| 研究課題/領域番号 |
18KK0172
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
安井 康夫 京都大学, 農学研究科, 助教 (70293917)
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| 研究分担者 |
水野 信之 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 次世代作物開発研究センター, 任期付研究員 (30829180)
FAWCETT JEFFREY 国立研究開発法人理化学研究所, 数理創造プログラム, 上級研究員 (50727394)
大迫 敬義 京都府立大学, 生命環境科学研究科, 准教授 (80363969)
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| 研究期間 (年度) |
2018-10-09 – 2022-03-31
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| キーワード | 栽培ソバ / 野生ソバ / 雲南省 / 東チベット / ソバの起原 / ゲノムスキャン |
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| 研究実績の概要 |
【概要】
野生ソバ（Fagopyrum esculentum ssp. ancestrale）は雲南省を中心とする中国南部にのみ自生し、栽培ソバ（F. esculentumssp. esculentum）と交配可能な重要な植物遺伝資源である。しかし世界のどこにも野生ソバ遺伝資源は構築されておらず、中国の急速な発展とともにその遺伝資源は失われようとしている。そこで本研究では共同研究先の雲南農業大学（YAU）において野生ソバを中心としたソバ遺伝資源の維持管理システムを構築する。また、遺伝資源に含まれる野生および栽培ソバの全ゲノム配列決定から、ソバの栽培化に関与した育種上重要な遺伝子群を網羅的に同定し、最終的にソバの栽培化プロセスを解明する。このような学術的かつ応用的にもインパクトの高い成果を挙げることにより、YAUでのソバ遺伝資源研究の拠点形成と強化を図る。
【本年度の成果】
本年度はコロナウイルス蔓延防止の観点から、中国での調査を2021年度以降に延期した。しかしながら、前年度に採集した栽培および野生ソバの全ゲノム解析データを解析し、チベット東部および雲南省北西部の境界近辺の野生種と栽培種が近縁であることを見出した。また、栽培種に特異的に見られる人為選択を受けたゲノム領域の検出に成功した。
【2021年度以降の予定】
チベット東部での野生ソバのサンプリングが重要であると考えている。コロナウイルスの鎮静化を待って、10月にサンプリングを実施する予定。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
これまでに当初の目的どおりにソバの採集とWGSの解析を実施し、野生種と栽培種でのゲノム比較を実施できた。本研究はほぼ終了となっている。あとはコロナウイルスの状況次第ではあるが、東チベットでのサンプリングと全ゲノムシーケンス解析が実施できれば、満点の成果となる。
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| 今後の研究の推進方策 |
コロナウイルスの状況をみて、中国での調査、サンプリング、全ゲノムシーケンス解析を行う。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
コロナウイルス蔓延防止のため、研究活動を制限した。特に中国へのサンプリングを中止したため、旅費とゲノム解読に関わる経費が未使用となった。この未使用経費は2021年度に予定している中国調査とゲノム解析に利用する予定である。
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