| 研究課題/領域番号 |
18K06291
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| 研究機関 | 岡山大学 |
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研究代表者 |
池田 陽子 岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (80467688)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | 遺伝子サイレンシング / トランスポゾン / シロイヌナズナ |
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| 研究実績の概要 |
植物特異的なトランスポゾン関連ドメインPMDを持つMAIN及びMAIL1タンパク質は、シロイヌナズナにおいて転写型遺伝子サイレンシングに寄与する。これまでの遺伝学的解析により、これらのタンパク質は既知の機構とは異なる機構で転写型遺伝子サイレンシングに関わる事が示唆されているが、その分子機構は不明である。また、これらのタンパク質による転写型遺伝子サイレンシングは、維管束や分裂組織に特異的にみられるが、これまで組織特異的なTGSの制御機構は殆ど明らかになっていない。
これらの点にアプローチするため、2020年度は、前年度までに行ってきた、MAIN及びMAIL1変異の遺伝学的サプレッサーのスクリーニングをさらに進行した。シロイヌナズナmail1変異体の複数のアレルに変異原処理を行った後代の植物集団の中から、mail1変異の表現型を抑圧する個体を選抜し、サプレッサー変異を持つと考えられる個体の解析を進めた。サプレッサー変異を持つ変異体の候補となる個体の後代での表現型を確認して新規サプレッサー候補を絞り込むとともに、シロイヌナズナの別のアクセッションの野生型と掛け合わせ、F２世代でのマッピングと変異体の単離を行い、変異同定のためのシーケンス解析の準備を行った。
一方、MAIN及びMAIL1タンパク質が実際に核内でどのように機能しているかを明らかにするため、FAIRE-seqによりmain/mail1変異体における、クロマチンのアクセッシビリティの解析を行い、その詳細なデータ解析と結果の検討を進めた。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
2019~2020年度の産休、育児休業取得の影響と、新型コロナウイルス対応の影響で所属研究への立ち入りが制限された時期があった影響で、申請時の予定よりやや進捗が遅れている。
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| 今後の研究の推進方策 |
遺伝学的サプレッサーの同定と機能解析を精力的に進めるとともに、MAIN及びMAIL1タンパク質の相互作用因子の単離、核内での機能の解析等の生化学的解析を進め、MAIN及びMAIL1による転写型遺伝子サイレンシングの分子機構を明らかにする。さらに、これらの結果の論文化に向けて準備を進める。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
今年度は新型コロナウイルスの対応により旅費をまったく使用できなかった。さらに、新型コロナウイルスの対応により、今年度計画していた実験内容の一部と、予定していた次世代シーケンス解析の大部分を次年度に回すことを予定している。
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