| 研究課題/領域番号 |
18K07151
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分49060:ウイルス学関連
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| 研究機関 | 長浜バイオ大学 |
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研究代表者 |
和田 健之介 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 教授 (90231026)
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| 研究分担者 |
池村 淑道 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 客員教授 (50025475)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | 新型コロナウイルス / COVID-19 / 人獣共通感染症 / AI / RNAウイルス / ウイルス進化 / オリゴヌクレオチド / 自己組織化マップ |
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| 研究成果の概要 |
新型コロナウイルスは高速に進化するRNAウイルスであり、社会的重要性から大量なゲノム配列が公開されている。我々の開発した連続塩基組成を対象にした教師無しAI：BLSOMはビッグデータ解析に適しており、多様な可視化機能により能率的な知識発見を可能にした。ヒト集団へ侵入後に連続塩基組成を定方向的に変化させており、コウモリで流行しているコロナウィルスの組成から、ヒトで流行している風邪コロナウイルスの組成へと近づく方向であった。20連のような長い連続塩基の集団内組成の時系列解析により、ウイルス集団内で急拡大する突然変異が特定でき、ウイルス増殖に有利な変異とリンクする中立変異の区別が可能な例も示された。
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| 自由記述の分野 |
情報解析
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
人獣共通感染症RNAウイルスはヒト以外の宿主動物から突然にヒトへと侵入し、大半のヒトが効果的な免疫を持たないことから大流行を引き起こすので、人類はこの脅威に常に晒されている。加えてRNAウイルスは高速に進化するので、ワクチンを含む予防や治療薬ならびに診断薬の有効性が失われ易い。この難題の解決には、本研究で開発したゲノム配列の変化方向の特定と予測が重要となる。新型コロナウイルスの場合は基礎研究であっても研究成果の迅速な公開が重要であり、既に7報の査読付き論文として発表し、投稿中の2報もpreprintとして公開した。ウイルスゲノムの配列解析にAIを導入したことも先導的であり学術的意味が高い。
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