2020 年度研究成果報告書

がん組織で見出されるEBVは未知のがんサブタイプ形成に関与するか

研究課題

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研究課題/領域番号	18K07284
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	基金
応募区分	一般
審査区分	小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
研究機関	公益財団法人東京都医学総合研究所
研究代表者	大保木啓介公益財団法人東京都医学総合研究所, ゲノム医学研究センター, 副参事研究員 (80415108)
研究期間 (年度)	2018-04-01 – 2021-03-31
キーワード	EBウイルス
研究成果の概要	EBウイルス関連胃癌の予後については、まだ議論の分かれるところである。 TCGA-胃がんプロジェクトでは、EBV分子サブタイプは複数の次世代シーケンシング法を組み合わせて決定されたが、異なるアプローチで検出されたEBV陽性率との整合性について疑問を残している。そこで我々は375の腫瘍と32の正常サンプルを含む公共RNAシーケンシングデータセットを再解析し、EBVリードの信頼できる閾値を定義した。病理学的サブタイプに対するEBVの予後への影響についても分析し、再解析により同定されたEBV 陽性症例は、浸潤リンパ球シグネチャとは独立していて、全症例のほぼ半数を占めていた。
自由記述の分野	腫瘍学
研究成果の学術的意義や社会的意義	EBウイルスががん細胞中に認められる胃がんサブタイプが知られる。これまで、EBVに由来するRNAが非常に多い場合のみが注目されてきたが、EBVは170000塩基を超えるゲノムを有し、そこに多くの遺伝子を有していて、その転写は一様では無い可能性がある。そのため、大量のRNA分子を解析することで、ごく微量のEBV RNAを検出し、これが新しい胃がんの予後予測因子となる可能性を示唆できた。