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2020 年度 実績報告書

乳幼児・小児の原因不明突然死剖検例の網羅的遺伝子解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K10119
研究機関富山大学

研究代表者

畑 由紀子  富山大学, 学術研究部医学系, 准教授 (30311674)

研究分担者 西田 尚樹  富山大学, 学術研究部医学系, 教授 (10315088)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワード原因不明の突然死 / 乳幼児・小児 / エクソーム解析
研究実績の概要

原因不明の乳幼児・小児の突然死(Sudden Unexplained Death; SUD)剖検例について、遺伝的基盤を明らかにすることで死因究明・病態解明を試みている。遺伝子解析の範囲をこれまで言われている心疾患関連遺伝子のみならず、心疾患以外の疾患関連遺伝子に拡げることにより、乳幼児・小児のSUD症例の遺伝的背景を検討することが可能になる。
本年行われた剖検例から原因不明の乳幼児3症例について全エクソーム解析を行い、i) 全世界健常人の頻度データーベースgnomAD Databaseを用いた稀少変異 (頻度の1%以下) の抽出及び病的意義のある変異の抽出、ii) ヒト疾患における表現型の異常を記述するHuman Phenotype Ontology (HPO)語彙を用いた患関連遺伝子の抽出、iii) 疾患のデータベースClinVar、Human Gene Mutation Database (HGMD)を用いたバリアントの検索、日本人健常人の頻度データベースToMMo、Human Genetic Variation Databaseを用いた稀少変異 (頻度の1%以下) の確認及び米国臨床遺伝・ゲノム学会の病原評価基準(ACMGガイドライン)に従って評価を行った。変異体は複数の機能予測ツールを用いた病原性の予測を行い、遺伝子ごとにHPOやOnline Mendelian Inheritance in Man (OMIM)などを用いて遺伝形式及び疾患別に分類し評価を行った。
その結果、1症例に運動異常に関連する遺伝子に2塩基indelによりストップコドンが発生する新規ヘテロバリアントを認めた。病理組織学的検索では小脳のプルキンエ細胞及び顆粒細胞の減少を認めた。
今年度は最終年度であるためこれまでの成果について論文報告準備中である。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2020 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Two autopsy cases of sudden unexpected death from Dravet syndrome with novel de novo SCN1A variants2020

    • 著者名/発表者名
      Hata Yukiko、Oku Yuko、Taneichi Hiromichi、Tanaka Tomomi、Igarashi Noboru、Niida Yo、Nishida Naoki
    • 雑誌名

      Brain and Development

      巻: 42 ページ: 171~178

    • DOI

      10.1016/j.braindev.2019.10.005

    • 査読あり
  • [学会発表] Two autopsy cases of sudden unexpected death from Dravet syndrome with novel de novo SCN1A variants.2020

    • 著者名/発表者名
      西田尚樹,畑由紀子,一萬田正二郎.
    • 学会等名
      第109回日本病理学会総会オンライン総会
  • [学会発表] 原因不明の突然死症例に認めたスプライス変異のmini-gene assayを用いた機能解析.2020

    • 著者名/発表者名
      畑由紀子,一萬田正二郎,西田尚樹
    • 学会等名
      第104次日本法医学会学術全国集会
  • [学会発表] 神経疾患を伴う小児焼死剖検例.2020

    • 著者名/発表者名
      西田尚樹,畑由紀子,一萬田正二郎.
    • 学会等名
      第42回日本法医学会学術中部地方会
  • [備考] 富山大学大学院医学薬学研究部(医学系)法医学講座_研究業績

    • URL

      http://www.med.u-toyama.ac.jp/legal/publications.html

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公開日: 2021-12-27  

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