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2019 年度 実績報告書

高活性セレンタンパク質発現系の構築と応用

研究課題

研究課題/領域番号 18K19189
研究機関立命館大学

研究代表者

三原 久明  立命館大学, 生命科学部, 教授 (30324693)

研究分担者 戸部 隆太  立命館大学, 生命科学部, 講師 (00758823)
研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2020-03-31
キーワードセレンタンパク質 / SECIS
研究実績の概要

セレンタンパク質は、21番目のタンパク質構成アミノ酸であるセレノシステイン (Sec) 残基が特異的に挿入されたタンパク質の総称であり、真核生物や細菌、アーキアに広く存在している。Sec は、本来タンパク質の翻訳が終結する終止コドン UGA によってコードされている。UGA をSecとして翻訳するためには、mRNAのUGA下流に存在してステム-ループ型二次構造を形成するセレノシステイン挿入配列 (SECIS) と、それに結合する特殊な翻訳伸長因子 (SelB)が必要である。複数種の異なるセレンタンパク質をもつ生物において、各々のセレンタンパク質mRNAのSECIS の配列、長さ、形状には多様性が認められる。このように多様なSECISをSelBがどのようにして認識するのかは未だ解明されていない。また一方で、ある特定の生物種のセレンタンパク質遺伝子を異種宿主内で発現させる場合に、異種のSECISへの宿主SelBの結合がうまく行かずに翻訳が進まないことがある。本研究では、様々な生物種のセレンタンパク質の SECIS が大腸菌において機能し得るかどうかを判別するためのアッセイ系を構築し、Geobacter sulfurreducensが有する9種のセレンタンパク質に対応した SECIS において大腸菌内で機能し得るものを明らかにすることを目的とした。大腸菌宿主において、どのようなSECISが機能しやすいのかを定量的に解析するために、大腸菌のセレンタンパク質であるギ酸脱水素酵素遺伝子(fdhF)の開始コドンからSECIS配列までを含むDNA断片にホタル由来ルシフェラーゼ遺伝子 (fLuc) 断片を連結したコンストラクトを挿入したプラスミドを作製し、SECIS の機能を評価する系を構築した。G. sulfurreducens が有する9種のセレンタンパク質に対応する SECIS を推定し、本アッセイ系を用いて解析を行った。その結果、解析した SECIS のうち5 種が大腸菌内でも機能し得ることが示唆された。

  • 研究成果

    (28件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (24件) (うち国際学会 5件、 招待講演 4件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Thapar Institute of Eng. Technol.(インド)

    • 国名
      インド
    • 外国機関名
      Thapar Institute of Eng. Technol.
  • [雑誌論文] Selenite uptake by outer membrane porin ExtI and its involvement in the subcellular localization of rhodanese-like lipoprotein ExtH in Geobacter sulfurreducens2019

    • 著者名/発表者名
      Jahan Mst. Ishrat、Juengwiwattanakitti Panudeth、Izu Yukiko、Tobe Ryuta、Imai Tomoya、Mihara Hisaaki
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 516 ページ: 474~479

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.06.037

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Apolipoprotein E-mediated regulation of selenoprotein P transportation via exosomes2019

    • 著者名/発表者名
      Jin, Y., Chung, Y. W., Jung, M. K., Lee, J. H., Ko, K. Y., Jang, J. K., Ham, M., Kang, H., Pack, C. G., Mihara, H., and Kim, I. Y.
    • 雑誌名

      Cell Mol Life Sci

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1007/s00018-019-03287-y

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 転写調節因子 NsrR のモリブデン補因子生合成における役割2020

    • 著者名/発表者名
      藤田大樹, 西田亮, 戸部隆太 三原久明
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [学会発表] セレン耐性菌 Cellulomonas sp. D3a 株における亜セレン酸還元機構の解析2020

    • 著者名/発表者名
      戸部隆太, 牧村康平, 坂本暁紀, T. N. Prakash, 三原久明
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [学会発表] Pseudomonas putida KT2440株由来D-リジントランスポーターによる基質認識2020

    • 著者名/発表者名
      三原久明, S. Champas, 山内美咲, 戸部隆太
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [学会発表] 大腸菌におけるセレン酸・テルル酸還元関連遺伝子群の解析2019

    • 著者名/発表者名
      藤田大樹, 森聡美, 西田亮, 安間友香理, 田島寛隆, 戸部隆太, 三原久明
    • 学会等名
      第36回日本微量栄養素学会学術集会
  • [学会発表] 大腸菌におけるセレン酸・テルル酸還元関連遺伝子群の解析2019

    • 著者名/発表者名
      藤田大樹, 戸部隆太, 三原久明
    • 学会等名
      メタルバイオサイエンス研究会2019
  • [学会発表] Bacillus sp. NTP-1由来新奇DMSOレダクターゼファミリー酵素の研究2019

    • 著者名/発表者名
      葛野侑香, 戸部隆太, 三原久明
    • 学会等名
      酵素・補酵素研究会2019
  • [学会発表] Geobacter sulfurreducens由来のロダネーゼ様酵素ExtHの精製条件検討と諸性質解析2019

    • 著者名/発表者名
      石戸雄大, 山根祥延, 戸部隆太, 三原久明
    • 学会等名
      第62回日本生化学会近畿支部例会
  • [学会発表] ペルオキシダーゼ活性を有するTruncated hemoglobin (YjbI) の過酸化水素に対する反応2019

    • 著者名/発表者名
      田中麻衣, 今井岳志, 戸部隆太, 三原久明
    • 学会等名
      日本生物高分子学会2019年度大会
  • [学会発表] Bacillus属細菌のテルル酸還元酵素の同定2019

    • 著者名/発表者名
      渡邊樹, 生田帆河, 戸部隆太, 川本純, 栗原達夫, 広瀬侑, 今井友也, N. T. Prakash, 三原久明
    • 学会等名
      第30回日本微量元素学会学術集会
  • [学会発表] Bacillus subtilisのテルル酸還元メカニズムの解明2019

    • 著者名/発表者名
      渡邊樹, 戸部隆太, 三原久明
    • 学会等名
      メタルバイオサイエンス研究会2019
  • [学会発表] タンパク質の工学的創製と高活性セレンタンパク質2019

    • 著者名/発表者名
      戸部隆太, 川上百香, 三原久明
    • 学会等名
      メタルバイオサイエンス研究会2019
    • 招待講演
  • [学会発表] Geobacter sulfurreducensのマルチヘムセレンタンパク質型亜セレン酸還元酵素の機能・構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      戸部隆太, 吉澤拓也, 伊豆由記子, 吉村文太, 松村浩由, 三原久明
    • 学会等名
      第5回日本セレン研究会
  • [学会発表] 大腸菌ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼが触媒する複数反応2019

    • 著者名/発表者名
      大場杏奈, 吉田吉孝, 石田哲夫, 戸部隆太, 三原久明
    • 学会等名
      日本ビタミン学会第71回大会
  • [学会発表] 大腸菌ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼの触媒特性について2019

    • 著者名/発表者名
      三原久明, 大場杏奈, 吉田吉孝, 石田哲夫, 戸部隆太
    • 学会等名
      第457回ビタミンB研究協議会
  • [学会発表] Pseudomonas putidaのD-リジントランスポーターの基質特異性2019

    • 著者名/発表者名
      三原久明
    • 学会等名
      第458回ビタミンB研究協議会
  • [学会発表] Function and structure of multiheme-containing selenoprotein2019

    • 著者名/発表者名
      Ryuta Tobe, T. Yoshizawa, Y. Izu, M. I. Jahan, B. Yoshimura, H. Matsumura, H. Mihara
    • 学会等名
      The 8th International Selenium Conference (Se2019)
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Role of outer membrane porin ExtI in selenite reduction in a metal-reducing bacterium2019

    • 著者名/発表者名
      H. Mihara, M. I. Jahan, P. Juengwiwattanakitti, Y. Izu, R. Tobe
    • 学会等名
      The 8th International Selenium Conference (Se2019)
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A novel selenite-reducing system in the dissimilatory metal-reducing bacterium Geobacter sulfurreducens2019

    • 著者名/発表者名
      H. Mihara, M. I. Jahan, M. Jinno, N. Shimamoto, Y. Ishido, P. Juengwiwattanakitti, Y. Izu, R. Tobe
    • 学会等名
      Goldschmidt 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] Selenium metabolism in bacteria2019

    • 著者名/発表者名
      H. Mihara
    • 学会等名
      The 1st International Workshop on Metallomoics and Nanoparticles
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Interaction between rhodanese-related sulfurtransferase ExtH and outer membrane porin ExtI in Geobacter sulfurreducens2019

    • 著者名/発表者名
      P. Juengwiwattanakitti, M. I. Jahan, Y. Izu, Y. Ishido, R. Tobe, H. Mihara
    • 学会等名
      第5回日本セレン研究会
  • [学会発表] Purification of glyoxylate oxidase from Gluconobacter dioxyacetonicus A152019

    • 著者名/発表者名
      K. Jakkaphan, R. Tobe, H. Mihara
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
  • [学会発表] The NsrR is essential for the function of selenate/tellurate reductase via activation of the moeA gene in Escherichia coli2019

    • 著者名/発表者名
      Daiki FUJITA, Ryo NISHIDA, Ryuta TOBE, H. MIHARA
    • 学会等名
      The 1st International Workshop on Metallomoics and Nanoparticles
    • 国際学会
  • [学会発表] Substrate specificity of DlcA of D-lysine ABC transporter from Psuedomonas putida2019

    • 著者名/発表者名
      S. Champas, M. Yamauchi, R. Tobe, H. Mihara
    • 学会等名
      日本農芸化学会関西・中部支部2019年度合同神戸大会
  • [学会発表] Characterization of the substrate-binding protein DlcA of D-lysine transporter from Pseudomonas putida KT24402019

    • 著者名/発表者名
      S. Champas, M. Yamauchi, R. Tobe, H. Mihara
    • 学会等名
      第36回日本微量栄養素学会学術集会
  • [備考] 立命館大学 研究者学術情報 データベース

    • URL

      http://research-db.ritsumei.ac.jp/Profiles/64/0006361/profile.html

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公開日: 2021-01-27  

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