自閉スペクトラム症多発家系の大規模エクソーム解析に基づく疾患脆弱性因子の同定

2018 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 18K15512
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 木村 大樹 名古屋大学, 医学系研究科, 寄附講座助教 (30612783)
• 研究期間 (年度): 2018-04-01 – 2019-03-31
• キーワード: エクソーム / 自閉スペクトラム症 / ネットワーク解析

研究実績の概要

本研究では、研究代表者が構築したエキソーム解析体制とこれまてに候補遺伝子内に疾患脆弱性変異を同定した経験を基に、自閉スペクトラム症の新規疾患脆弱性変異を同定するため、①日本人自閉スペクトラム症多発家系のゲノムサンプリング、②患者に加え健常家族も含めた家系全体のエキソーム解析、③家系解析に よりde novo 変異に加え患者間で共有する変異の抽出、④in silico解析による疾患脆弱性変異を基にした自閉スペクトラム症発症に関わる遺伝子ネットワーク 障害の特定、を実施する予定としている。平成30年度においては、自閉スペクトラム症多発17家系のエクソーム解析が終了し、構築したエクソーム解析パイプラインを用いて変異が検出できることを、サンガー法を用いて確認した。その後、検出された変異のクオリティを評価した上で、頻度が1%未満で、かつタンパク質機能に強い影響を与える変異を選択することで、疾患関連ゲノム変異(患者間で共有される変異、de novo変異)の抽出を行なった。その結果、神経発達障害データベースやSFARIデータベースで自閉スペクトラム症の発症に強い影響力を持つことが判明している遺伝子内において、疾患関連ゲノム変異を複数同定した。さらに、同定した疾患関連ゲノム変異は、神経発達に関連する遺伝子ネットワーク内に存在することが判明し、病態解明への手がかりを得ることが期待された。既に、追加の自閉スペクトラム症多発家系のサンプリングも行なっており、引き続きサンプリングを実施している。

研究成果

• [雑誌論文] Trajectories and Predictors of Post-Treatment Depression in Patients with Head and Neck Cancer (2018)
  • 著者名/発表者名: Adachi Y, Kimura H, Kimura H, Tokura T, Ozaki N
  • 雑誌名: Neuropsychiatry 巻: 8 ページ: 739-744
  • DOI: 10.4172
  • 査読あり
• [雑誌論文] Assessment of a glyoxalase I frameshift variant, p.P122fs, in Japanese patients with schizophrenia. (2018)
  • 著者名/発表者名: Ishizuka K, Kimura H, Kushima I, Inada T, Okahisa Y, Ikeda M, Iwata N, Mori D, Aleksic B, Ozaki N.
  • 雑誌名: Psychiatr Genet 巻: 28 ページ: 90-93
  • DOI: 10.1097/YPG.0000000000000204
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Comparative Analyses of Copy-Number Variation in Autism Spectrum Disorder and Schizophrenia Reveal Etiological Overlap and Biological Insights. (2018)
  • 著者名/発表者名: Kushima I, Aleksic B, Kimura H, Arioka Y, Yoshimi A, Takasaki Y, Yu Y, Nakamura Y, Yamamoto M, Iidaka T, Iritani S, Inada T, Ogawa N, Shishido E, Torii Y, Kawano N, Omura Y, Yoshikawa T, Uchiyama T, Yamamoto T, Ikeda M, Hashimoto R, Yamamori H, Yasuda Y, Someya T, Itokawa M, Arai M, Iwata N, Ozaki N
  • 雑誌名: Cell Rep 巻: 24 ページ: 2838-2856
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2018.08.022
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Single-cell trajectory analysis of human homogenous neurons carrying a rare RELN variant. (2018)
  • 著者名/発表者名: Arioka Y, Shishido E, Kubo H, Kushima I, Yoshimi A, Kimura H, Ishizuka K, Aleksic B, Maeda T, Ishikawa M, Kuzumaki N, Okano H, Mori D, Ozaki N.
  • 雑誌名: Transl Psychiatry 巻: 8 ページ: 129
  • DOI: 10.1038/s41398-018-0177-8.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Rare loss of function mutations in N-methyl-D-aspartate glutamate receptors and their contributions to schizophrenia susceptibility. (2018)
  • 著者名/発表者名: Yu Y, Lin Y, Takasaki Y, Wang C, Kimura H, Xing J, Ishizuka K, Toyama M, Kushima I, Mori D, Arioka Y, Uno Y, Shiino T, Someya T, Egawa J, Usami M, Kodaira M, Yoshimi A, Oya-Ito T, Aleksic B, Ohno K, Ozaki N.
  • 雑誌名: Transl Psychiatry 巻: 8 ページ: 61
  • DOI: 10.1038/s41398-017-0061-y,
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] ゲノム変異を用いた精神医学診断・評価システムの構築 (2018)
  • 著者名/発表者名: 木村大樹
  • 雑誌名: 精神医学 巻: 60 ページ: 43-50
• [雑誌論文] 注目の遺伝子「RTN4R」 (2018)
  • 著者名/発表者名: 木村大樹
  • 雑誌名: 分子精神医学 巻: 18 ページ: 50-52
• [学会発表] 脳と心を橋渡しする、精神療法と薬物療法の併用(教育研修セミナー) (2018)
  • 著者名/発表者名: 木村 大樹
  • 学会等名: 第61回日本精神分析学会(招待講演)
  • 招待講演
• [学会発表] 精神疾患のゲノム要因における稀な変異の意義と方向性について (2018)
  • 著者名/発表者名: 木村 大樹
  • 学会等名: 第40回日本生物学的精神医学会・第61回日本神経化学会合同年
  • 招待講演
• [学会発表] Target sequencing of genes involved in neurodevelopment from whole genome copy number variation analysis of Schizophrenia (2018)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Kimura
  • 学会等名: 26th World Congress of Psychiatric Genetics, UK, Dec 2018
  • 国際学会
• [図書] メディカルスタッフ専門基礎科目シリーズ; 精神医学 (2018)
  • 著者名/発表者名: 木村 大樹
  • 総ページ数: 25
  • 出版者: 理工図書