| 研究実績の概要 |
本研究の目的は,新規環境進出における遺伝的同化の有無を,ゲノミクスとエピジェネティクスの手法を用いて検証することである.遺伝的同化は,集団が経験する低い適応度が可塑性で対処された後に,適応進化が追随する現象を指す.遺伝的同化は新規環境進出における表現型可塑性の役割を解明する上で重要な現象とされる.本研究ではDNAメチル化の環境間での可塑的応答に着目し,それとゲノム上の自然選択の履歴を対応させて分析することで,遺伝的同化の有無について検証する.海域から新規環境である淡水域に繰り返し進入した魚類のイトヨを材料に,淡水適応に関連した遺伝的同化が起きた候補となるゲノム領域を探索する.本年度では以下の研究内容を実施した．
（１）全ゲノム解析による集団動態の推定と自然選択の検出：前年度に引き続き，集団動態の推定と自然選択の痕跡の検出を目的として，全ゲノム解析を行った．解析する淡水集団を1つ増やし，合計５集団を解析した．追加した１集団についても他の淡水集団と同様に，海型との遺伝子流動は軽微だった．解析結果を日本進化学会，およびヨーロッパ進化生物学会で口頭発表した．
（２）異なる塩分環境におけるメチル化パターンの違いと遺伝的同化の候補領域推定：淡水集団と回遊集団を淡水と海水で飼育することで，異なるメチル化パターンが導入されるかどうかを飼育実験で検証している．前年度までに4集団での実験を完了させていたが，追加で1集団についても同様の実験を行い，バイサルファイトシーケンスに向けたサンプルを得た．
（３）メチル化の着脱を制御するゲノム領域の推定：前年度までに作成していたF1家系の一部を用いてF2を作成した．F2を海水環境で飼育することでメチル化の導入操作を行った．F2のサンプリングが半分ほど完了した．
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