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2019 年度 実績報告書

組成比を制御したヘテロ多量体調製技術による人工フィコビリソームの創製

研究課題

研究課題/領域番号 18K19145
研究機関京都大学

研究代表者

中田 栄司  京都大学, エネルギー理工学研究所, 准教授 (70467827)

研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2020-03-31
キーワードヘテロ多量体 / DNAナノ構造体 / DNA結合タンパク質 / 平衡制御
研究実績の概要

本研究では、光捕集アンテナタンパク質複合体(フィコビリソーム)の構成要素の一つでホモ三量体を構築することが知られているアロフィコシアニン(APC)を利用して、合目的にヘテロ三量体をつくりわけて、新規な光機能をもったAPCヘテロ三量体を構築することである。そのための基本戦略としては、「異なる各単量体をナノ構造体の足場に配置してヘテロ三量体を形成させる。」と「ナノ構造体の設計によって様々なヘテロ三量体をつくりわける」ことが挙げられる。
昨年度は、前半の目的達成のために、ナノ構造体上に異なる種類のタンパク質を配置するためのモジュール型アダプター戦略を拡張し、ヘテロ量体を構築することができるような展開をおこない、当該年度内にこのモジュール型アダプター戦略の拡張に関する成果が論文として掲載された。これは、モジュール型アダプターを構成する「DNA結合性モジュール」と「共有結合形成モジュール」のうち、「共有結合形成モジュール」を同一にした合理的設計法に基づく成果であったが、当該年度にはこれをさらに拡張した戦略についても挑戦し、成果を得た。これについては、今後論文投稿をおこなっていく予定である。また当該年度は、当初の計画通り、アダプター融合APCの設計調整をおこない、APCの機能を保持した状態で獲得することを目指したが、この点については良好な結果を得るには至っていない。発現宿主を検討することなどを視野に入れて引き続きの検討が必要である。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Rational design of a DNA sequence specific modular protein tag by tuning the alkylation kinetics2019

    • 著者名/発表者名
      T.M. Nguyen, E. Nakata, Z. Zhang, M. Saimura, H. Dinh, T. Morii
    • 雑誌名

      Chemical Science

      巻: 10 ページ: 9315-9325

    • DOI

      DOI: 10.1039/c9sc02990g

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reaction of ribulose biphosphate carboxylase/oxygenase assembled on a DNA scaffold2019

    • 著者名/発表者名
      H. Dinh, E. Nakata, P. Lin, M. Saimura, H. Ashida, T. Morii
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      巻: 27 ページ: 115120

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.bmc.2019.115120

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Protein adaptors assemble functional proteins on DNA scaffolds2019

    • 著者名/発表者名
      T. A. Ngo, H. Dinh, T.M. Nguyen, F.F. Liew, E. Nakata, T. Morii
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 27 ページ: 12428-12446

    • DOI

      DOI: 10.1039/c9cc04661e

    • 査読あり
  • [学会発表] Tuning the reactivity of crosslink formation for sequence-selective DNA-protein conjugation2020

    • 著者名/発表者名
      Z. ZHANG, E. NAKATA, N. THANG, M. SAIMURA, K. MATSUDA, T. MORII
    • 学会等名
      日本化学会 第100春季年会 (2020)
  • [学会発表] Enhanced enzymatic activity with a packed assembly on DNA scaffold2020

    • 著者名/発表者名
      H. DINH, E. NAKATA, K. MUTSUDAZAPATER, M. SAIMURA, M. KINOSHITA, T. MORII
    • 学会等名
      日本化学会 第100春季年会 (2020)
  • [学会発表] A dynamic DNA scaffold for enzyme cascade reaction2020

    • 著者名/発表者名
      P. LIN, H. DINH, Y. MORITA, E. NAKATA, T. MORII
    • 学会等名
      日本化学会 第100春季年会 (2020)
  • [学会発表] 酵素間距離を制御する分子コンビナートを用いた非天然化合物合成システムの創製2019

    • 著者名/発表者名
      中田栄司,森井孝
    • 学会等名
      新学術領域「生合成リデザイン」公開シンポジウム
  • [学会発表] 反応速度論に基づいたDNA配列選択的なモジュール型アダプターの設計2019

    • 著者名/発表者名
      中田栄司,張正宵,Nguyen Minh Thang,才村正幸,松田一成,森井孝
    • 学会等名
      第13回バイオ関連化学シンポジウム2019
  • [学会発表] DNA Binding Adaptors to Locate Multiple Enzymes on DNA scaffold2019

    • 著者名/発表者名
      E. Nakata, T. Morii
    • 学会等名
      第10回日英シンポジウム
    • 国際学会
  • [学会発表] Design of sequence specific modular adaptors by tuning the reactivity of protein-tag substrate2019

    • 著者名/発表者名
      Zhengxiao Zhang, Eiji Nakata, Thang Minh Nguyen, Takashi Morii
    • 学会等名
      ISNAC2019
  • [学会発表] DNA Binding Adaptors to Locate Multiple Enzymes on a DNA scaffold2019

    • 著者名/発表者名
      E. Nakata, T. Morii
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium of Biofunctional Chemistry
    • 国際学会
  • [学会発表] DNA Binding Adaptors to Locate Multiple Enzymes on a DNA scaffold2019

    • 著者名/発表者名
      E. Nakata, T. Morii
    • 学会等名
      曁南大学 講義
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] DNA Binding Adaptors to Locate Multiple Enzymes on a DNA scaffold2019

    • 著者名/発表者名
      E. Nakata, T. Morii
    • 学会等名
      武漢大学 講義
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2021-12-27  

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