研究課題/領域番号 |
18K06349
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研究機関 | 岡山大学 |
研究代表者 |
宮地 まり 岡山大学, 医歯薬学総合研究科, 助教 (50349255)
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研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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キーワード | 神経細胞分化 / 核内構造 / 遺伝子発現制御 / 神経特異的遺伝子 |
研究実績の概要 |
神経細胞分化過程での神経特異的遺伝子の発現誘導に重要なDNAトポイソメラーゼIIβ (top2b)に着目し,その個体レベルでの解析をモデル生物メダカを用いて行なった. メダカTop2b遺伝子のノックアウトを行うため,ガイドRNAを設計し,受精卵へのマイクロインジェクションを行なった.3日胚でT7 endonuclease assayにより切断効率を確認した.その後,マイクロインジェクションを行なった個体を1 cm以上になるまで育てて,尾びれを用いてgenotypingを行うことによりG0個体の作成,選択を行なった.得られたG0個体に野生体を掛け合わせることによりF1ヘテロ変異体を作出した.得られたF1ヘテロ変異体の変異領域をPCRで増幅し,クローニングを行なった.得られたクローンのinsertをcolony PCRで増幅し,どのような変異が入っているかを調べた.その結果,修復のされ方の違いにより同じG0の個体から異なる変異をもった個体が得られたことが分かった.それぞれの変異個体を見分けるオリゴDNAを設計し,以後PCRによる変異個体の選択に用いた.変異個体を選択,維持しながら野生体を掛け合わせることにより,F3変異体を作出した.その過程で,ヘテロ変異体同士を掛け合わせたが,ホモ変異体は得られなかった.作出されたF3ヘテロ変異体のうち,Top2b活性中心に変異を導入し,frame-shiftにより,途中までの配列しかないヘテロ変異体の全脳のRNA-seq解析を実施した.得られた結果を解析中である.
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
おおむね計画どおりに進んでいる.
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今後の研究の推進方策 |
他の変異個体もRNA-seq解析を行い,行うべき行動実験を選択する.
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次年度使用額が生じた理由 |
外注でRNA-seq解析を行うにあたりシークエンスのローデータ取得までを外注し,解析は自前で行なったため解析費が安く上がったため,次年度使用額が生じた.研究の進展によりさらにRNA-seq解析が必要になったため,今年度の外注RNA-seq解析のシークエンスデータ取得に当てる予定である.
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