研究課題
string test陽性(粘稠性の高い)肺炎桿菌の収集を実施し、次世代シーケンサーにより解析した。 研究室で保有している肺炎桿菌約200株について、温度条件を変えた状態でstring testを実施した。その結果、室温にて高度粘稠性を示す株は、既知の粘稠性関連因子であるrmpA遺伝子を保有しておらず、未知の因子が関連していることが推察された。その因子について、SNP解析などの比較解析を実施し候補遺伝子の絞り込みを行った。現在もこれらについて変異株を作成するなどして解析を続けている。その傍らで、個別解析として中国由来KPC-2保有string test陽性K. pneumoniaeの解析を実施した。 この株は粘稠性に関与する既知の遺伝子を保有しておらず、K. pneumoniaeの高度粘稠性に関わる新規因子を同定する必要があった。同一の患者より、酷似した遺伝的背景を有するが粘稠性を示さない臨床分離株が存在し、ドラフトゲノム配列を得て比較解析を実施したところ、粘稠性に関与する候補として7遺伝子まで絞り込んだ。現在も原因遺伝子を特定すべく実験的に検討している。上記に示した解析により、肺炎桿菌の粘稠性に関する未知の調節因子はgalactose operon inducer、sialic acid transporter、glycosyltransferaseなど複数が関与していると推定される結果が得られた。これらの解析は現在も実施中である。
すべて 2021 2020
すべて 学会発表 (2件)
