研究課題/領域番号 |
18K08428
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研究機関 | 信州大学 |
研究代表者 |
長野 則之 信州大学, 学術研究院保健学系, 教授 (00747371)
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研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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キーワード | 小児 / 下水流入水 / 愛玩動物 / blaCTX-M-27 / B2-O25b-ST131-H30R / MRSA / mcr-1 |
研究実績の概要 |
ヒトと環境の間での薬剤耐性菌及び耐性遺伝子の循環、これらを担う環境リザーバーの重要性の解明を主要な目的とした。 本年度は、小児専門病院の臨床材料由来ESBL産生Escherichia coliを解析し、blaCTX-M-27保有の推定多剤耐性・高病原性世界流行クローンB2-O25b-ST131-H30R/non-Rxが優位に検出され、国内の成人における疫学知見と一致していた。小児感染症治療の使用可能抗菌薬が限定されており、薬剤耐性菌の出現・動向の監視が重要である。 愛玩動物由来MRSA56株の分子学的解析を実施し、我々の既報のヒト臨床由来MRSA178株との系統ネットワーク解析を行った。CA-MRSAの遺伝系統はヒトと愛玩動物の両方に適応性を有し、愛玩動物がCA-MRSAの感染源や媒体となる可能性が示唆される。HA-MRSAにはヒトのみに適応性を有する遺伝系統に加え、ヒトと愛玩動物の両方に感染し得る遺伝系統が存在する可能性が考えられた。 環境水として下水処理場4施設から収集した流入水由来ESBL産生E. coliの解析で、blaCTX-M保有73株は31と多様なSTに分別されたが、blaCTX-M-27保有B2-O25b-ST131-H30R/non-Rxをはじめヒト臨床的に重要なblaCTX-M保有クローンが複数の流入口、複数の処理場で検出された。さらに国内起源の臨床由来株で報告のないキメラ遺伝子blaCTX-M-64並びにblaCTX-M-123も確認され、未処理下水のESBL遺伝子変異、組み換えの進化的hotspotとしての重要な役割が示唆される。多剤耐性菌重篤感染症の最後の砦的治療薬コリスチンの耐性株については国内のヒトでの報告は極めて稀であるが、流入水からプラスミド性コリスチン耐性遺伝子mcr-1保有E. coli7株が検出され、現在NGSにて解析中である。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
初年度に下水流入水由来ESBL産生E. coli株並びに保有blaCTX-M遺伝子の分子遺伝学的解析が終了し、論文化の段階であること。また、下水流入水由来プラスミド性コリスチン耐性遺伝子mcr-1保有E. coli並びにmcr-1を担うプラスミドについての全ゲノム配列解析、プラスミド全塩基配列解析が終了していること。 愛玩動物由来MRSAの解析知見についての論文が投稿中であること。
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今後の研究の推進方策 |
下水流入水由来プラスミド性コリスチン耐性遺伝子mcr-1保有E. coli並びにmcr-1を担うプラスミドについての全ゲノム配列解析、プラスミド全塩基配列解析知見の論文作成に着手する。さらにはプラスミド性コリスチン耐性遺伝子mcr-1とは異なるコリスチン耐性機構である染色体上の二成分制御系因子pmrA、pmrB、mgrBなどの遺伝子変異/IS挿入などを保有するKlebsiella spp. 株の全ゲノム配列解析が進行中である。ヒト難治性感染症の起因菌であるAcinetobacter baumannii、Pseudomonas aeruginosaについてこれまでに実態が把握されていない愛玩動物由来株の収集、薬剤耐性菌の疫学解析に着手する。病院環境 (病棟シンク)より検出されたNDM-1産生Acinetobacter pittiiについてWGS解析を行い、論文化の予定である。
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次年度使用額が生じた理由 |
(理由) ゲノム配列解析において、重要株を先行して解析し、その結果に基づき後の解析を行うことが妥当と考えられたため。 (使用計画) 次年度請求額と合わせて、解析対象株を選択し、ゲノム解析やプラスミドの全塩基配列解析を実施する。さらには塩基配列の隙間(ギャップ)を埋めるためのPCRシークエンシングによるプラスミド配列取得を行うのに使用することを計画している。
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