| 研究課題/領域番号 |
18K14515
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| 研究機関 | 国立極地研究所 |
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研究代表者 |
佐野 雅美 国立極地研究所, 研究教育系, 特任研究員 (00814732)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | マリンスノー / 沈降粒子 / バクテリア / メタゲノム / 南大洋 / ゲルセジメントトラップ |
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| 研究実績の概要 |
南大洋航海でゲルセジメントトラップにより水深50mから500mにかけた３層から採集したマリンスノー試料および動物プランクトン試料について、以下の3つを行った。
(1)水深50m, 200mより採集したマリンスノー各種のメタ18S解析のデータを解析した。得られた各分類群のリード数に基づきLEfSe (Linear Discriminant Analysis Effect Size) 解析を行ったところ、特定のタイプのマリンスノーに特徴的な分類群が検出された。メタ16S解析の結果についても現在解析中である。
(2)水深500mのゲルセジメントトラップ試料について次世代シーケンサーによるマリンスノー各種のメタ16S・18S解析を行った。形状に基づきマリンスノーをタイプ分けし、個々のマリンスノーからDNAを抽出、PCRした後、Miseqによるアンプリコンシーケンスを行った。得られた真核生物相および細菌叢のデータについては、これまで得られている他の水深の試料と合わせ解析を進めている。
(3)南大洋航海でゲルセジメントトラップ観測と並行してVMPSネットなど複数のプランクトンネットにより深度別に採集し、固定保存した動物プランクトン試料のソーティングを行なった。ゲルセジメントトラップ観測を行った測点の各深度における動物プランクトン各種の個体数密度を求め、これに基づき消化管内容物分析の対象とする動物プランクトン種を決定した。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
マリンスノーの解析は予定通り進行している。その一方、新型コロナウイルス感染症の流行による影響で、実験予定等に大きな変更が生じたため、動物プランクトンの解析については遅れている。分析対象とする動物プランクトン種を決定したが、消化管内容物分析については遅れており、現在DNA抽出を進めている状態である。
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| 今後の研究の推進方策 |
分析対象種の消化管内容物のメタ16S,18S解析を行い、既に得られているマリンスノーの細菌叢・真核生物相と組成を比較し、動物プランクトン各種が摂食するマリンスノーのタイプを求め、本研究の目的であるマリンスノーと動物プランクトン間における食物網構造を明らかにする。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
新型コロナウイルス感染症の流行による影響で、実験予定等に大きな変更が生じ、今年度予定していた次世代シーケンス解析を次年度に繰り越したため、その分の次年度使用額が生じた。そのため、次年度使用額はその次世代シーケンス解析の外注費およびその試料準備に必要な消耗品費に使用する予定である。
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