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2019 年度 実施状況報告書

オリゴメタスタシスの予後予測としてのcell free DNAの有効性検証の研究

研究課題

研究課題/領域番号 18K15611
研究機関国立研究開発法人国立がん研究センター

研究代表者

中村 匡希  国立研究開発法人国立がん研究センター, 東病院, 医員 (90804287)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワード大腸癌 / 直腸癌 / オリゴメタスタシス / cell free DNA
研究実績の概要

20症例の血漿サンプルから抽出されたDNAを東京大学にて先進ゲノム支援の元、NCCオンコパネルnovaseqによるシーケンスを行った。その後当院にて、Agilent surecallによる変異解析をおこなった。
大腸癌で認められる10遺伝子が検出可能であった。また、allele frequencyやclonalityなどについても評価を行なった。
患者の予後データについては当院のカルテで後ろ向きに抽出し、得られたゲノムデータとの相関関係を統計学的に評価した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

研究に必要なデータはすべて得られており、現在結果についての考察中である。
研究成果の学会報告と論文化については、今年度中に終了可能な見込みであり、進捗は順調と考える。

今後の研究の推進方策

現状はとくに問題は生じていない。
今後は得られた結果を学会や論文にて公表する予定である。

次年度使用額が生じた理由

先進ゲノム支援の支援を受けることで試薬台など物品費用を抑えることができた。
次年度は主に学会発表での旅費や参加費、オープンアクセスでの論文投稿費などに使用する予定である。

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公開日: 2021-01-27  

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