| 研究実績の概要 |
circular RNA(以下circRNA)は、数百から数千の塩基からなる環状で安定した構造を持つRNAである。哺乳類を含む真核生物で豊富に発現しており、数万種の存在が確認されている。また、microRNAやRNA Binding Proteinsを介して転写、翻訳を調節する機能を有している。癌を含む様々な疾患との関連性が指摘されつつあり、新たなバイオマーカーや核酸医薬への応用が期待される。
本研究の目的は、食道扁平上皮癌(ESCC)と関連するcircRNAを特定すること、さらに、特定されたcircRNAを用いて新規のバイオマーカーや核酸医薬開発の可能性を探索することである。
ESCCの細胞株であるTE11と、シスプラチン暴露により樹立したTE11シスプラチン耐性株(TE11R)を次世代シークエンスにて解析し、Circexpolorer2を用いてcircRNAを検出した。19085のcircRNAが検出され、87がTE11Rで有意に高発現(p<0.05, fold-change>2.0)、105が有意に低発現(p<0.05, fold-change<0.5)であった。TE11RにてTE11よりも高発現を示す10のcircRNAについてqRT-PCRにて発現定量を行ったところ、TE11およびTE8のシスプラチン耐性株において親株よりも高発現を示すcircRNA(以下circX)を同定した。また、TE11およびTE11RにてcircXをsiRNAを用いてノックダウンし薬剤感受性試験を行ったところ、circXのノックダウンによって薬剤感受性が増強することが確認された。CircXはシスプラチン耐性に関連するcircRNAが検出された可能性が示唆された。
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