| 研究課題/領域番号 |
18K07339
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| 研究機関 | 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所) |
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研究代表者 |
山本 剛 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, 医長 (80384189)
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| 研究分担者 |
宮部 泉 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 腫瘍診断・予防科, 研究員 (20800155)
赤木 究 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 腫瘍診断・予防科, 科長(兼)部長 (30244114)
高橋 朱実 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 腫瘍診断・予防科, 研究員 (40743620)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | MSI検査 / NSG / 大腸癌 / MSH6 |
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| 研究実績の概要 |
AmpliVarとSeqPrepというソフトを用いて、マッピング非依存的にMSI検査の結果を定量化・判定するアルゴリズムについて、Familial Cancerに論文が受理された。さらに本手法を用いて検査した結果から、明らかになったリンチ症候群の症例について、European Journal of Human Geneticsに論文が受理された。また、本手法を用いたMSI検査がISO15189認定された。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
1: 当初の計画以上に進展している
理由
非常に早い段階で結果がまとまり、論文作成、受理まで進むことが出来た。
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| 今後の研究の推進方策 |
ISO15189認定された本手法を応用して、MSI検査の精度向上につなげる。またアルゴリズム改良を行い、様々な検体に対応できるようにする。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
本手法を検査として用いる際に、若干のアルゴリズムの改変と調製が必要であることが明らかとなっている。次年度は、AmpliVarとSeqPrepのパラメータを調製しながら、様々な条件の検体を解析し、多くのサンプルで安定した結果が出るように手法の精度を上げていく為に助成金を用いる。
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