研究課題
遺伝子変異と同様にエピジェネティック異常も発がんの過程や病態進展に重要である。従来のDNAメチル化やヒストン修飾に加え、特にDNA高次構造/クロマチンループは病態進展の過程でダイナミックに変化し得るため、放射線抵抗性獲得の過程においても多くの遺伝子発現に影響を与える。またエピジェネティック異常は遺伝子変異とは異なり可逆的であると考えられており、異常な状態を正常化することで新たな治療標的となり得る。本研究では放射線抵抗性獲得に関するエピジェネティック異常を明らかにし、将来の放射線治療臨床を見据えた基礎作りをするため、放射線抵抗性細胞株を用いてエピジェネティクス解析を行うことでDNA高次構造に関連するタンパクであるCTCFの局在異常の存在、それによるDNA高次構造の変化と放射線抵抗性との関連を解明する。本研究では特に放射線治療抵抗性である膵癌の病態について研究することとした。これまでに筆者らの研究グループでは、RNAメチル化の変化が大腸癌細胞株において化学療法抵抗性に関わっていることを明らかにしてきた。RNAのメチル化はmRNAだけでなく、lncRNAの発現にも影響することが報告されており、またlncRNAを始めとするnon coding RNAはDNAの立体構造へ影響することがこれまでに示されている。そのため、ゲノム情報だけでなくトランスクリプトームについても解析することにより、広義のエピジェネティクスが放射線治療抵抗性にどのように関わっているか、より理解が深められると思われる。よってエピゲノムに加えてエピトランスクリプトームにも着目し、膵癌細胞株において遺伝子発現形式やRNAメチル化の変化がどのように放射線治療抵抗性に関わっているかを今年度の主な研究課題とした。
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