ファージ内在化によるピロリ菌の持続感染機構の検証

2020 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 18K07127
• 研究機関: 麻布大学
• 研究代表者: 内山 淳平 麻布大学, 獣医学部, 講師 (20574619)
• 研究分担者: 松崎 茂展 高知大学, 医学部, 客員教授 (00190439) ; 林 俊治 北里大学, 医学部, 教授 (40260765) ; 阪口 義彦 北里大学, 医学部, 講師 (70403491) ; 三室 仁美 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (80396887)
• 研究期間 (年度): 2018-04-01 – 2021-03-31
• キーワード: ピロリ菌 / ファージ

研究実績の概要

１．KHP30様ファージのピロリ菌内在化に関する遺伝的解析：研究分担者（林俊治 氏）が保有するピロリ菌 約300株からKHP30様ファージ保有に関してPCRスクリーニングを行ために、研究を行った。共同研究者　林 俊治　氏より菌株の譲渡を行った。その中の菌株を現在、培養を行っている。また、PCR用の試料の調製を行った。PCRを行ったものの、ファージの配列は検出されなかった。
２．KHP30様ファージが脱落・再内在化した菌株の網羅的mRNA発現解析：平板寒天培地を使用し、ファージ保有ピロリ菌からファージ脱落ピロリ菌、再度ファージを内在化させたピロリ菌を分離した。ピロリ菌株には、ファージを内在化するKMT83株とNY43株を使用する。種々の培養条件で分離菌を培養し（嫌気培養あるいは微好気培養）、高速シークエンサー（Illumina社MiSeq）による網羅的なmRNA発現解析（RNAseq解析）用の試料調製を行なった。今後、RNA抽出を行い、RTPCRを行った後、高速シークエンサー用のサンプル調製を行いたい。
３．「KHP30様ファージ内在化によるピロリ菌の持続感染能力の検討」に関しては、２の研究が終了しておらず、現在準備中である。

研究成果

• [雑誌論文] Analyses of propagation processes of Staphylococcus aureus bacteriophages S13′ and S25-3 in two different taxonomies by definitive screening design (2021)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi Ippei、Nasukawa Tadahiro、Sugimoto Ryosuke、Takemura-Uchiyama Iyo、Murakami Hironobu、Uchiyama Jumpei
  • 雑誌名: Virus Research 巻: 298 ページ: 198406～198406
  • DOI: 10.1016/j.virusres.2021.198406
  • 査読あり
• [雑誌論文] In Vitro and In Vivo Evaluation of Three Newly Isolated Bacteriophage Candidates, phiEF7H, phiEF14H1, phiEF19G, for Treatment of Enterococcus faecalis Endophthalmitis (2021)
  • 著者名/発表者名: Kishimoto Tatsuma、Ishida Waka、Nasukawa Tadahiro、Ujihara Takako、Nakajima Isana、Suzuki Takashi、Uchiyama Jumpei、Todokoro Daisuke、Daibata Masanori、Fukushima Atsuki、Matsuzaki Shigenobu、Fukuda Ken
  • 雑誌名: Microorganisms 巻: 9 ページ: 212～212
  • DOI: 10.3390/microorganisms9020212
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Purification of membrane vesicles from Gram-positive bacteria using flow cytometry, after iodixanol density-gradient ultracentrifugation (2021)
  • 著者名/発表者名: Nasukawa Tadahiro、Sugimoto Ryosuke、Uchiyama Jumpei、Takemura-Uchiyama Iyo、Murakami Hironobu、Fukuda Ken、Matsuzaki Shigenobu、Sakaguchi Masahiro
  • 雑誌名: Research in Microbiology 巻: 172 ページ: 103792～103792
  • DOI: 10.1016/j.resmic.2020.11.003
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of a plasmid encoding botulinum neurotoxin type G gene in Clostridium argentinense (2020)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi Yoshihiko、Uchiyama Jumpei、Take Akira、Gotoh Kazuyoshi、Sakaguchi Masakiyo、Suzuki Tomonori、Yamamoto Yumiko、Hosomi Koji、Kohda Tomoko、Mukamoto Masafumi、Kozaki Shunji、Hayashi Shunji、Oguma Keiji
  • 雑誌名: Anaerobe 巻: 66 ページ: 102281～102281
  • DOI: 10.1016/j.anaerobe.2020.102281
  • 査読あり
• [雑誌論文] IgE reactivity to fish allergens from Pacific cod (Gadus macrocephalus) in atopic dogs (2020)
  • 著者名/発表者名: Imanishi Ichiro、Uchiyama Jumpei、Mizukami Keijiro、Kamiie Junichi、Kurata Keigo、Iyori Keita、Fujimura Masato、Shimakura Kuniyoshi、Nishifuji Koji、Sakaguchi Masahiro
  • 雑誌名: BMC Veterinary Research 巻: 16 ページ: 341
  • DOI: 10.1186/s12917-020-02559-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Development of multipurpose recombinant reporter bovine leukemia virus (2020)
  • 著者名/発表者名: Murakami Hironobu、Yajima Yusuke、Sato Fumiaki、Kamisuki Shinji、Taharaguchi Satoshi、Onda Ken、Roh Sanggun、Uchiyama Jumpei、Sakaguchi Masahiro、Tsukamoto Kenji
  • 雑誌名: Virology 巻: 548 ページ: 226～235
  • DOI: 10.1016/j.virol.2020.07.011
  • 査読あり
• [雑誌論文] IgE sensitivity to Malassezia pachydermatis and mite allergens in dogs with atopic dermatitis (2020)
  • 著者名/発表者名: Ishimaru Hironobu、Okamoto Noriaki、Fujimura Masato、Miyaji Kazuki、Shimakura Hidekatsu、Takase Yukari、Mizukami Keijiro、Uchiyama Jumpei、DeBoer Douglas J.、Sakaguchi Masahiro
  • 雑誌名: Veterinary Immunology and Immunopathology 巻: 226 ページ: 110070～110070
  • DOI: 10.1016/j.vetimm.2020.110070
  • 査読あり
• [雑誌論文] Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018-2019update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee (2020)
  • 著者名/発表者名: Adriaenssens EM, Sullivan MB, Knezevic P, van Zyl LJ, Sarkar BL, Dutilh BE, Alfenas-Zerbini P, Lobocka M, Tong Y, Brister JR, Switt AIM, Klumpp J, Aziz RK, Barylski J, Uchiyama J, et al.
  • 雑誌名: Archives of Virology 巻: 165 ページ: 1253～1260
  • DOI: 10.1007/s00705-020-04577-8
  • 査読あり
• [学会発表] 黄色ブドウ球菌に対するファージ療法の研究開発（I）実験計画法によるファージ培養の解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 内山淳平
  • 学会等名: 第94回日本細菌学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] 今熱いマイクロバイオーム 獣医微生物学研究者の見地から (2021)
  • 著者名/発表者名: 内山淳平
  • 学会等名: 第17回日本獣医内科学アカデミー学術大会
  • 招待講演
• [学会発表] 密度勾配超遠心法とフローサイトメトリーを併用したグラム陽性細菌が産生する膜小胞試料の調製法の検討 (2021)
  • 著者名/発表者名: 那須川忠弥、杉本良輔、内山淳平、内山伊代、村上裕信、福田憲、松崎茂展、阪口雅弘
  • 学会等名: 第94回日本細菌学会総会
• [学会発表] ファージ由来溶菌酵素 S25-3LYS のイヌ表在性膿皮症に対する臨床応用性の検討 (2021)
  • 著者名/発表者名: 今西市朗，西藤公司，朝比奈良太，林俊治，津久井利弘，内山淳平
  • 学会等名: 第94回日本細菌学会総会
• [学会発表] GBS検査を改善するエンドライシンの新規利用法の検討 (2021)
  • 著者名/発表者名: 小方雅也、松井秀人、那須川忠弥、内山伊代、東出正人、阪口雅弘、花木秀明、内山淳平
  • 学会等名: 第94回日本細菌学会総会
• [学会発表] 菌種同定に難渋した感染性心内膜炎の一例 (2021)
  • 著者名/発表者名: 岡村 駿，曾和 裕之，明城 正博，杉下 靖之，田部井 史子，佐藤 優佳理，今西 市朗，内山 淳平，伊從 慶太，伊藤 敦彦
  • 学会等名: 第666回日本内科学会関東地方会
• [学会発表] 微生物を利用したヒト・動物の疾患の予防・治療を目指して！ (2020)
  • 著者名/発表者名: 内山淳平
  • 学会等名: 第1回「農・動物・未来研究会」
  • 招待講演
• [学会発表] 乳牛の疾病と常在微生物叢との関連（BLVを例にして）～獣医微生物学研究者から乳房炎に携わる人へのメッセージ～ (2020)
  • 著者名/発表者名: 内山淳平
  • 学会等名: 第２５回日本乳房炎研究会 座談会
  • 招待講演
• [学会発表] 複数の獣医系機関におけるイヌの膿皮症やアレルギー性皮膚炎に対する抗菌薬非依存的な取り組み (2020)
  • 著者名/発表者名: 内山淳平、今西市朗、西藤公司、福山朋季、伊從慶太、津久井利広、阪口雅弘
  • 学会等名: 第６５回日本ブドウ球菌研究会
• [学会発表] Staphylococcus pseudintermediusに対する新規エンドライシンの分離と解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 金木真央、内山淳平、松崎茂展、内山伊代、小方雅也、阪口雅弘
  • 学会等名: 第163回日本獣医学会学術集会
• [学会発表] フローサイトメーターを利用したグラム陽性細菌の膜小胞の新規分離法 (2020)
  • 著者名/発表者名: 杉本良輔、那須川忠弥、内山淳平、内山伊代、村上裕信、福田憲、松崎茂展、阪口雅弘
  • 学会等名: 第163回日本獣医学会学術集会
• [学会発表] イヌの純血種コロニーを利用したアトピー性皮膚炎に関連した口腔・腸内細菌叢の変動の解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 海野朝香、今西市朗、水上圭二郎、大隅尊史、五十嵐寛高、村上裕信、島綾香、石原玄基、宇根有美、阪口雅弘、内山淳平
  • 学会等名: 第163回日本獣医学会学術集会
• [学会発表] Staphylococcus pseudintermediusのイヌアトピー性皮膚炎増悪因子の探索 (2020)
  • 著者名/発表者名: 鶴井大幹、島倉秀勝、内山淳平、今西市朗、坂本修士、樋口琢磨、伊從慶太、下池健太、藤村正人、阪口雅弘
  • 学会等名: 第163回日本獣医学会学術集会
• [学会発表] バクテリオファージを利用した細菌の高選択的な細菌検出技術の開発 (2020)
  • 著者名/発表者名: 今井 斉志、仁子 陽輔、波多野 慎悟、渡辺 茂、内山 伊代、内山 淳平、松崎 茂展
  • 学会等名: 日本分析化学会 第69年会
• [学会発表] バクテリオファージを用いた細菌の超選択的な暗視野顕微鏡検出技術の開発 (2020)
  • 著者名/発表者名: 今井 斉志、仁子 陽輔、波多野 慎悟、渡辺 茂、内山 伊代、内山 淳平、松崎 茂展
  • 学会等名: 第10回CSJ化学フェスタ2020
• [学会発表] ネコ用ワクチン接種後のアナフィラキシーに関する研究 (2020)
  • 著者名/発表者名: 吉田愛美、伊藤雅人、水上圭二郎、内山淳平、阪口雅弘
  • 学会等名: 第4回日本ワンヘルスサイエンス学会大会
• [学会発表] 牛伝染性リンパ腫ウイルス感染による乳牛の腸内細菌叢への影響 (2020)
  • 著者名/発表者名: 内山淳平、村上裕信、佐藤礼一郎、水上圭二郎、鈴木武人、島綾香、石原玄基、曽川一幸、阪口雅弘．
  • 学会等名: 第4回日本ワンヘルスサイエンス学会大会
• [学会発表] Analysis of hindgut microbiome in cows infected with bovine leukemia virus (2020)
  • 著者名/発表者名: Jumpei Uchiyama, Hironobu Murakami, Reiichiro Sato, Keijiro Mizukami, Tadahiro Nasukawa, Takehito Suzuki, Ayaka Shima, Genki Ishihara, Kazuyuki Sogawa, Masahiro Sakaguchi
  • 学会等名: IUMS (International Union of Microbiological Societies Congress) 2020
  • 国際学会
• [学会発表] New dot-blot methods for evaluating the effect of inactivators on mite and Japanese cedar pollen allergens (2020)
  • 著者名/発表者名: Megumi Yoshida, Keijiro Mizukami, Keigo Kurata, Tadahiro Nasukawa, Jumpei Uchiyama, Masahiro Sakaguchi. New dot-blot methods for evaluating the effect of inactivators on mite and Japanese cedar pollen allergens
  • 学会等名: JSA/WAO Joint Congress 2020
  • 国際学会