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2020 年度 実績報告書

多剤耐性大腸菌ST131クローン特異的タンパク質の同定とその機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K16189
研究機関天理医療大学

研究代表者

中村 彰宏  天理医療大学, 医療学部, 講師 (30647087)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワードEscherichia coli / sequence type 131 / ESBL / carbapenemase / proteomics
研究実績の概要

近年、ESBLやカルバペネマーゼを産生するEscherichia coli ST131クローン(ST131)の世界的なパンデミックが問題視されているが、その原因は未だ明らかになっていない。われわれはST131パンデミックの原因を追究すべく、MALDI-TOF MSを用いてST131特異的タンパク質を探索し、その同定および機能予測を試みた。対象は国内医療機関31施設から分離されたESBL産生E. coli 197株(うちST131:98株)とし、ClinProToolsソフトウェアを用いてST131特異的ピークを抽出した。そのピークを示すタンパク質は逆相カラムによるHPLCで単離精製し、LC-MS/MSを用いたタンパク質同定、さらにDNAシークエンス解析を実施した。また、これらによって同定されたタンパク質は各種ウェブデータベースを用いてその機能予測を試みた。
本研究では、ST131特異的タンパク質として、7655 m/zを示すE34Aアミノ酸置換を有するYahOタンパク質(ペリプラズム層局在、機能不明)が抽出され、またその他にも11783 m/zを示す可溶性チトクロームb562(ペリプラズム層局在、機能不明)、9710 m/zを示すHdeA(ペリプラズム層局在、酸ストレス応答に関与)および8351 m/zを示すYjbJタンパク質(細胞質局在、機能不明)などが検出された。また、11783 m/zを示す可溶性チトクロームb562において、ST131細分類Cクレードに特有の配列を発見した。現在のところ機能不明なYahOや可溶性チトクロームb562はそのタンパク質間相互作用予測解析からバイオフィルム形成に関与している可能性が示唆された。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Novel strategy of rapid typing of Shiga toxin-producing Escherichia coli using MALDI Biotyper and ClinProTools analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Kubo Yumi、Ueda Osamu、Nagamitsu Sawa、Yamanishi Hachiro、Nakamura Akihiro、Komatsu Masaru
    • 雑誌名

      Journal of Infection and Chemotherapy

      巻: 18 ページ: 00071-4

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2021.03.002

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of the detection ability of uropathogen morphology and vaginal contamination by the Atellica UAS800 automated urine microscopy analyzer and its effectiveness2021

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Akihiro、Shinke Tetsuya、Noguchi Nobuyoshi、Komatsu Masaru、Yamanishi Hachiro
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Laboratory Analysis

      巻: 35 ページ: e23698

    • DOI

      10.1002/jcla.23698

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Fecal carriage and molecular epidemiologic characteristics of carbapenemase-producing Enterobacterales in primary care hospital in a Japanese city2020

    • 著者名/発表者名
      Ohno Yuki、Nakamura Akihiro、Hashimoto Eriko、Noguchi Nobuyoshi、Matsumoto Gaku、Fukuda Saori、Abe Noriyuki、Matsuo Shuji、Komatsu Masaru
    • 雑誌名

      Journal of Infection and Chemotherapy

      巻: 26 ページ: 928~932

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2020.04.012

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prediction of Uropathogens by Flow Cytometry and Dip-stick Test Results of Urine Through Multivariable Logistic Regression Analysis2020

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Akihiro、Kohno Aya、Noguchi Nobuyoshi、Kawa Kenji、Ohno Yuki、Komatsu Masaru、Yamanishi Hachiro
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 15 ページ: e0227257

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0227257

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] BDマックスを用いた各種カルバペネマーゼ産生遺伝子Multiplex PCR融解曲線解析法の構築2021

    • 著者名/発表者名
      中村彰宏、太田嘉一、小松 方
    • 学会等名
      第32回日本臨床微生物学会
  • [学会発表] 多剤耐性腸内細菌目細菌における新規コリスチン耐性遺伝子mcr-9コーディングゲノム構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      中村彰宏、中村竜也、仁木 誠、口広智一、西 功、小松 方
    • 学会等名
      第32回日本臨床微生物学会
  • [学会発表] 腸管感染症に有用な検査法とその役割 -分離培養および用手法同定法-2021

    • 著者名/発表者名
      中村彰宏
    • 学会等名
      第32回日本臨床微生物学会
    • 招待講演
  • [学会発表] Comparison of beta-lactamase-producing Escherichia coli ST131 C1-M27 and ST131 non-C1-M27 by whole genome analysis using next-generation sequencing in Japan2020

    • 著者名/発表者名
      Nobuyoshi Noguchi, Akihiro Nakamura, Masaru Komatsu
    • 学会等名
      30th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
    • 国際学会

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公開日: 2021-12-27  

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