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2018 年度 実施状況報告書

新たな代謝相関の提案に向けたELOVL2プロモーター領域DNAメチル化制御の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18K06942
研究機関久留米大学

研究代表者

山本 健  久留米大学, 医学部, 教授 (60274528)

研究分担者 原田 二朗  久留米大学, 医学部, 講師 (10373094)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワードELOVL2 / DNAメチル化 / 糖質代謝 / 代謝相関
研究実績の概要

本研究の核心は、ELOVL2の遺伝子発現制御を介して、ドコサヘキサエン酸(DHA)およびエイコサペンタエン酸(EPA)の生合成に糖代謝が関与するのではないか、との問いを解決することである。
本年度は、肝臓がん由来培養細胞HepG2を用い、異なるグルコース濃度下でのELOVL2遺伝子発現の変化を明らかにし、そらに、その発現変化とプロモーター領域DNAメチル化レベルとの関連を検討した。
1)ELOVL2遺伝子発現の変化:HepG2を低濃度グルコースにて一定期間培養後、0mM 、2.6mM、5.6mM、11.2mM、25.6mM のグルコース濃度となるよう培地を調整し、一定期間培養後のELOVL2遺伝子発現を定量PCRにて検討したところ、グルコース濃度に応じた発現の上昇を認めた。
2)ELOVL2遺伝子プロモーター領域DNAメチル化レベルの変化:上記の条件下でゲノムDNAを抽出し、バイサルファイト処理後、パイロシークエンスを用いてメチル化レベルを定量したところ、グルコース濃度に応じたメチル化レベル変化は認めなかった。
以上の結果から、少なくともHepG2細胞においては、ELOVL2遺伝子発現量はグルコース濃度環境の影響を受けること、そしてその遺伝子発現変化には、プロモーター領域DNAメチル化は寄与していないこと、などが明らかとなった。よって、グルコース濃度変化に対するELOVL2遺伝子発現応答のメカニズムを解明するには、シスではなくトランス因子の検討が今後必要となることが示された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

培養細胞において、糖濃度がELOVL2プロモーターDNAメチル化レベルおよび遺伝子発現レベルにどのような影響を与えるかを明らかにすることが、申請当初の2018年度到達目標の一つであったが、これが達成されたため、おおむね順調に進展したと考えた。

今後の研究の推進方策

次の到達目標は、ELOVL2の遺伝子発現レベルに影響を与えるグルコース濃度培養条件下で、RNAを抽出し、RNA-Seqによって網羅的に遺伝子発現データを取得し、これを用いて、DNAメチル化酵素・脱メチル化酵素群、これらをヌクレオソーム上にリクルートするヒストン修飾を担う酵素遺伝子群(ヒストンH3-K9メチル化酵素群など)などに着目して遺伝子発現の動態を解明することである。

次年度使用額が生じた理由

2018年度は培養細胞実験が主体となったため、RNAseq解析は2019年度に実施することになり、そのための費用が2019年度に繰り越された。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Genome-wide meta-analysis identifies multiple novel loci associated with serum uric acid levels in Japanese individuals.2019

    • 著者名/発表者名
      Nakatochi M, Kanai M, Nakayama A, Hishida A, Kawamura Y, Ichihara S, Akiyama M, Ikezaki H, Furusyo N, Shimizu S, Yamamoto K, et al.
    • 雑誌名

      Commun Biol.

      巻: 2 ページ: 115

    • DOI

      10.1038/s42003-019-0339-0

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Exploration of DNA methylation sites associated with adiponectin levels based on a gene co-expression network and DNA methylation data analysis.2018

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Nakatochi, Sahoko Ichihara, Ken Yamamoto, Tatsuaki Matsubara, Mitsuhiro Yokota
    • 学会等名
      American Society of Human Genetics, 2018 Annual Meeting

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公開日: 2019-12-27  

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