研究課題
若手研究
ヒトリンパ芽球TK6細胞のウリジン一リン酸合成酵素 (UMPS) 遺伝子がノックアウトされた、ΔUMPS株に5,6-d2ラベルウリジンを処理培養し、細胞内で生合成されたRNAよりU2 snRNAおよびU3 snoRNAを精製した。精製したRNAをRNase消化の後にLC-MSで分析し、得られたスペクトルデータをデータベースAriadneでサーチすることで、U2 snRNAおよびU3 snoRNAにおける新規シュードウリジン化修飾サイトを明らかにした。
分子生物学
シュードウリジン化酵素によりウリジンがシュードウリジン化修飾を受けても、化学的性質に変化は見られず質量に差が生じないことから、質量分析計で両者を判別することは困難であった。しかし、ΔUMPS株とラベルウリジンを用いることで、シュードウリジン化修飾により生じる質量差を利用することで、シュードウリジン化サイトを明らかにすることが可能になった。
