| 研究課題/領域番号 |
18KK0176
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| 研究機関 | 九州工業大学 |
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研究代表者 |
花田 耕介 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 准教授 (50462718)
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| 研究分担者 |
平 順一 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 助教 (20549612)
白井 一正 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 特任助教 (90816654)
近藤 隆之 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 博士研究員 (90826174)
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| 研究期間 (年度) |
2018-10-09 – 2022-03-31
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| キーワード | ペプチド / バナナ / フザリウム |
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| 研究実績の概要 |
申請者は、モデル生物であるシロイヌナズナおよびトマトで、ペプチド性遺伝子（<100aa）にコードされる細胞外分泌ペプチドの中で、数十個の新規の抗菌性ペプチドを見出すことに成功している。このような抗菌性ペプチドの探索手法の確立は、より重要な作物においても切望されている。特に、世界での生産量が1億トンを超える唯一の果物であるバナナは、次々と異なる遺伝子型を示すフザリウムと呼ばれる糸状菌の感染を受け、世界中で問題となっている。本研究では、マレーシアに存在する多数品種を持つグループと連携することで、フザリウムに耐性を持つ品種を探し出し、その品種のトランスクリプトームおよびプロテオーム解析で、耐性に関わると考えられるペプチド候補を探索することを目指す。
当該年度は、分担者の近藤がマレーシアの共同研究者グループ（Harikrishna博士、Teo博士、マラヤ大学）に数週間滞在し、フザリウムの感染後に、バナナの導管液を採取し、プロテオーム解析およびトランスクリプトーム解析を行う方法を検討した。その結果、トランスクリプトームのサンプリングを行うためのRNA抽出方法を現地の博士研究員に伝達し、感染後、2時間、12時間、1日、3日、一週間の条件でのトランスクリプトームのサンプリングを行った。同じタイミングでのおよびプロテオーム用のサンプリングを行う準備はできて、サンプリング間近であったが、コロナウイルスによって研究が遮断され、サンプリングはできなくなった。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
感染実験を行おうとしたが、フザリウム耐性のバナナの成長が遅いうえに育ちが悪く感染実験が数カ月遅れた。さらに、感染実験には成功したが、コロナウイルスのため、マラヤ大学に入れなくなりプロテオーム用のサンプリングができなかった。
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| 今後の研究の推進方策 |
プロテオームのサンプリングは時間がかかるので、トランスクリプトームのデータで抗菌ペプチドを絞って実験を行う予定でいる。
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