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2018 年度 実施状況報告書

多国間を網羅する薬剤耐性細菌の耐性遺伝子集積配列を用いた分子疫学手法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 18K10045
研究機関神戸大学

研究代表者

大澤 佳代  神戸大学, 保健学研究科, 准教授 (50324942)

研究分担者 重村 克巳  神戸大学, 保健学研究科, 准教授 (00457102)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワードカルバペネマーゼ / 基質拡張型βラクタマーゼ / カルバペネム耐性 / MLVA / MLST
研究実績の概要

今年度はインドネシア及び兵庫県で分離された薬剤耐性菌株についての解析を行った。インドネシアでのカルバペネム耐性グラム陰性桿菌を22株分離し、これらは、Acinetobacter baumannii(n = 4)、Pseudomonas aeruginosa(n = 4)、Klebsiella pneumoniae(n = 5)、Providencia rettgeri(n = 4)であり、そのカルバペネマーゼはNDM-1(n=18,81.8%)およびIMP-7(n=4,18.2%)であった。分離された患者のうち、12人(54.5%)が重症例で3人が死亡した(死亡率13.6%)、この結果はInt J Urol.(2018)に掲載された。
兵庫県において分離されたカルバペネム耐性緑膿菌21株のうち、13株(61.9%)がメタロ-β-ラクタマーゼ陽性であり、IMP-1が 11株(52.4%)、IMP-7が 1株(4.5%)およびVIM-1が1株(4.5%)であった。これらの株の相同性をRep-PCRによる疫学解析により確認し、Int J Urol.(2019)に掲載された。また、緑膿菌感染症の一人の患者から分離された株について、2ヶ月間にわたって得られた6つの分離株の次世代シークエンスによる全ゲノム配列決定により、排出ポンプ発現および抗菌剤耐性に影響を与える2つの重要な一塩基多型(SNP)がmexRおよびgyrB遺伝子において明らかにされ、J Infect Chemother.(2019)に掲載された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

インドネシアの尿路感染症患者から分離されたカルバペネム耐性グラム陰性桿菌において、カルバペネマーゼ産生22株が分離された。これらは、Acinetobacter baumannii(n = 4)、Pseudomonas aeruginosa(n = 4)、Klebsiella pneumoniae(n = 5)、Providencia rettgeri(n = 4)であり、カルバペネマーゼの種類はNDM-1(n=18,81.8%)およびIMP-7(n=4,18.2%)であった。これらはすべてコリスチンに感性をしめした。カルバペネマーゼ産生グラム陰性桿菌を保有する患者のうち、12人(54.5%)が入院時に重症例であり、3人が死亡した(死亡率13.6%)、この結果はInt J Urol.(2018)に掲載された。
兵庫県における尿路感染症患者21人から分離されたカルバペネム耐性緑膿菌のうち、13株(61.9%)がメタロ-β-ラクタマーゼ陽性で、IMP-1が 11株(52.4%)、IMP-7が 1株(4.5%)およびVIM-1が1株(4.5%)であった。メタロ-β-ラクタマーゼ陽性分離株はMulti locus sequence typing(MLST)より主にST235として同定された。Rep-PCRによる疫学解析によりこれらの株の相同性を見出した。このうち、VIM-1を持つST235分離株が初めて発見され、Int J Urol.(2019)に掲載された。また、緑膿菌感染症の治療を受けていた一人の患者から分離された株について、2ヶ月間の6株の次世代シークエンスによる全ゲノム配列決定により、排出ポンプ発現および抗菌剤耐性に影響を与える2つの重要な一塩基多型(SNP)がmexRおよびgyrB遺伝子において明らかにされ、J Infect Chemother.(2019)に掲載された。

今後の研究の推進方策

インドネシアでの尿から分離されたカルバペネム耐性Acinetobacter baumanii 36株を収集し、カルバペネマーゼ産生、薬剤排出ポンプ系統の解析を行う、基質拡張型βラクタマーゼ産生Escherichia coli 115株について反復配列多型解析法(multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis; MLVA法)により、細菌ゲノムにおける単一配列のタンデムリピート領域数の違いを基に菌株を型別し、その違いを確認する。その他チキン由来のEscherichia coli 56株、Salmonella enterica 76株および水由来の細菌の薬剤感受性試験を進めており、詳細な解析を行う予定である。
さらには、新規合成薬剤について、様々な薬剤耐性細菌への効果を検討中である。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (4件)

  • [国際共同研究] アイルランガ大学/ストモ病院(インドネシア)

    • 国名
      インドネシア
    • 外国機関名
      アイルランガ大学/ストモ病院
  • [雑誌論文] Molecular characteristics of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa isolated from urine in Hyogo, Japan.2019

    • 著者名/発表者名
      Osawa K, Shigemura K, Kitagawa K, Fukuda T, Takasaka A, Wakabayashi S, Sato K, Yamamichi F, Shirakawa T, Fujisawa M.
    • 雑誌名

      Int J Urol.

      巻: 26 ページ: 127-133

    • DOI

      10.1111/iju.13818.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Acquisition of antimicrobial-resistant variants in repeated infections caused by Pseudomonas aeruginosa revealed by whole genome sequencing.2019

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi N, Nomoto R, Sato K, Koike C, Kusuki M, Nakamura T, Shigemura K, Shirakawa T, Fujisawa M, Tokimatsu I, Osawa K.
    • 雑誌名

      J Infect Chemother.

      巻: 25 ページ: 154-156

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2018.07.016.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Occurrence and characterization of carbapenem-resistant Gram-negative bacilli: A collaborative study of antibiotic-resistant bacteria between Indonesia and Japan.2018

    • 著者名/発表者名
      Kuntaman K, Shigemura K, Osawa K, Kitagawa K, Sato K, Yamada N, Nishimoto K, Yamamichi F, Rahardjo D, Hadi U, Mertaniasih NM, Kinoshita S, Fujisawa M, Shirakawa T.
    • 雑誌名

      Int J Urol.

      巻: 25 ページ: 966-972

    • DOI

      10.1111/iju.13787.

    • 査読あり
  • [学会発表] 尿路感染症におけるカルバペネム耐性腸内細菌科細菌の分子生物学的検討ならびに迅速診断法の確立2019

    • 著者名/発表者名
      重村克巳、大澤佳代、江夏徳寿、北川孝一、白川利朗、中野雄造、藤澤正人
    • 学会等名
      第28回泌尿器分子細胞研究会
  • [学会発表] カルバペネム耐性緑膿菌の薬剤耐性機構の解析2018

    • 著者名/発表者名
      佐藤加奈子、大澤 佳代, 重村 克巳, 楠木 まり, 中村 竜也, 時松 一成, 藤澤 正人
    • 学会等名
      第66回日本化学療法学会学術集会
  • [学会発表] インドネシアで分離されたCTX-M-15型ESBL産生Escherich ia coliにおける染色体性およびプラスミド性についての分子疫学調査2018

    • 著者名/発表者名
      細谷 砂美子、大澤 佳代、久保 綾乃、木下 承晧、佐藤 小春、Dadik Raharjo、Kuntaman Kuntaman 、藤澤 正人、平井 到、白川 利朗
    • 学会等名
      第13回日本臨床検査教育学会学術大会
  • [学会発表] インドネシアの尿路感染症患者より分離されたカルバペネマーゼ産生グラム陰性桿菌の分子疫学的 調査2018

    • 著者名/発表者名
      細谷 砂美子、大澤 佳代、重村 克巳、北川 孝一、西本 健人、Kuntaman Kuntaman、Dadik Rahardjo 、木下 承晧、藤澤 正人、白川 利朗
    • 学会等名
      第13回日本臨床検査教育学会学術大会

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公開日: 2019-12-27  

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