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2019 年度 実績報告書

医原性リンパ増殖性疾患の遺伝子変異解析による病態解明および治療反応性の予測

研究課題

研究課題/領域番号 18K16076
研究機関筑波大学

研究代表者

日下部 学  筑波大学, 医学医療系, 講師 (40804381)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
キーワード悪性リンパ腫 / 医原性リンパ増殖性疾患 / 次世代シーケンス / 自己免疫疾患
研究実績の概要

筑波大学附属病院と共同研究先である虎ノ門病院の血液内科症例コホートから64例の医原性リンパ増殖性疾患(OIIA-LPD: other iatrogenic associated lymphoproliferative disorder)を同定した。それぞの症例についてリンパ節生検での組織型、免疫抑制剤内服開始の契機となった自己免疫疾患、免疫抑制剤の種類、免疫抑制剤中止の有無、免疫抑制剤中止後の反応、化学療法の有無、化学療法への反応性、生命予後などの臨床情報を抽出し、解析を行った。その結果、既報と同様にびまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL: diffuse large B-cell lymphoma)が約半数、次に古典的ホジキンリンパ腫(cHL: classical Hodgkin lymphoma)が約1/3であった。平成30年度末に懸案であった末梢性T細胞リンパ腫の頻度について施設間で頻度が違う問題について、病理組織学的なセントラルレビューの必要性がわかり、血液病理専門医に病理組織診断の確認を依頼し、解決することができた。解析対象としての新鮮凍結結標本の全て、FFPE永久標本の約半数では十分な品質、量のゲノムDNAを抽出することができた。検体からのDNAを材料としてリンパ系腫瘍関連412遺伝子を標的としたHaloPlex HSカスタムキットを用いて標的シーケンスのためのライブラリを作製した。平成30年度に約20症例のライブラリ調整を行い、すでにNextSeq500で全シーケンスリードのうち95%以上が標的領域にマップされることを確認していた。平成31年度にさらに約30症例のライブラリ調整を行い、MiSeqでのQCに問題ないことを確認している。今後、HiSeq 4000でのシーケンスにより深度の深いデータを獲得、解析し、論文化する予定である。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 5件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Molecular pathogenesis of progression to myeloid leukemia from TET-insufficient status2020

    • 著者名/発表者名
      Shrestha R、Sakata-Yanagimoto M、Maie K、Oshima M、Ishihara M、Suehara Y、Fukumoto K、Nakajima-Takagi Y、Matsui H、Kato T、Muto H、Sakamoto T、Kusakabe M、Nannya Y、Makishima H、Ueno H、Saiki R、Ogawa S、Chiba K、Shiraishi Y、Miyano S、Mouly E、Bernard OA、Inaba T、Koseki H、Iwama A、Chiba S
    • 雑誌名

      Blood Advances

      巻: 4 ページ: 845~854

    • DOI

      doi: 10.1182/bloodadvances.2019001324

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dasatinib is an effective treatment for angioimmunoblastic T-cell lymphoma2020

    • 著者名/発表者名
      Nguyen TB、Sakata-Yanagimoto M、Fujisawa M、Tanzima NS、Miyoshi H、Nannya Y、Hashimoto K、Fukumoto K、Bernard OA、Kiyoki Y、Ishitsuka K、Momose H、Sukegawa S、Shinagawa A、Suyama T、Sato Y、Nishikii H、Obara N、Kusakabe M、Yanagimoto S、Ogawa S、Ohshima K、Chiba S
    • 雑誌名

      Cancer Research

      巻: 80 ページ: -

    • DOI

      doi: 10.1158/0008-5472.CAN-19-2787

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Occurrence of T-cell and NK-cell subsets with less well-recognized phenotypes in peripheral blood submitted for routine flow cytometry analysis2020

    • 著者名/発表者名
      Hill Ainsleigh J.、Zhang Chaoran、Kusakabe Manabu、Gowing Kevin、Wang Xuehai、Brinkman Ryan R.、Weng Andrew P.、Craig Jeffrey W.
    • 雑誌名

      Cytometry Part B: Clinical Cytometry

      巻: - ページ: 1-5

    • DOI

      doi: 10.1002/cyto.b.21876

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Single Cell Phenotypic Profiling of 27 DLBCL Cases Reveals Marked Intertumoral and Intratumoral Heterogeneity2019

    • 著者名/発表者名
      Nissen MD、Kusakabe M、Wang X、Simkin G、Gracias D、Tyshchenko K、Hill A、Meskas J、Hung S、Chavez EA、Ennishi D、Aoki T、Sarkozy C、Connors JM、Farinha P、Slack GW、Gascoyne RD、Brinkman RR、Scott DW、Steidl C、Weng AP
    • 雑誌名

      Cytometry Part A

      巻: - ページ: 1-10

    • DOI

      doi: 10.1002/cyto.a.23919

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Synthetic modeling reveals HOXB genes are critical for the initiation and maintenance of human leukemia2019

    • 著者名/発表者名
      Kusakabe M、Sun AC、Tyshchenko K、Wong R、Nanda A、Shanna C、Gusscott S、Chavez EA.、Lorzadeh A、Zhu A、Hill A、Hung S、Brown S、Babaian A、Wang X、Holt RA、Steidl C、Karsan A、Humphries RK、Eaves CJ、Hirst M、Weng AP
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 ページ: 1-15

    • DOI

      doi: 10.1038/s41467-019-10510-8

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mutations found in cell‐free DNA s of patients with malignant lymphoma at remission can derive from clonal hematopoiesis2019

    • 著者名/発表者名
      Suehara Yasuhito、Sakata‐Yanagimoto Mamiko、Hattori Keiichiro、Kusakabe Manabu、Nanmoku Toru、Sato Taiki、Noguchi Masayuki、Chiba Shigeru
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 110 ページ: 3375~3381

    • DOI

      doi: 10.1111/cas.14176

    • 査読あり
  • [学会発表] Targeted sequencing and IgH rearrangement status revealed branching evolution pattern of SMZL and DLBCL2019

    • 著者名/発表者名
      Manabu Kusakabe
    • 学会等名
      The 10th JSH INTERNATIONAL SYMPOSIUM 2019 in Ise-Shima
    • 国際学会
  • [学会発表] Clinicopathological Analysis of “Other Iatrogenic Immunodeficiency-Associated Lymphoproliferative Disorders” Reveals a Favorable Outcome Independent of the Effectiveness of Methotrexate Discontinuation in Autoimmune Disease Patients2019

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Kaji
    • 学会等名
      61st ASH Annual Meeting and Exposition
    • 国際学会

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公開日: 2021-01-27  

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