研究課題
若手研究
タンパク質-タンパク質間相互作用(PPI)は様々な生命現象に関与するため、新しい創薬標的として注目されている。本研究課題では、申請者らの研究室で開発した計算手法であるインシリコ・フラグメントマッピング法をPPI標的に適用するための計算条件を検討し、実際にPPI阻害剤を複数同定することに成功した。これにより、新しい計算機的FBDD手法としてのインシリコ・フラグメントマッピング法の有効性を実証した。
創薬化学
PPI阻害剤の開発支援を目的とした従来の計算手法の多くは、結合フラグメント予測の際のドッキング計算の精度が問題となっていた。一方で、インシリコ・フラグメントマッピング法はドッキング計算に依らない知識ベースの計算手法であるため、従来法の弱点を補完することが可能となる。本手法の確立により、フラグメント情報に基づく化合物の高速スクリーニングや合理的設計など、高難易度なPPI標的における創薬加速が期待される。