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2019 年度 実施状況報告書

野生コムギ集団に眠る未知の多様性の発掘と評価:栽培化過程解明と育種利用基盤構築

研究課題

研究課題/領域番号 18KK0173
研究機関神戸大学

研究代表者

森 直樹  神戸大学, 農学研究科, 教授 (60230075)

研究分担者 竹中 祥太朗  龍谷大学, 農学部, 講師 (20757736)
丹野 研一  龍谷大学, 文学部, 准教授 (10419864)
研究期間 (年度) 2018-10-09 – 2023-03-31
キーワード野生コムギ / 遺伝資源 / 遺伝的多様性 / 自然集団 / 疑似自然集団 / 栽培化
研究実績の概要

コムギは、約1万年前にレヴァント北部で栽培化された。祖先野生種はその自生地の多様な環境に適応・進化しており、集団内・集団間で非常に高い多様性をもつことがわかってきた。しかし、栽培化起源地であるトルコ南部の野生コムギ集団は人為的環境破壊によって消失の危機にある。本研究では、集団内に眠っている多様性の持続的・発展的な利用基盤を確立するため、自然集団から任意抽出して作出した「疑似自然集団群」を整備することを目的としている。また、これらの野生コムギ集団内の遺伝的多様性を適応的形質と中立的DNA変異の両面から調査し、変異の種類とその集団内頻度を解明する。そして、コムギ栽培化の初期にどのような遺伝的構成をもつ自然集団が人為選抜の対象となったのかを探る。
本研究では期間全体を通じて以下の目標を置いて計画を進めている。1)自然集団内の変異を反映した疑似自然集団群の作出、2)適応形質と中立的DNA変異の両面からみた集団内および集団間の遺伝的構成の解明、3)栽培化に寄与した祖先集団の特定、4)栽培化に寄与した集団の遺伝的特徴の解明。 上記の研究計画の1)から推進するため、2018年の10月に野生4倍性コムギ(野生二粒系コムギおよび野生チモフェービ系コムギの両種を含む)について疑似自然集団群の作出を開始した。これまでの現地調査で採集し、チュクロワ大学で保存している野生コムギのサンプルから、トルコ南部におけるこれらの分布域のほぼ全域をカバーする5つの自然集団を選び、それぞれの集団から23-64個体(221個体)を任意抽出して播種し、栽培を試みたが収穫に至らなかった。そこで、昨年(2019年)の10月に新たに2集団を加えて7つの集団288個体を播種した。2020年の初夏にこれらの自殖種子を得るとともに、すべての系統からDNAを抽出することを目指している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

本研究では、消失の危機にある栽培化起源地の野生コムギ集団を持続的・発展的に利用するため、野生2倍性コムギと野生4倍性コムギについて自然集団の多様性を反映させた擬似自然集団の育成とその利用・解析に取り組んでいる。
これまでに自然集団で採集し共同研究先であるチュクロワ大学に保存中の採集サンプルから、現地の地理的条件なども考慮し11の野生2倍性コムギ集団と18の野生4倍性コムギの集団を選定した。当初の計画通り、まず野生4倍性コムギの疑似自然集団群を作成することとした。平成30年(2018年)の10月に、上記の集団のうち野生4倍性コムギの5集団(221個体)を選び、それぞれ23~64の小穂を任意抽出し、小穂ごとに1粒の穎果を選んで識別番号をつけた。ろ紙を敷いたシャーレにこれらを播種し、発芽した頴果をプラスチックポットに仮植えした。共同研究者であるチュクロワ大学のオズカン教授に依頼し、これらの植物を平成30年12月にチュクロワ大学構内の実験圃場に定植した。これらの系統を平成31年4月から5月にかけて現地で自家受粉させ、6月にその種子を収穫する予定であったが、現地の状況が悪く収穫に至らなかった。そのため、昨年(2019年)9月(森、大田、竹中)と11月(森、大田)の2回にわたってトルコへ渡航し、上記の5集団に新たに2集団を加えて計7集団から288個体を任意抽出して11月に再度播種した。
現在、チュクロワ大学にて栽培中であり、自殖種子やDNA抽出用の葉の組織を採集する予定である。しかしながら、今年に入ってからの新型コロナウイルスの世界的感染拡大によりトルコでも大きな被害が出ており、予定通りに収穫まで完了できるかできるかどうか懸念される。

今後の研究の推進方策

本研究では、これまでのジーンバンクでは実現できなかった自然集団内の遺伝的多様性を反映したコムギ遺伝資源の永続的利用基盤の構築を1つの大きな柱としている。これまでにトルコ国内で実施したフィールド調査では、それぞれの調査集団ごとに多くの個体を無作為に採集してきた。本研究では、これらのサンプルから集団ごとに複数の個体をランダムに抽出しそれらを単粒系統法にて自殖することにより純系統化し、自然集団の遺伝的変異を反映しつつ永続的な維持・利用が可能な「疑似自然集団群」を作成する。
そのため、今年度は昨年の11月にチュクロワ大学にて播種し、現在現地で育成中の植物について、以下の3点を進める計画である。1)開花前に硫酸紙の交配用袋をかけて自殖させる。2)DNAレベルにおける多様性を調査するため育成中の個体ごとに生葉を0.5グラムずつ採取し凍結保存する。3)登熟後にこれらを個体ごとに収穫し穂の形態的特徴や穂ごとの穎果数や重量などを記録して冷蔵保存する。
しかし、今年に入ってからの新型コロナウイルスの感染拡大がトルコでも続いており、現在トルコへの渡航も難しい状況にある。今後は、新型コロナウイルスの動向を注視しながら、計画の延期も含めて計画の再調整が必要であると思われる。

次年度使用額が生じた理由

本研究の研究代表者(森)がトルコに渡航する際、研究協力者として大学院学生を同行させる予定であったが、現地の治安状況が悪化していることなどを考慮して同行させなかったため。本年度に新型コロナウイルスの状況を考慮しつつ、旅費およびサンプルの解析に使用する予定である。

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (10件)

  • [国際共同研究] チュクロワ大学農学部(トルコ)

    • 国名
      トルコ
    • 外国機関名
      チュクロワ大学農学部
  • [雑誌論文] Development of self-fertile deletion homozygous and ditelosomic lines for the long arm of chromosome 2A in common wheat2020

    • 著者名/発表者名
      Takenaka Shotaro, Joshi Giri P., Endo Takashi R.
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 95 ページ: 95~99

    • DOI

      10.1266/ggs.19-00063

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Variations in radioactive cesium accumulation in wheat germplasm from fields affected by the 2011 Fukushima nuclear power plant accident.2020

    • 著者名/発表者名
      Kubo, K., H. Kobayashi, M. Nitta, S. Takenaka, S. Nasuda, S. Fujimura, K. Takagi, O. Nagata,T. Ota, T. Shinano
    • 雑誌名

      Scientific reports

      巻: 10 ページ: 3744 - 3744

    • DOI

      https://doi.org/10.1038/s41598-020-60716-w

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 日本初の皮性小麦品種「発掘のごほうび(デュラムコムギ)」 収穫後調整方法に関するメモ2020

    • 著者名/発表者名
      丹野 研一
    • 雑誌名

      『都市文明の本質:古代西アジアにおける都市の 発生と変容の学際研究』成果報告書2019年度(山田重郎編)

      巻: - ページ: 45 - 50

  • [雑誌論文] パンコムギの冠水応答にみられるコムギ・エギロプス属細胞質の多様性2019

    • 著者名/発表者名
      竹中祥太朗, 山本涼平, 中村千春
    • 雑誌名

      植物科学の最前線

      巻: 10 ページ: 203 - 210

    • DOI

      https://doi.org/10.24480/bsj-review.10c12.00172

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genetic dissection of grain morphology in hexaploid wheat by analysis of the NBRP-Wheat core collection.2019

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka M, S. Takenaka, M. Nitta, J. Li, N. Mizuno, S. Nasuda
    • 雑誌名

      Genes & genetic systems 94(1) 35-49

      巻: 94 ページ: 35 - 49

    • DOI

      https://doi.org/10.1266/ggs.18-00045

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Harvest index is a critical facter influencing the grain yield of diverse wheat species under rain-fed conditions in the Mediterranean zone of southeastern Turkey and northern Syria.2019

    • 著者名/発表者名
      Kobata, T., M. Koc, C. Barutcular, K. Tanno, M. Inagaki
    • 雑誌名

      Plant Production Science

      巻: 21 ページ: 72 - 82

    • DOI

      https://doi.org/10.1080/1343943X.2018.1445534

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 野生一粒系コムギにおける穎果サイズと種子休眠性の小穂内二型性:栽培型との雑種第2世代における形質の分離2020

    • 著者名/発表者名
      松下 沙樹, 久保 瑞穂, 大田 正次
    • 学会等名
      一般社団法人 日本育種学会第 137回講演会
  • [学会発表] 一粒系コムギにおける小穂あたりの着粒数と種子休眠性の遺伝学的解析2019

    • 著者名/発表者名
      松井寧々, 森直樹, 大田正次
    • 学会等名
      第14回 ムギ類研究会
  • [学会発表] コムギの近縁野生種Aegilops geniculataの種内の変異と遺伝的分化2019

    • 著者名/発表者名
      吉村優介, 森直樹, 大田正次
    • 学会等名
      第14回 ムギ類研究会
  • [学会発表] エンマーコムギの戻し交雑自殖系統群による穂の形態形質の遺伝学的解析2019

    • 著者名/発表者名
      山口雄平,宮崎裕貴,森直樹
    • 学会等名
      第14回 ムギ類研究会
  • [学会発表] エンマ―コムギのF3集団を用いた小穂内の頴果サイズと種子休眠性の遺伝学的解析2019

    • 著者名/発表者名
      福山智章, 森直樹, 大田正次
    • 学会等名
      第14回 ムギ類研究会
  • [学会発表] 野生エンマ―コムギの遺伝的背景を持つ戻し交雑自殖系統を用いた草型の解析2019

    • 著者名/発表者名
      粕淵 星也, 島田 沙織, 牛 恒一, Vladutu Cristian, Kianian Shahryar, 森 直樹
    • 学会等名
      第14回 ムギ類研究会
  • [学会発表] タルホコムギとの交雑親和性およびタルホコムギとのF1雑種の自殖着粒率からみた二粒系コムギのナチュラルバリエーション2019

    • 著者名/発表者名
      松岡由浩, 森直樹
    • 学会等名
      第14回 ムギ類研究会
  • [学会発表] テル・エル・ケルク遺跡の考古植物調査から始まった小麦新品種の開発2019

    • 著者名/発表者名
      丹野研一
    • 学会等名
      第24回 日本西アジア考古学会
  • [学会発表] 「パンの起源、ビールの起源、農耕の起源」2019

    • 著者名/発表者名
      丹野研一
    • 学会等名
      宗像発酵研究所(沖縄県宜野湾市)
  • [学会発表] 「沖縄のための小麦新品種~栽培 加工方法の要点~」2019

    • 著者名/発表者名
      丹野研一
    • 学会等名
      宗像発酵研究所(沖縄県宜野湾市)

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公開日: 2021-01-27  

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