| 研究課題/領域番号 |
18K16869
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| 研究機関 | 独立行政法人国立病院機構(東京医療センター臨床研究センター) |
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研究代表者 |
和佐野 浩一郎 独立行政法人国立病院機構(東京医療センター臨床研究センター), 聴覚・平衡覚研究部, 室長 (40528866)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| キーワード | 遺伝子バリアント / 機能解析 / スプライシング |
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| 研究実績の概要 |
ペンドリンをコードする遺伝子（ＳＬＣ２６Ａ４）において、実際に難聴患者より同定されたバリアントがどのように転写・翻訳およびイオン輸送機能へ影響を及ぼすかについての検討を行っている。平成３０年度はおもにバリアントが転写・翻訳へ及ぼす影響を、ｐＥＴ０１ベクターを用いてスプライシングに注目して検討を行った。具体的にはエクソン２からエクソン１８までの野生型エクソンとその前後のイントロンを含むベクターおよび難聴患者より同定された３３種のバリアントを導入したエクソンとその前後のイントロンを含むベクターを作成し、野生型エクソンを導入したヒト由来培養細胞（ＨＥＫ２９３Ｔ細胞）において発現するmRNAとバリアントを含むベクターを導入した培養細胞において発現するｍＲＮＡを抽出し、ＤＮＡへの逆転写およびＰＣＲにて増幅を行い、その長さを比較するとともに産物のシーケンスを読むことで実際の転写産物を解析している。一般的にはスプライシングに関与しないと予測されるようなミスセンスバリアントのなかにも、エクソンのスキップや明らかな異常スプライシング産物が観察されるバリアントを認め、予測ソフトに頼るのではなく実際に細胞を用いて検討を行うことの重要性を示すことができた。
成果に関しては、日本人類遺伝学会第６３回大会、第２８回日本耳科学会学術講演会、第６３回日本聴覚医学会学術講演会、ARO 42nd annual Midwinter meetingで関連する発表を行うとともに、他の研究者と活発な議論を行った。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
研究の最大の目的である遺伝子型表現型相関を見るためには、スプライシングに関する検討が必須であることから、平成30年度はその検討を重点的に行った。
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| 今後の研究の推進方策 |
遺伝子型情報および難聴の重症度、進行度および甲状腺に関する表現型を収集し、相関の解明を進めるとともに、薬剤スクリーニング系を立ち上げる。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
インジェクターなどの物品購入を次年度に回したため。
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