田 順子、村田 唯、石井 貴男、鵜飼 渉、橋本 恵理、笠井 清登、清水 史郎、加藤 忠史、岩本 和也
    • 学会等名
      第41回日本生物学的精神医学会
  • [学会発表] 細胞接着因子CEACAM1による血管擬態形成の抑制2019

    • 著者名/発表者名
      林 聡一郎、長田 祥征、三浦 一輝、清水 史郎
    • 学会等名
      日本がん分子標的治療学会 第23回学術集会
  • [学会発表] Vibsanin Aの構造活性相関とその誘導体が持つ新規生物活性の評価2019

    • 著者名/発表者名
      三浦 一輝、松木 渉、高尾 賢一、清水 史郎
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会 第14回年会
  • [学会発表] 低分子化合物による細胞機能の解析2019

    • 著者名/発表者名
      清水 史郎
    • 学会等名
      特別講義 長浜バイオ大学
    • 招待講演
  • [備考] 慶應義塾大学 理工学部 応用化学科 生物化学研究室

    • URL

      https://www.applc.keio.ac.jp/~simizu/index.html

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公開日: 2021-01-27  

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