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2018 年度 実施状況報告書

新たなユビキチンリガーゼをリクルートするプロテインノックダウン法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 18K06567
研究機関国立医薬品食品衛生研究所

研究代表者

大岡 伸通  国立医薬品食品衛生研究所, 遺伝子医薬部, 室長 (80568519)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワード標的タンパク質分解 / E3リガーゼ / ユビキチン / プロテアソーム
研究実績の概要

近年、私達が開発したSNIPERもしくは海外のグループが開発したPROTACと呼ばれる化合物によって細胞内の標的タンパク質を選択的に分解する技術(プロテインノックダウン法)が確立され、新しい創薬技術として注目を浴びている。本研究は、プロテインノックダウン化合物の創製に利用できるE3リガーゼを拡充することで、この技術の汎用性をさらに高めることを目的とする。
リガンド依存的に活性化するE3リガーゼとしての機能が知られている核内受容体aryl hydrocarbon receptor (AhR)に対するリガンドの一つであるbeta-naftoflavone(beta-NF)を、cellular retinoic acid binding protein (CRABP)-1やCRABP-2に対する標的リガンドであるAll-trans retinoic acid (ATRA)に繋いだ化合物(beta-NF-ATRA)を合成した。様々ながん細胞株にbeta-NF-ATRAを処理すると、CRABP-1やCRABP-2タンパク質の発現量が低下した。プロテアソーム阻害剤もしくはE1阻害剤処理により、この発現低下はユビキチン・プロテアソーム系による分解に起因することを明らかにした。また、beta-NF-ATRA のbeta-NFを別のAhRリガンドであるalpha-NFや2-(1H-Indol-3-ylcarbonyl)-4-thiazolecarboxylic acid methyl ester (ITE)に置き換えた類似化合物においてもCRABP分解活性が確認されたが、AhRリガンドを繋がない化合物ではCRABP分解活性を示さなかったことから、AhRリガンドがこの分解システムにおいて重要なモジュールであることが示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

研究計画通り、AhRリガンドをE3リガンドとして利用したプロテインノックダウン化合物の創製に成功した。メカニズム解析により、この化合物は想定通りユビキチン・プロテアソーム系による標的タンパク質分解を誘導できること、AhRリガンドを繋ぐことがこの活性に重要であることを明らかにすることができた。これらのことから、本研究は順調に進行していると評価できる。

今後の研究の推進方策

beta-NF-ATRAによる標的タンパク質分解が本当にAhR依存的に起こっているか、この化合物がAhRを標的タンパク質にリクルートする活性があるかなど、さらに詳細な分子メカニズム解析を行う。また、標的タンパク質をCRABPから別のタンパク質に変えてもAhR依存的な標的タンパク質分解が起こるか調べることによりこのシステムの汎用性を明らかにする。

次年度使用額が生じた理由

次年度以降に繰り越しされる研究費が生じた理由としては、年度末の学会の参加費及び旅費が未精算であること、本年度の研究が概ね順調に進展したことから無駄な物品費がかからなかったことが挙げられる。
繰り越し研究費の一部は本年度の未精算の学会参加費及び旅費に使用する予定である。また残りは、本年度の研究の進展から推測される次年度以降の研究計画を考えると物品費が多くかかることが予測されることから、物品費として使用する予定である。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 4件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (5件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Different Degradation Mechanisms of Inhibitor of Apoptosis Proteins (IAPs) by the Specific and Nongenetic IAP-Dependent Protein Eraser (SNIPER)2019

    • 著者名/発表者名
      Ohoka Nobumichi、Ujikawa Osamu、Shimokawa Kenichiro、Sameshima Tomoya、Shibata Norihito、Hattori Takayuki、Nara Hiroshi、Cho Nobuo、Naito Mikihiko
    • 雑誌名

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      巻: 67 ページ: 203~209

    • DOI

      10.1248/cpb.c18-00567

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Development of a Potent Protein Degrader against Oncogenic BCR-ABL Protein2019

    • 著者名/発表者名
      Shibata Norihito、Ohoka Nobumichi、Hattori Takayuki、Naito Mikihiko
    • 雑誌名

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      巻: 67 ページ: 165~172

    • DOI

      10.1248/cpb.c18-00703

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Derivatization of inhibitor of apoptosis protein (IAP) ligands yields improved inducers of estrogen receptor α degradation2018

    • 著者名/発表者名
      Ohoka Nobumichi、Morita Yoko、Nagai Katsunori、Shimokawa Kenichiro、Ujikawa Osamu、Fujimori Ikuo、Ito Masahiro、Hayase Youji、Okuhira Keiichiro、Shibata Norihito、Hattori Takayuki、Sameshima Tomoya、Sano Osamu、Koyama Ryokichi、Imaeda Yasuhiro、Nara Hiroshi、Cho Nobuo、Naito Mikihiko
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 293 ページ: 6776~6790

    • DOI

      10.1074/jbc.RA117.001091

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Development of Protein Knockdown Technology as Emerging Drug Discovery Strategy2018

    • 著者名/発表者名
      Ohoka Nobumichi
    • 雑誌名

      YAKUGAKU ZASSHI

      巻: 138 ページ: 1135~1143

    • DOI

      10.1248/yakushi.18-00113

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Pharmacological difference between degrader and inhibitor against oncogenic BCR-ABL kinase2018

    • 著者名/発表者名
      Shibata Norihito、Shimokawa Kenichiro、Nagai Katsunori、Ohoka Nobumichi、Hattori Takayuki、Miyamoto Naoki、Ujikawa Osamu、Sameshima Tomoya、Nara Hiroshi、Cho Nobuo、Naito Mikihiko
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 ページ: 13549

    • DOI

      10.1038/s41598-018-31913-5

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 新たなユビキチンリガーゼを利用して標的タンパク質を分解するキメラ化合物の開発2019

    • 著者名/発表者名
      大岡伸通
    • 学会等名
      第2回ユビキチン研究会
  • [学会発表] 新たなユビキチンリガーゼを標的タンパク質にリクルートして分解するキメラ化合物の開発2019

    • 著者名/発表者名
      大岡伸通, 辻厳一郎, 正田卓司, 出水庸介, 内藤幹彦
    • 学会等名
      日本薬学会第139年会
  • [学会発表] SNIPERのIAPリガンド誘導体化によるプロテインノックダウン活性及び抗がん活性の改善2018

    • 著者名/発表者名
      大岡伸通, 服部隆行, 内藤幹彦
    • 学会等名
      第22回日本がん分子標的治療学会学術集会
  • [学会発表] SNIPERのIAPリガンド誘導体化によるプロテインノックダウン活性及び抗がん活性の改善2018

    • 著者名/発表者名
      大岡伸通, 服部隆行, 内藤幹彦
    • 学会等名
      第77回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] 芳香族炭化水素受容体ユビキチンリガーゼを利用する新しいプロテインノックダウン技術の開発2018

    • 著者名/発表者名
      大岡伸通, 辻厳一郎, 正田卓司, 藤里卓磨, 出水庸介, 内藤幹彦
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
  • [図書] 実験医学2018年11月号(Next Tech Review)2018

    • 著者名/発表者名
      大岡伸通, 内藤幹彦
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-2513-0

URL: 

公開日: 2019-12-27  

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