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2023 年度 実施状況報告書

野生コムギ集団に眠る未知の多様性の発掘と評価:栽培化過程解明と育種利用基盤構築

研究課題

研究課題/領域番号 18KK0173
研究機関神戸大学

研究代表者

森 直樹  神戸大学, 農学研究科, 教授 (60230075)

研究分担者 大田 正次  福井県立大学, 生物資源学部, 教授 (80176891) [辞退]
竹中 祥太朗  龍谷大学, 農学部, 講師 (20757736)
丹野 研一  龍谷大学, 文学部, 准教授 (10419864)
研究期間 (年度) 2018-10-09 – 2025-03-31
キーワード遺伝資源 / 野生コムギ / 遺伝的多様性 / 自然集団 / 擬似自然集団 / 栽培化
研究実績の概要

コムギは、約1万年前に肥沃な三日月地帯の北部で栽培化された。栽培化起源地であるトルコ南部に自生する祖先野生種はこの地域の多様な環境に適応しており、集団内・集団間で非常に高い多様性をもつ。しかし、これらの野生コムギ集団は近年拡大する人為的環境破壊によって消失の危機にある。本研究では、集団内に眠る遺伝的多様性の持続的・発展的な利用基盤を確立するため、1)自然集団から任意抽出して作出した「疑似自然集団群」を整備することを主目的とし、これに加えて以下の目標を設定して進めてきた。2)適応形質と中立的DNA変異の両面からみた集団内および集団間の遺伝的構成の解明、3)栽培化に寄与した祖先集団の特定、4)栽培化に寄与した集団の遺伝的特徴の解明。
上記の研究計画の1)から推進するため、2018年の10月に野生4倍性コムギ(野生二粒系コムギおよび野生チモフェービ系コムギの両種を含む)について疑似自然集団群の作出を開始した。これまでの現地調査で採集しチュクロワ大学で保存中のサンプルから、トルコ南部におけるこれらの分布域のほぼ全域をカバーする5つの自然集団を選び、それぞれの集団から23-64個体(221個体)を任意抽出し、栽培を試みたが現地の天候不良により収穫に至らなかった。そこで、2019年の10月に新たに2集団を加えて7つの集団288個体を播種した。2020年の初夏に自殖種子を収穫し、2021年に次の集団を播種する計画であったが、新型コロナウイルスの世界的大流行により計画が中断していた。2023年に入ってコロナウイルスは落ち着いてきたが、同年2月にトルコ南部でM7.8の地震が発生した。共同研究先がこの地域にありその後も同地域で震度5クラスの地震が頻発しているため班員の安全上、現地への渡航が困難な状況である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

4: 遅れている

理由

本研究では、消失の危機にある栽培化起源地の野生コムギ集団に眠る遺伝的多様性を持続的・発展的に利用するため、擬似自然集団の育成とその利用・解析に取り組んでいる。
これまでに自然集団で採集し共同研究先のチュクロワ大学に保存中の採集サンプルから、現地の地理的条件なども考慮し11の野生二倍性コムギ集団と18の野生四倍性コムギの集団を選定し、まず野生4倍性コムギの疑似自然集団群を作成することとした。平成30年(2018年)の10月に、上記の集団のうち野生4倍性コムギの5集団(221個体)を選び、それぞれ23~64の小穂を任意抽出し、小穂ごとに1粒の穎果を選び識別番号をつけて個体識別を行った。これらの植物を平成30年12月にチュクロワ大学構内の実験圃場に定植した。これらを平成31年4月から5月にかけて自家受粉させ、6月にその種子を収穫する予定であったが、現地の状況が悪く収穫に至らなかった。そのため、2019年の9月(森、大田、竹中)と同年11月(森、大田)の2回にわたってトルコへ渡航し、上記の5集団に新たに2集団を加えて計7集団から288個体を任意抽出して11月に再度播種した。これらを現地で栽培し、2020年初夏に自殖種子やDNA抽出用の葉の組織を採集する予定であったが、2019年から新型コロナウイルス感染症の世界的感染の拡大と2023年2月にトルコ南部で発生したM7.8の大地震とその後も続く震度5クラスの余震により、2020年以降現在までトルコへの渡航を断念せざるを得なかった。そのため、現地における植物材料の育成と収穫、形質調査などの研究が停滞している。2019年の秋に播種した野生コムギの遺伝資源はウエブ会議による共同研究先との交渉の結果2020年の春に何とか収穫することができたが、その後の現地での作業ができず共同研究先のチュクロワ大学に保管中である。

今後の研究の推進方策

本研究では、従来のジーンバンクでは実現されてこなかった自然集団内の遺伝的多様性を反映したコムギ遺伝資源の永続的利用基盤の構築を1つの大きな柱としている。我々がこれまでにトルコ国内で実施したフィールド調査では集団内の多様性を重視し、それぞれの調査集団ごとに多くの個体を無作為に採集してきた。本研究では、これらのサンプルから集団ごとに複数の個体をランダムに抽出しそれらを単粒系統法にて自殖することにより純系統化し、自然集団の遺伝的変異を反映しつつ永続的な維持・利用が可能な「疑似自然集団群」の作成を目指してきた。
しかし、上記のように、2019年に現地で播種した7集団288個体は、2020年の初夏に現地の共同研究先の協力により収穫まで至ったが、その後の作業が進められず現地で保管されている状況である。さらに、不幸にも昨年2月にトルコ南部を震源とする大地震が発生した。この震災の被災地域には本研究の共同研究先であるアダナが含まれており、現在も現地での安全が確保できておらず渡航が困難な状況が続いている。2024年度は、もしもトルコへの渡航が再開できれば2020年に収穫された穂サンプルの保存状況の確認を行い、利用可能であれば形質調査と脱穀を行って疑似自然集団の系統としての保存を開始する。また、これまで蓄積してきた自然集団での採集サンプルの現地での保存状況を確認し、将来の利用再開に向けてチュクロワ大学における保存環境を整える。
本研究では、コムギ遺伝資源の調査と保全を担う次世代の研究者の養成も目標としている。そのため、現地の状況が好転しない場合はトルコ以外の地域における野生コムギの現地調査の実施も視野に入れつつ臨機応変に対応しながら進める。

次年度使用額が生じた理由

2023年度に入り新型コロナウイルスの世界的感染の状況が好転しトルコへの渡航再開が期待されたが、同年2月にトルコ南部で発生したM7.8の大震災によって共同研究先のアダナも被災しており渡航の安全が確保できていないため。今後の状況を注視し、もしも可能であればトルコへの渡航を実施する。しかし、現地の状況によっては、野生コムギの調査地をトルコ以外の地域に設定することも検討する。このための旅費および現地における植物の育成・収穫資材の購入費や調査作業補助のための謝金に使用する予定である。また一方で、本邦で可能な解析なども視野に入れて研究を計画・遂行する。

  • 研究成果

    (19件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (13件)

  • [国際共同研究] チュクロワ大学農学部(トルコ)

    • 国名
      トルコ
    • 外国機関名
      チュクロワ大学農学部
  • [国際共同研究] National Academy of Sciences of Armenia(アルメニア)

    • 国名
      アルメニア
    • 外国機関名
      National Academy of Sciences of Armenia
  • [雑誌論文] Evolution of wheat blast resistance gene Rmg8 accompanied by differentiation of variants recognizing the powdery mildew fungus2024

    • 著者名/発表者名
      Asuke, S., K. Morita, M. Shimizu, F. Abe, R. Terauchi, C. Nago, Y. Takahashi, M. Shibata, M. Yoshioka, M. Iwakawa, M. Kishi-Kaboshi, Z. Su, S. Nasuda, H. Handa, M. Fujita, M. Tougou, K. Hatta, N. Mori, Y. Matsuoka, K. Kato, and Y. Tosa
    • 雑誌名

      Nature Plants

      巻: Accepted ページ: -

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Testing the genetic autonomy of the plasmon in the Triticum-Aegilops complex: The final work of Prof. Koichiro Tsunewaki2023

    • 著者名/発表者名
      Naoki Mori
    • 雑誌名

      CYTOLOGIA

      巻: 88 ページ: 177-181

    • DOI

      10.1508/cytologia.88.177

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] イラノ=アナトリアン植生帯における農耕以前の食糧ータンゲ・シカン遺跡(イラン南部、後期旧石器時代)におけるピスタチオ属、アーモンド属、エノキ属植物の木の実の出土 ー2023

    • 著者名/発表者名
      丹野研一
    • 雑誌名

      西アジア考古学

      巻: 24 ページ: 15-26

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive gene expression analysis of submergence stress response in nucleus-cytoplasm hybrid wheat2023

    • 著者名/発表者名
      Takenaka Shotaro, Furumoto Tsuyoshi, Nakamura Chiharu
    • 雑誌名

      CYTOLOGIA

      巻: 88 ページ: 209-216

    • DOI

      10.1508/cytologia.88.209

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 多様な変わりイネの遺伝的多様性解析2024

    • 著者名/発表者名
      竹中 祥太朗,妹尾 拓司,岡田 風吹,高谷 万理,長岡 楓,猪谷 富雄
    • 学会等名
      日本育種学会第145回講演会 2024年3月
  • [学会発表] 核細胞質置換コムギにおける新規雄性不稔遺伝子の探索2024

    • 著者名/発表者名
      辻村 真衣, 宮本 大輝, 竹中 祥太朗, 森 直樹, 寺地 徹
    • 学会等名
      日本育種学会第145回講演会 2024年3月
  • [学会発表] NBRP・コムギ事業:大規模交配集団の整備2024

    • 著者名/発表者名
      太田 敦士,新田 みゆき,那須田 周平,吉田 健太郎,堺 俊之,竹中 祥太朗,松岡 由浩,森 直樹,西嶋 遼,寺内 良平
    • 学会等名
      第145回日本育種学会 2024年3月
  • [学会発表] 戻し交雑自殖系統群を用いたエンマーコムギの穂と草型の栽培化関連形質の遺伝学的解析2023

    • 著者名/発表者名
      森岡 美羽, 粕淵 星也, 島田 沙織, 牛 恒一, Vladutu Cristian, Kianian Shahryar, 森 直樹
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会 2023年9月
  • [学会発表] 野生エンマーコムギ系統群から見出された特異的早生系統 KU-195 の開花関連QTL2023

    • 著者名/発表者名
      Chang Yunhsuan, 西村 和紗, 角坂 麻衣, 陳 甜甜, 岩橋 優, 元木 航, 長坂 京香, 村田 和樹, 牧 隆宏, 木下 有羽, 中野 龍平, 井上 博茂, 川浦 香奈子, 森 直樹, 中﨑 鉄也
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会 2023年9月
  • [学会発表] コムギNAM集団の茎立ち期におけるUAVによるハイスループットフェノタイピングおよびUAVから得られた形質と収量関連形質との関連2023

    • 著者名/発表者名
      吉岡 俊輔, 黒木 健, 新田 みゆき, 聶 紀魯, 石井 昌範, 角井 宏行, 岡田 萌子, 竹中 祥太朗, 清水 健太郎, 岩田 洋佳, 郭 威, 那須田 周平
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会 2023年9月
  • [学会発表] 野生エンマーコムギのミトコンドリアゲノムの多様性評価と母系の解明2023

    • 著者名/発表者名
      秋山 ひとみ, 静 貴子, H. Ozkan, 大田 正次, 石井 尊生, 森 直樹
    • 学会等名
      第18回ムギ類研究会 2023年12月
  • [学会発表] エンマーコムギの穂と草型の栽培化関連形質の遺伝学的解析2023

    • 著者名/発表者名
      森岡 美羽, 粕淵 星也, 島田 沙織, 牛 恒一, Vladutu Cristian, Kianian Shahryar, 森 直樹
    • 学会等名
      第18回ムギ類研究会 2023年12月
  • [学会発表] 細胞質置換コムギのミトコンドリアDNAにみられる分子内組換えの定量的解析2023

    • 著者名/発表者名
      中川 うてな, 鎌田 知希, 太田 星史, 牧田 真之, 辻村 真衣, 寺地 徹, 森 直樹
    • 学会等名
      第18回ムギ類研究会 2023年12月
  • [学会発表] 野生エンマーコムギの穎果サイズと休眠性に関与するQTLの遺伝学的研究2023

    • 著者名/発表者名
      中村 陽, 坂井 椰朱子, 森 直樹, 大田 正次
    • 学会等名
      第18回ムギ類研究会 2023年12月
  • [学会発表] 葉緑体ゲノムからみたコムギの近縁野生種Aegilops geniculataの種内多様性2023

    • 著者名/発表者名
      李 逢晏, 吉村 優介, 森 直樹, 寺地 徹, 大田 正次
    • 学会等名
      第18回ムギ類研究会 2023年12月
  • [学会発表] 野生エンマーコムギ系統KU-195とデュラムコムギLDNのF2から見出された超晩生形質を発現する潜性の補足遺伝子2023

    • 著者名/発表者名
      張 芸, 西村 和紗, 角坂 麻衣, 陳 甜甜, 村田 和樹, 岩橋 優, 元木 航, 長坂 京香, 牧 隆宏, 木下 有羽, 中野 龍平, 井上 博茂, 川浦 香奈子, 森 直樹, 中﨑 鉄也
    • 学会等名
      第18回ムギ類研究会 2023年12月
  • [学会発表] NBRP・コムギ事業:大規模交配集団の整備2023

    • 著者名/発表者名
      太田 敦士, 新田 みゆき, 那須田 周平, 吉田 健太郎, 堺 俊之, 竹中 祥太朗, 松岡 由浩, 森 直樹, 西嶋 遼, 寺内 良平
    • 学会等名
      第18回ムギ類研究会 2023年12月

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公開日: 2024-12-25  

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