| 研究課題/領域番号 |
18K08722
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| 研究機関 | 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター) |
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研究代表者 |
杉町 圭史 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 肝胆膵外科医長 (90452763)
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| 研究分担者 |
井口 友宏 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 肝胆膵外科医師 (30598959)
三森 功士 九州大学, 大学病院, 教授 (50322748)
吉住 朋晴 九州大学, 医学研究院, 准教授 (80363373)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| キーワード | 肝細胞癌 / ウイルス学的著効 / メチル化 / RNAシークエンス |
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| 研究実績の概要 |
C 型肝炎ウイルス治療後の肝癌発生の分子機序を解明することを目指して研究を継続した。肝細胞癌に対する肝切除手術を行った42症例について、切除標本の癌部、非癌部の新鮮凍結標本を採取し, 各症例の凍結組織よりそれぞれゲノムDNA と全RNA を抽出し精製した。これらのサンプルよりPBAT(全ゲノムメチル化シークエンス)とRNAシークエンスを行った。切除標本の解析と並行して、肝癌培養細胞における解析を完了した。2株の肝癌培養細胞をバイサルファイト処理し、universalに脱メチル化処理し、それぞれRNAシークエンスを行った。臨床検体の結果と培養細胞の結果をin silicoで統合的に解析を進めており、C型肝炎治癒後に発症する肝癌に特異的な遺伝子異常を同定する。またその結果をvalidationするための症例より切除標本と末梢血液のサンプリングも行っている。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
臨床検体と培養細胞株について想定通りにサンプリングと解析が進んでいる。
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| 今後の研究の推進方策 |
２年間の研究で解析したPBAT(post-bisulfate adaptor-tagging)法を用いた網羅的DNAメチル化シークエンシングとmRNAシークエンシング(RNAseq)の結果を統合解析する予定である。そこで同定された遺伝子異常について臨床検体でvalidationを行い３年間の研究計画を完了する予定である。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
RNAシークエンスのためのサンプリングが一部間に合わなかったため解析費用が次年度使用となった。
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