2021 年度研究成果報告書

塩基変異の引き起こすエクソンスキップを分子機構の解明と治療法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号	18K07873
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	基金
応募区分	一般
審査区分	小区分52050:胎児医学および小児成育学関連
研究機関	地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立こども医療センター(臨床研究所) (2021) 東京医科歯科大学 (2018-2020)
研究代表者	成戸卓也地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立こども医療センター(臨床研究所), 臨床研究所, 主任研究員 (60438124)
研究期間 (年度)	2018-04-01 – 2022-03-31
キーワード	スプライシング変異
研究成果の概要	RNAスプライシングのシス制御配列の変異やトランス制御因子の変化によりRNAスプライシングの異常が疾患の原因となっている。患者自身の白血球よりRNA-Seqを行い、実際の患者におけるスプライシング変異に関わるスプライシングパターンと発現量をStringTieを用いて検証した。スプライシング予測ソフトより予測される変異が生じていないかをミニジーンアッセイで検証した。これらの結果からエクソン途中の欠失は連続しているイントロンの配列を用いてRNAに転写されており、元から存在するスプライシング箇所を強力に保持しており、イントロン内の予測されるスプライシング箇所は使用されていなかった。
自由記述の分野	分子生物学
研究成果の学術的意義や社会的意義	エクソン欠失の報告が数少ない遺伝子におけるスプライシング変異の詳細な解析を行い、ｍRNAのパターンと発現の解析をした。数多くのスプライシング予測ソフトが公開されているが、本研究の結果を組み入れることによりDNA変異から生じるRNAの予測向上の一助となることが期待される。また、迅速な結果解釈による病気の早期診断や治療の向上が期待される。