研究課題/領域番号 |
18K15889
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研究種目 |
若手研究
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配分区分 | 基金 |
審査区分 |
小区分53020:循環器内科学関連
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研究機関 | 大阪大学 |
研究代表者 |
多久和 綾子 大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任研究員 (50779791)
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研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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キーワード | 遺伝子解析 / 循環器疾患 / スプライシング異常 |
研究成果の概要 |
研究期間の前半では、トランスクリプトーム解析とDNA変異解析を組み合わせることにより、スプライシング異常を引き起こす変異の探索を行った。遺伝性循環器疾患患者の内、既知の病原性変異が同定されず、生検検体が得られる心移植例を対象に、WESとRNA-seqを実施し、そのリードマッピングの比較から複数のスプライシング異常原因変異候補を見出した。 一方、研究期間の後半では研究対象が血液腫瘍となり、体細胞変異解析とロングリードRNA-seqを組み合わせた迅速な診断システムの構築を試み、30%程度の症例について病原変異の同定が可能となっているほか、解析パイプラインの改善を進め解析日数の大幅な短縮にも成功した。
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自由記述の分野 |
臨床遺伝子解析
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
希少な遺伝性疾患は単一変異を原因としたものが多く、その病原変異の特定のためには、全エクソーム解析(WES)を含むNGSを用いた網羅的な遺伝子解析が有効である。しかしながら、遺伝子異常が強く疑われる症例であっても、WESでその原因変異を同定できる症例は50%程度にとどまっている。未解決の症例の中には、一見してアミノ酸変異を引き起こす変異はないものの、コピー数異常や構造異常、スプライシング異常を引き起こしているパターンが含まれていると想定されており、その解決は、治療方針の決定や遺伝カウンセリングに役立てることができるほか、高精度のスプライシング異常予測プログラムの開発に向けた情報を提供しうる。
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